Diagnostic potential of small non-coding RNAs in pipelle biopsy material of eutopic endometrium

Fedosova D.V.; Aleksandrova M.S.; Garanin A.Yu.; Zabegina L.M.; Kruglov S.Y.; Katsuba K.E.; Shalaev A.V.; Lokteva P.A.; Polkovnikova I.A.; Apalko S.V.; Scherbak S.G.; Bezhenar V.F.; Malek A.V.

doi:https://doi.org/10.17116/repro20263201192

Д. В. Федосова

ФГБОУ ВО «Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет имени академика И.П. Павлова» Минздрава России

ORCID: 0000-0003-1030-6110

М. С. Александрова

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии имени Н.Н. Петрова» Минздрава России

ORCID: 0000-0002-2079-5061

А. Ю. Гаранин

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии имени Н.Н. Петрова» Минздрава России

ORCID: 0000-0002-8313-3794

Л. М. Забегина

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии имени Н.Н. Петрова» Минздрава России

ORCID: 0000-0003-0827-1641

С. Ю. Круглов

ORCID: 0000-0001-7399-3398

К. Е. Кацуба

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии имени Н.Н. Петрова» Минздрава России

ORCID: 0000-0002-7373-5206

А. В. Шалаев

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии имени Н.Н. Петрова» Минздрава России

ORCID: 0000-0002-6148-6994

П. А. Локтева

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии имени Н.Н. Петрова» Минздрава России

ORCID: 0009-0001-8720-5062

И. А. Полковникова

СПб ГБУЗ «Городская больница №40 Курортного района»

ORCID: 0000-0002-9178-8512

С. В. Апалько

СПб ГБУЗ «Городская больница №40 Курортного района»

ORCID: 0000-0002-3853-4185

С. Г. Щербак

СПб ГБУЗ «Городская больница №40 Курортного района»

ORCID: 0000-0001-5047-2792

В. Ф. Беженарь

ORCID: 0000-0002-7807-4929

А. В. Малек

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии имени Н.Н. Петрова» Минздрава России;
ООО «Альгимед Техно»

ORCID: 0000-0001-5334-7292

Диагностический потенциал малых некодирующих РНК в материале пайпель-биопсии при эндометриозе

Авторы:

Федосова Д.В., Александрова М.С., Гаранин А.Ю., Забегина Л.М., Круглов С.Ю., Кацуба К.Е., Шалаев А.В., Локтева П.А., Полковникова И.А., Апалько С.В., Щербак С.Г., Беженарь В.Ф., Малек А.В.

Подробнее об авторах

Журнал: Проблемы репродукции. 2026;32(1): 92‑102

DOI: 10.17116/repro20263201192

Прочитано: 438 раз

Связаться с автором

Оглавление

Как цитировать:

Федосова Д.В., Александрова М.С., Гаранин А.Ю. и др. Диагностический потенциал малых некодирующих РНК в материале пайпель-биопсии при эндометриозе. Проблемы репродукции. 2026;32(1):92‑102.
Fedosova DV, Aleksandrova MS, Garanin AYu, et al. Diagnostic potential of small non-coding RNAs in pipelle biopsy material of eutopic endometrium. Russian Journal of Human Reproduction. 2026;32(1):92‑102. (In Russ.)
https://doi.org/10.17116/repro20263201192

Подписка 2026 Проблемы репродукции (Russian Journal of Human Reproduction)

Использование инфографики авторами научных работ

Рекомендуем статьи по данной теме:

Роль поляризации макрофагов в развитии эндометриоза и терапевтический потенциал ее модуляции. Проблемы репродукции. 2025;(3):20-33

Диагностика патологических и адаптационных изменений баланса при болезни Паркинсона для выбора программы реабилитации. Журнал неврологии и психиатрии им. С.С. Корсакова. 2025;(4):88-94

Экспрессия микроРНК-21, микроРНК-125a, микроРНК-125b, микроРНК-214 в плазме крови у больных ишемической болезнью сердца. Кардиологический вестник. 2025;(2):13-19

Когнитивные нарушения у пациентов с рассеянным склерозом. Журнал неврологии и психиатрии им. С.С. Корсакова. Спецвыпуски. 2025;(4-2):67-73

Послеоперационный перитонит. Эпидемиология, диагностика, оперативное лечение и его прогноз. Хирургия. Журнал им. Н.И. Пирогова. 2025;(6):104-111

Сравнительный анализ методов диагностики ночного апноэ. Российская ринология. 2025;(2):137-142

Диагностика и лечение рака яичников на фоне беременности. Российский вестник акушера-гинеколога. 2025;(3):27-33

Дисморфизм крестца у пациентов травматолого-ортопедического профиля. Оперативная хирургия и клиническая анатомия (Пироговский научный журнал). 2025;(2):30-37

Бактериальный вагиноз: современные представления. Клиническая дерматология и венерология. 2025;(3):261-268

Способ фотодинамического воздействия при хирургическом лечении местного отграниченного перитонита в эксперименте. Оперативная хирургия и клиническая анатомия (Пироговский научный журнал). 2025;(2-2):77-86

Резюме / Abstract:

Несмотря на высокую распространенность эндометриоза и социальную значимость проблемы ассоциированного с эндометриозом бесплодия, молекулярные маркеры этого заболевания неизвестны. Гетерогенная группа коротких регуляторных РНК представляет собой класс перспективных биомаркеров, анализ экспрессии которых в материале эутопического эндометрия мог бы стать основой инновационной диагностической технологии.

ЦЕЛЬ ИССЛЕДОВАНИЯ

Провести сравнительный анализ экспрессии известных классов малых регуляторных РНК в материале эутопического эндометрия пациенток и здоровых женщин.

МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ

Исследование проведено с помощью «глубокого» секвенирования, полученные результаты верифицированы с помощью микрочиповой полимеразной цепной реакции — технологии, оптимальной для создания новых диагностических решений на следующих этапах работы. Объекты исследования — образцы эутопического эндометрия пациенток с наружным генитальным эндометриозом (n=45) и здоровых женщин (n=24).

РЕЗУЛЬТАТЫ

Идентифицированы потенциально маркерные молекулы из классов микроРНК (microRNA), пи-РНК (piwi-RNA), малых ядрышковых (snoRNA) и малых ядерных (snRNA) РНК. Верифицирована разница экспрессионной активности ряда микроРНК (miR-143-3p, -320a-3p, -4488, -let-7b-5p, -451a, -16-5p) в эутопическом эндометрии пациенток с эндометриозом и здоровых женщин. Отмечен высокий диагностический потенциал показателя соотношения концентрации некоторых молекул микроРНК, формирующих «реципрокные пары», например miR-12136/-320a (AUC=0,89).

ВЫВОДЫ

Анализ коротких регуляторных РНК в материале эутопического эндометрия является перспективной технологией малоинвазивной диагностики заболевания на основе полимеразной цепной реакции.

Ключевые слова / Keywords:

эндометриоз

микроРНК

диагностика

полимеразная цепная реакция

ПЦР

эутопический эндометрий

Авторы / Authors:

Д. В. Федосова

ORCID: 0000-0003-1030-6110

М. С. Александрова

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии имени Н.Н. Петрова» Минздрава России

ORCID: 0000-0002-2079-5061

А. Ю. Гаранин

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии имени Н.Н. Петрова» Минздрава России

ORCID: 0000-0002-8313-3794

Л. М. Забегина

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии имени Н.Н. Петрова» Минздрава России

ORCID: 0000-0003-0827-1641

С. Ю. Круглов

ORCID: 0000-0001-7399-3398

К. Е. Кацуба

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии имени Н.Н. Петрова» Минздрава России

ORCID: 0000-0002-7373-5206

А. В. Шалаев

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии имени Н.Н. Петрова» Минздрава России

ORCID: 0000-0002-6148-6994

П. А. Локтева

ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии имени Н.Н. Петрова» Минздрава России

ORCID: 0009-0001-8720-5062

И. А. Полковникова

СПб ГБУЗ «Городская больница №40 Курортного района»

ORCID: 0000-0002-9178-8512

С. В. Апалько

СПб ГБУЗ «Городская больница №40 Курортного района»

ORCID: 0000-0002-3853-4185

С. Г. Щербак

СПб ГБУЗ «Городская больница №40 Курортного района»

ORCID: 0000-0001-5047-2792

В. Ф. Беженарь

ORCID: 0000-0002-7807-4929

А. В. Малек

ORCID: 0000-0001-5334-7292

Дата поступления:

03.12.2024

Дата принятия в печать:

18.03.2025

Закрыть метаданные

Литература / References:

Arafah M, Rashid S, Akhtar M. Endometriosis: A Comprehensive Review. Advances in Anatomic Pathology. 2021;28:30-43. https://doi.org/10.1097/PAP.0000000000000288
Малышева О.В., Ярмолинская М.И. Генетические детерминанты аденомиоза. Акушерство и гинекология. 2023;4:20-27. https://doi.org/10.18565/aig.2023.52
Artymuk N, Zotova O, Gulyaeva L. Adenomyosis: genetics of estrogen metabolism. Hormone Molecular Biology and Clinical Investigation. 2019 Mar 15;37(2). https://doi.org/10.1515/hmbci-2018-0069
Burney RO, Giudice LC. Pathogenesis and pathophysiology of endometriosis. Fertility and Sterility. 2012;98:511-519. https://doi.org/10.1016/j.fertnstert.2012.06.029
Abramiuk M, Grywalska E, Małkowska P, Sierawska O, Hrynkiewicz R, Niedźwiedzka-Rystwej P. The Role of the Immune System in the Development of Endometriosis. Cells. 2022;11:2028. https://doi.org/10.3390/cells11132028
Goławski K, Soczewica R, Kacperczyk-Bartnik J, Mańka G, Kiecka M, Lipa M, Warzecha D, Spaczyński R, Piekarski P, Banaszewska B, Jakimiuk A, Issat T, Rokita W, Młodawski J, Szubert M, Sieroszewski P, Raba G, Szczupak K, Kluz T, Kluza M, Wielgoś M, Koc-Żórawska E, Żórawski M, Laudański P. The Role of Cadherin 12 (CDH12) in the Peritoneal Fluid among Patients with Endometriosis and Endometriosis-Related Infertility. International Journal of Environmental Research and Public Health. 2022;19:11586. https://doi.org/10.3390/ijerph191811586
Bo C, Wang Y. Angiogenesis signaling in endometriosis: Molecules, diagnosis and treatment (Review). Molecular Medicine Reports. 2024;29:43. https://doi.org/10.3892/mmr.2024.13167
Albertsen HM, Ward K. Genes Linked to Endometriosis by GWAS Are Integral to Cytoskeleton Regulation and Suggests That Mesothelial Barrier Homeostasis Is a Factor in the Pathogenesis of Endometriosis. Reproductive Sciences. 2017;24:803-811. https://doi.org/10.1177/1933719116660847
Muraoka A, Yokoi A, Kajiyama H. Emerging bacterial factors for understanding pathogenesis of endometriosis. iScience. 2024;27:108739. https://doi.org/10.1016/j.isci.2023.108739
Эндометриоз. Клинические рекомендации. 2024. Одобрено Научно-практическим Советом Министерства здравоохранения Российской Федерации. Ссылка активна на 10.01.26. https://cr.minzdrav.gov.ru/view-cr/259_2
Becker CM, Bokor A, Heikinheimo O, Horne A, Jansen F, Kiesel L, King K, Kvaskoff M, Nap A, Petersen K, Saridogan E, Tomassetti C, van Hanegem N, Vulliemoz N, Vermeulen N; ESHRE Endometriosis Guideline Group. ESHRE guideline: endometriosis. Human Reproduction Open. 2022;2022(2):hoac009. https://doi.org/10.1093/hropen/hoac009
Endometriosis: diagnosis and management (NG73). National Institute for Health and Care Excellence. 2024. Accessed January 02, 2025. https://www.nice.org.uk/guidance/ng73
Kalaitzopoulos DR, Samartzis N, Kolovos GN, Mareti E, Samartzis EP, Eberhard M, Dinas K, Daniilidis A. Treatment of endometriosis: a review with comparison of 8 guidelines. BMC Womens. Health. 2021;21:397. https://doi.org/10.1186/s12905-021-01545-5
Сухих Г.Т., Серов В.Н., Адамян Л.В., Баранов И.И., Беженарь В.Ф., Габидуллина Р.И., Дубровина С.О., Козаченко А.В., Подзолкова Н.М., Сметник А.А., Тапильская Н.И., Уварова Е.В., Ших Е.В., Ярмолинская М.И. Алгоритмы ведения пациенток с эндометриозом: согласованная позиция экспертов Российского общества акушеров-гинекологов. Акушерство и гинекология. 2023;5:159-176. https://doi.org/10.18565/aig.2023.132
Encalada Soto D, Rassier S, Green IC, Burnett T, Khan Z, Cope A. Endometriosis biomarkers of the disease: an update. Current Opinion in Obstetrics and Gynecology. 2022;34:210-219. https://doi.org/10.1097/GCO.0000000000000798
Samare-Najaf M, Razavinasab SA, Samareh A, Jamali N. Omics-based novel strategies in the diagnosis of endometriosis. Critical Reviews in Clinical Laboratory Sciences. 2024;61:205-225. https://doi.org/10.1080/10408363.2023.2270736
Forero DA, González-Giraldo Y, Castro-Vega LJ, Barreto GE. qPCR-Based Methods for Expression Analysis of miRNAs. BioTechniques. 2019;67(4):192-199. https://doi.org/10.2144/btn-2019-0065
Маржевская В.В., Присяжная Т.С., Жамойдик В.И., Берлев И.В., Малек А.В. Молекулярно-генетические основы эндометриоза: диагностический потенциал наследуемых и экспрессируемых факторов. Журнал акушерства и женских болезней. 2018;67(3):64-73. https://doi.org/10.17816/JOWD67364-73
Borisov E, Knyazeva M, Novak V, Zabegina L, Prisyazhnaya T, Karizkiy A, Berlev I, Malek A. Analysis of Reciprocally Dysregulated miRNAs in Eutopic Endometrium Is a Promising Approach for Low Invasive Diagnostics of Adenomyosis. Diagnostics. 2020; 10(10):782. https://doi.org/10.3390/diagnostics10100782
Межлумова Н.А., Гамисония А.М., Эльдаров Ч.М., Мамедов И.З., Филиппова Е.С., Бобров М.Ю., Адамян Л.В. Экспрессия PIWI-ассоциированных РНК в тканях эндометриоидных кист яичника. Проблемы репродукции. 2020;26:62-67. https://doi.org/10.17116/repro20202603161
Yan W, Hu H, Tang B. Progress in understanding the relationship between long noncoding RNA and endometriosis. European Journal of Obstetrics, Gynecology, and Reproductive Biology. 2020;5:100067. https://doi.org/10.1016/j.eurox.2019.100067
Wingett SW, Andrews S. FastQ Screen: A tool for multi-genome mapping and quality control. F1000Research. 2018;7:1338. https://doi.org/10.12688/f1000research.15931.2
Fehlmann T, Kern F, Laham O, Backes C, Solomon J, Hirsch P, Volz C, Müller R, Keller A. miRMaster 2.0: multi-species non-coding RNA sequencing analyses at scale. Nucleic Acids Research. 2021;49:397-408. https://doi.org/10.1093/nar/gkab268
Kozomara A, Griffiths-Jones S. miRBase: annotating high confidence microRNAs using deep sequencing data. Nucleic Acids Research. 2014;42:68-73. https://doi.org/10.1093/nar/gkt1181
Kozomara A, Birgaoanu M, Griffiths-Jones S. miRBase: from microRNA sequences to function. Nucleic Acids Research. 2019;47: 155-162. https://doi.org/10.1093/nar/gky1141
Yates AD, Achuthan P, Akanni W, Allen J, Allen J, Alvarez-Jarreta J, Amode MR, Armean IM, Azov AG, Bennett R, Bhai J, Billis K, Boddu S, Marugán JC, Cummins C, Davidson C, Dodiya K, Fatima R, Gall A, Giron CG, Gil L, Grego T, Haggerty L, Haskell E, Hourlier T, Izuogu OG, Janacek SH, Juettemann T, Kay M, Lavidas I, Le T, Lemos D, Martinez JG, Maurel T, McDowall M, McMahon A, Mohanan S, Moore B, Nuhn M, Oheh DN, Parker A, Parton A, Patricio M, Sakthivel MP, Abdul Salam AI, Schmitt BM, Schuilenburg H, Sheppard D, Sycheva M, Szuba M, Taylor K, Thormann A, Threadgold G, Vullo A, Walts B, Winterbottom A, Zadissa A, Chakiachvili M, Flint B, Frankish A, Hunt SE, IIsley G, Kostadima M, Langridge N, Loveland JE, Martin FJ, Morales J, Mudge JM, Muffato M, Perry E, Ruffier M, Trevanion SJ, Cunningham F, Howe KL, Zerbino DR, Flicek P. Ensembl 2020. Nucleic Acids Research. 2020;8:48(D1):D682-D688. https://doi.org/10.1093/nar/gkz966
RNAcentral Consortium (2021). RNAcentral 2021: secondary structure integration, improved sequence search and new member databases. Nucleic Acids Research. 2021;49:212-D220. https://doi.org/10.1093/nar/gkaa921
Thornlow BP, Armstrong J, Holmes AD, Howard JM, Corbett-Detig RB, Lowe TM. Predicting transfer RNA gene activity from sequence and genome context. Genome Research. 2020;30:85-94. https://doi.org/10.1101/gr.256164.119
Zhao Y, Li H, Fang S, Kang Y, Wu W, Hao Y, Li Z, Bu D, Sun N, Zhang MQ, Chen R. NONCODE 2016: an informative and valuable data source of long non-coding RNAs. Nucleic Acids Research. 2016;44:203-208. https://doi.org/10.1093/nar/gkv1252
Glažar P, Papavasileiou P, Rajewsky N. circBase: a database for circular RNAs. RNA. 2014;20:1666-1670. https://doi.org/10.1261/rna.043687.113
Andersen CL, Jensen JL, Ørntoft TF. Normalization of Real-Time Quantitative Reverse Transcription-PCR Data: A Model-Based Variance Estimation Approach to Identify Genes Suited for Normalization, Applied to Bladder and Colon Cancer Data Sets. Cancer Research. 2004;64:5245-5250. https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-04-0496
Князева М.С., Забегина Л.М., Конева О.М., Лютынский В.В., Смирнова О.А., Жамойдик В.И., Куприна И.Д., Козорезова Е.С., Воробьев С.Л., Якубо Е.Л. Оценка степени тяжести цервикальной дисплазии путем анализа микроРНК в материале цервикального мазка. Онкогинекология. 2022;3:57-68. https://doi.org/10.52313/22278710_2022_3_57
Kniazeva M, Zabegina L, Shalaev A, Smirnova O, Lavrinovich O, Berlev I, Malek A. NOVAprep-miR-Cervix: New Method for Evaluation of Cervical Dysplasia Severity Based on Analysis of Six miRNAs. International Journal of Molecular Sciences. 2023;24:9114. https://doi.org/10.3390/ijms24119114
Knyazeva M, Korobkina E, Karizky A, Sorokin M, Buzdin A, Vorobyev S, Malek A. Reciprocal Dysregulation of MiR-146b and MiR-451 Contributes in Malignant Phenotype of Follicular Thyroid Tumor. International Journal of Molecular Sciences. 2020;21:5950. https://doi.org/10.3390/ijms21175950
Князева М.С., Шестопалова Т.М., Забегина Л.М., Шалаев А.В., Ратникова А.К., Кащенко В.А., Воробьев С.Л., Малек А.В. Возможность дифференциальной диагностики очаговых образований поджелудочной железы путем анализа микроРНК. Южно-Российский онкологический журнал. 2023;4:20-35. https://doi.org/10.37748/2686-9039-2023-4-3-3
Bendifallah S, Suisse S, Puchar A, Delbos L, Poilblanc M, Descamps P, Golfier F, Jornea L, Bouteiller D, Touboul C, Dabi Y, Daraï E. Salivary MicroRNA Signature for Diagnosis of Endometriosis. Journal of Clinical Medicine. 2022;26;11(3):612. https://doi.org/10.3390/jcm11030612
Yang X, Tao Y, Jin O, Lai J, Yang X. MiR-17-5p promoter methylation regulated by DNA methyltransferase 3 beta (DNMT3B) expedites endometriosis via the Krüppel-like factor 12 (KLF12)/Wnt/β-catenin axis. Journal of Reproductive Immunology. 2023;158:103974. https://doi.org/10.1016/j.jri.2023.103974