Кулакова О.Г.

Кафедра неврологии и нейрохирургии и кафедра молекулярной биологии и биотехнологии Российского национального исследовательского медицинского университета им. Н.И. Пирогова, Москва

Башинская В.В.

ГБОУ ВПО «Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова» Минздрава РФ, Москва

Царева Е.Ю.

Кафедра неврологии и нейрохирургии и кафедра молекулярной биологии и биотехнологии Российского национального исследовательского медицинского университета им. Н.И. Пирогова, Москва

Бойко А.Н.

КГБУЗ "Красноярский краевой Центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями"

Фаворова О.О.

Кафедра неврологии и нейрохирургии и кафедра молекулярной биологии и биотехнологии Российского национального исследовательского медицинского университета им. Н.И. Пирогова, Москва

Гусев Е.И.

Кафедра неврологии и нейрохирургии Российского государственного медицинского университета, Москва

Анализ ассоциации полиморфизма генов, кодирующих рецепторы цитокинов, с клиническими характеристиками рассеянного склероза

Авторы:

Кулакова О.Г., Башинская В.В., Царева Е.Ю., Бойко А.Н., Фаворова О.О., Гусев Е.И.

Подробнее об авторах

Просмотров: 1212

Загрузок: 17


Как цитировать:

Кулакова О.Г., Башинская В.В., Царева Е.Ю., Бойко А.Н., Фаворова О.О., Гусев Е.И. Анализ ассоциации полиморфизма генов, кодирующих рецепторы цитокинов, с клиническими характеристиками рассеянного склероза. Журнал неврологии и психиатрии им. С.С. Корсакова. Спецвыпуски. 2016;116(10‑2):10‑15.
Kulakova OG, Bashinskaja VV, Tsareva EIu, Boĭko AN, Favorova OO, Gusev EI. Association analysis of cytokine receptors’ genes polymorphisms with clinical features of multiple sclerosis. S.S. Korsakov Journal of Neurology and Psychiatry. 2016;116(10‑2):10‑15. (In Russ.)
https://doi.org/10.17116/jnevro201611610210-15

Рекомендуем статьи по данной теме:
Биобан­ки­ро­ва­ние в кли­ни­чес­ких ис­сле­до­ва­ни­ях с учас­ти­ем па­ци­ен­тов с рас­се­ян­ным скле­ро­зом. Жур­нал нев­ро­ло­гии и пси­хи­ат­рии им. С.С. Кор­са­ко­ва. Спец­вы­пус­ки. 2024;(7-2):7-15
Эф­фек­тив­ность и бе­зо­пас­ность двух­лет­ней те­ра­пии ди­во­зи­ли­ма­бом у па­ци­ен­тов с рас­се­ян­ным скле­ро­зом в рам­ках ран­до­ми­зи­ро­ван­но­го двой­но­го сле­по­го пла­це­бо-кон­тро­ли­ру­емо­го кли­ни­чес­ко­го ис­сле­до­ва­ния BCD-132-4/MIRANTIBUS. Жур­нал нев­ро­ло­гии и пси­хи­ат­рии им. С.С. Кор­са­ко­ва. 2024;(4):86-96
Кли­ни­чес­кий слу­чай COVID-ас­со­ци­иро­ван­ной эн­це­фа­ло­па­тии у па­ци­ен­та с рас­се­ян­ным скле­ро­зом. Жур­нал нев­ро­ло­гии и пси­хи­ат­рии им. С.С. Кор­са­ко­ва. 2024;(4):159-163
Оп­ти­чес­кая ко­ге­рен­тная то­мог­ра­фия-ан­ги­ог­ра­фия в ди­аг­нос­ти­ке рас­се­ян­но­го скле­ро­за. Вес­тник оф­таль­мо­ло­гии. 2024;(2):63-70
Роль ген­но­го по­ли­мор­физ­ма в на­ру­ше­ни­ях сис­те­мы ге­мос­та­за у па­ци­ен­тов дет­ско­го воз­рас­та, под­вер­гших­ся кар­ди­охи­рур­ги­чес­ким вме­ша­тельствам. Анес­те­зи­оло­гия и ре­ани­ма­то­ло­гия. 2024;(3):43-48
Роль це­реб­ро­вас­ку­ляр­ных за­бо­ле­ва­ний в прог­рес­си­ро­ва­нии рас­се­ян­но­го скле­ро­за. Жур­нал нев­ро­ло­гии и пси­хи­ат­рии им. С.С. Кор­са­ко­ва. 2024;(5):53-57
Оп­ти­чес­кая ко­ге­рен­тная то­мог­ра­фия в ди­аг­нос­ти­ке рас­се­ян­но­го скле­ро­за. Вес­тник оф­таль­мо­ло­гии. 2024;(3):59-68
Оп­рос­ни­ки для оцен­ки фун­кции ру­ки у па­ци­ен­тов с рас­се­ян­ным скле­ро­зом. Жур­нал нев­ро­ло­гии и пси­хи­ат­рии им. С.С. Кор­са­ко­ва. 2024;(6):36-42
Осо­бен­нос­ти пер­вич­ных форм го­лов­ной бо­ли при рас­се­ян­ном скле­ро­зе. Жур­нал нев­ро­ло­гии и пси­хи­ат­рии им. С.С. Кор­са­ко­ва. 2024;(6):70-73
Ней­ро­фи­ла­мент лег­ких це­пей: ди­аг­нос­ти­чес­кие воз­мож­нос­ти при рас­се­ян­ном скле­ро­зе. Жур­нал нев­ро­ло­гии и пси­хи­ат­рии им. С.С. Кор­са­ко­ва. 2024;(6):115-119

Введение

Одной из важных характеристик рассеянного склероза (РС), тяжелого хронического заболевания ЦНС, характеризующегося аутоиммунным воспалением, нейродегенерацией и прогрессирующей неврологической дисфункцией [1], является его клиническая гетерогенность. Даже в пределах наиболее часто встречающейся ремиттирующей формы РС у пациентов варьируют клинические признаки, включая симптомы дебюта, тяжесть течения, длительность ремиссий и др. Такая гетерогенность не дает возможности однозначно прогнозировать темп развития заболевания и скорость инвалидизации [2], что вызывает трудности в разработке соответствующих терапевтических подходов.

Высказывались предположения [3, 4], что в основе клинической гетерогенности РС может лежать гетерогенность генетическая. Конкордантность в семьях по ряду клинических фенотипов, вариабельность клинического течения РС в разных этнических группах указывают на то, что генетический полиморфизм может влиять на клиническую картину РС [4]. В свою очередь некоторые клинические характеристики РС, такие как симптомы, отражающие начало болезни, длительность ремиссий, частота и тяжесть обострений, возраст пациента в период дебюта заболевания, могут использоваться для предсказания тяжести дальнейшего течения заболевания [5].

Генетические исследования, проведенные с помощью полногеномного поиска ассоциаций (genome-wide association study — GWAS) с клиническим течением РС [6, 7], не дали совпадающих результатов, что делает актуальным поиск генетических вариантов, ассоциированных с клиническими фенотипами РС, с использованием генов-кандидатов. При этом особый интерес представляет анализ возможного участия генов, связанных с предрасположенностью к РС и модификацией его клинического течения [8, 9]. К числу таких генов относятся IL7RA, IL2RA и TNFRSF1A, кодирующие рецепторы цитокинов. Эти рецепторы являются важнейшими участниками сигнальных путей интерлейкина (ИЛ)-7, ИЛ-2 и фактора некроза опухолей (ФНО) и во многом определяют развитие и функционирование клеток иммунной системы. Ассоциация полиморфных вариантов этих генов с предрасположенностью к РС была выявлена в одном из обзоров GWAS [10] и подтверждена в нескольких популяциях [8, 9, 11]. В ряде исследований [8, 9, 12] была обнаружена ассоциация полиморфных вариантов генов, кодирующих рецепторы цитокинов, не только с риском РС, но и с рядом его клинических характеристик. Однако полученные результаты не могут быть однозначно перенесены на другие этносы и предполагают проведение специальных исследований.

Цель настоящей работы — проведение анализа ассоциации полиморфизма генов IL7RA (rs6897932), IL2RA (rs2104286) и TNFRSF1A (rs1800693) с тяжестью течения РС, а также с двумя ранними клиническими характеристиками ремиттирующего РС — вариантом манифестации РС и длительностью первой ремиссии. Принимая во внимание полигенную природу РС, мы также провели мультилокусный анализ для поиска сочетаний аллелей/генотипов исследуемых генов, ассоциированных с клиническими характеристиками РС.

Материал и методы

Для ретроспективного исследования использовали образцы геномной ДНК 508 неродственных больных РС, этнических русских (табл. 1). Диагноз Р.С. поставлен согласно критериям МакДональда [13], у всех больных РС начинался в ремиттирующей форме.

Таблица 1. Демографическая и клиническая характеристики русских больных РС

Все больные давали информированное согласие на использование их ДНК для исследования и сообщали необходимую эпидемиологическую информацию.

Для выделения из крови ДНК применяли модифицированный метод с использованием экстракции смесью фенол-хлороформ [14].

Геномное типирование проводили методами, основанными на полимеразной цепной реакции (ПЦР). Для анализа однонуклеотидного полиморфизма (SNP) c.731С>Т в экзоне 6 гена IL7RA (rs6897932) использовали метод аллелеспецифической ПЦР, для SNP 10228A>G в 1 интроне гена IL2RA (rs2104286) — метод ПЦР в реальном времени с помощью технологии TaqMan, для SNP 16253T>C в 6-м интроне гена TNFRSF1A (rs1800693) — метод ПЦР с анализом полиморфизма длин рестрикционных фрагментов [15].

При статистическом анализе результатовотклонение частот генотипов от равновесия Харди—Вайнберга оценивали с помощью критерия χ2. Сравнение распределений клинических параметров в подгруппах больных РС проводили с помощью U-критерия Манна—Уитни, рассчитанного с применением программы «GraphPad InStat». Анализ ассоциации исследуемого SNP с клиническими характеристиками РС проводили, оценивая значимость различий частот носительства генотипов в сравниваемых группах по двустороннему критерию Фишера (рf). Для анализа возможной ассоциации сочетаний аллелей и генотипов с клиническими признаками РС использовали программное обеспечение (ПО) APSampler [16]. Силу ассоциаций выражали величиной отношения шансов (ОШ). Значимыми считались ассоциации, у которых 95% доверительный интервал (ДИ) для ОШ не пересекал 1, а значение pf было меньше 0,05.

Результаты и обсуждение

Проведено геномное типирование полиморфных участков генов IL7RA (rs6897932), IL2RA (rs2104286) и TNFRSF1A (rs1800693), кодирующих рецепторы цитокинов, в образцах ДНК 508 больных с ремиттирующим или вторично-прогрессирующим РС, этнических русских. Отклонений распределения наблюдаемых частот генотипов всех исследуемых полиморфных участков от равновесия Харди—Вайнберга не наблюдали.

Тяжесть течения РС оценивали по шкале MSSS [17]; значения варьировали от 0,13 до 9,09, с медианой 3,1 (см. табл. 1).Для исследования ассоциации вариантов генов с тяжестью РС больных РС стратифицировали на две группы. В первую группу вошли пациенты с показателем по шкале MSSS >3 баллов (260 человек), что характеризует среднее и тяжелое течение РС (диапазон MSSS составляет 3,05—9,09, медиана 4,57). Вторую группу составили больные с показателем по шкале MSSS >3 баллов включительно (248 человек), что характеризует относительно легкое течение РС (диапазон MSSS составляет 0,13—2,95, медиана 1,77) [12].

Анализ частот носительства аллелей и генотипов исследуемых полиморфных участков показал, что частота носительства аллеля C гена TNFRSF1A (сумма генотипов С/С и C/T) выше в группе больных с MSSS>3 (p=0,018, ОШ [95% ДИ]=1,7 [1,1—2,5]), а генотипа T/T выше у больных с MSSS≤3 (табл. 2). Таким образом, носительство аллеля С позитивно ассоциировано с более тяжелым течением Р.С. Для других полиморфных участков значимых ассоциаций с тяжестью течения РС не выявлено.

Таблица 2. Частота носительства (абс. число и % носителей) аллелей и генотипов гена TNFRSF1A (rs1800693) у больных РС, стратифицированных по тяжести течения РС Примечание. Здесь и в табл. 3 и 4: Н.з. — незначимо по U-критерию Манна—Уитни. Приводятся значения ОШ, наблюдаемые при сравнении больных с неблагоприятными клиническими характеристиками с больными с благоприятными клиническими характеристиками.

Достоверно оценить тяжесть течения РС по шкале MSSS можно только через достаточно продолжительное время. Поэтому ценность представляют ранние клинические признаки, которые в той или иной степени могут прогнозировать течение РС для данного пациента. В ряде исследований показано, что варианты манифестации (ВМ) РС ассоциированы с дальнейшим течением заболевания [2, 18]. К прогностически благоприятным ВМ отнесены оптический неврит и нарушения чувствительности; к неблагоприятным — нарушения функций ствола мозга, координации, нарушения двигательных, тазовых или психических функций, а также полисимптомная манифестация Р.С. Опираясь на эти данные, мы разделили больных РС на две группы. В одну группу вошли 236 больных с манифестацией РС в виде оптического неврита или нарушений чувствительности, другую группу составили 272 больных с другими В.М. Характеристики клинического течения РС у этих групп больных РС представлены в табл. 3.

Таблица 3. Характеристики клинического течения РС в группах больных, стратифицированных по ранним клиническим признакам течения РС

Действительно, и показатель инвалидизации (по шкале EDSS), и показатель тяжести РС (по шкале MSSS) у больных, принадлежащих к этим группам, высокозначимо различались между собой (p=0,0042 и 0,0013 соответственно) и были ниже у больных с манифестацией РС в виде оптического неврита или нарушений чувствительности (далее — группа с благоприятными ВМ), чем с другими, неблагоприятными В.М. Таким образом, мы подтвердили применимость предложенного разделения ВМ на благоприятные и неблагоприятные к исследуемой выборке больных РС.

Анализ частоты носительства вариантов гена TNFRSF1A в группах больных, стратифицированных по ВМ РС (табл. 4), выявил позитивную ассоциацию носительства генотипа C/C с неблагоприятными ВМ (p=0,015, ОШ [95% ДИ]=1,7 [1,1—2,5]) и, соответственно, ассоциацию носительства аллеля Т (сумма генотипов T/T и C/T) с благоприятными В.М. При анализе частоты носительства вариантов других генов значимых различий между анализируемыми группами больных РС не выявлено.

Таблица 4. Частота носительства (абс. число и % носителей) аллелей и генотипов TNFRSF1A (rs1800693) у больных РС, стратифицированных по ВМ заболевания

В некоторых исследованиях было показано, что длительность первой ремиссии (ПР), т. е. промежутка времени между первым и вторым обострениями, более 1 года может коррелировать с благоприятным клиническим течением РС, в то время как непродолжительная ПР (не более 1 года), ассоциирована с неблагоприятным течением РС [2, 19]. Для анализа ассоциации исследуемых полиморфных участков с длительностью ПР больные РС были разделены на две группы: 262 больных с длительностью ПР ≤1 года и 246 больных с ПР >1 года. Сравнение клинических характеристик этих групп больных РС см. в табл. 3. Хотя эти группы не отличаются по значениям EDSS, между ними наблюдаются высокозначимые различия по показателю прогрессирования MSSS (p<0,0001). Более высокое значение MSSS у больных РС с непродолжительной ПР по сравнению с больными, у которых ПР продолжалась дольше года, свидетельствует о том, что и в нашей выборке непродолжительная ПР ассоциирована с неблагоприятным течением Р.С. Однако сравнение частот носительства аллелей и генотипов исследуемых SNP в группах с разной продолжительностью ПР не выявило ни для одного из исследованных полиморфных участков значимых различий между группами больных РС с ПР ≤1 года и ПР >1 года.

С помощью мультилокусного анализа предпринят поиск ассоциаций сочетаний вариантов исследованных генов со всеми анализируемыми клиническими характеристиками РС. В этот анализ включили также полиморфный участок гена CTLA4 (rs231775), для которого мы наблюдали ранее ассоциацию носительства аллеля CTLA4*G с короткой ПР (не более 1 года) [20]. Этот ген кодирует корецептор Т-лимфоцитов CTLA4 (cytotoxic T lymphocyte antigen 4), влияющий на уровень активации Т-лимфоцитов.

Выявлены биаллельные сочетания, ассоциированные с длительностью ПР (табл. 5). Носительство сочетания (CTLA4*G + TNFRSF1A*C) оказалось ассоциировано с ПР ≤1 года (р=0,0026; ОШ=1,7 [1,2—2,4]) более значимо, чем носительство одного CTLA4*G (для CTLA4*G р=0,044, ОШ=1,5 [1—2,2] [20]). Выявлено также еще одно сочетание (CTLA4*G/G + IL7RA*T), ассоциированное с ПР ≤1 года (р=0,0058; ОШ=2,8 [1,3—6,1]). Мультилокусный анализ не выявил сочетаний аллелей/генотипов, ассоциированных с другими клиническими характеристиками РС более значимо, чем входящие в их состав одиночные аллели/генотипы.

Таблица 5. Сочетания аллелей/генотипов генов CTLA4, TNFRSF1AиIL7RA, носительство которых ассоциированос различной длительностью ПР

Данные, полученные при анализе ассоциации исследуемых полиморфных участков с различными клиническими характеристиками РС, обобщены на рисунке. Наряду с описанной ранее ролью CTLA4 как гена-модификатора клинического течения РС [20], в формирование клинической картины РС безусловный вклад вносит полиморфный локус гена TNFRSF1A. Аллель TNFRSF1A*С ассоциирован с развитием более тяжелой формы РС (по шкале MSSS), генотип TNFRSF1A*С/С — с неблагоприятными ВМ РС, а аллельное сочетание (CTLA4*G + TNFRSF1A*C) — с непродолжительной П.Р. Аллель IL7RA*Т, обнаруженный нами в составе еще одного сочетания с CTLA4*G, также связан с непродолжительной П.Р. Ассоциация TNFRSF1A (rs1800693) с тяжестью РС была ранее описана у афроамериканцев [8]. У аргентинских больных РС была выявлена [21] также ассоциация другого полиморфного участка в генеTNFRSF1Aс локализацией первых очагов поражения, которая коррелирует с наблюдаемыми при дебюте РС симптомами. Выявленная ассоциация полиморфизмов TNFRSF1A и IL7RA с длительностью ПР находится в соответствии c результатами исследования, проведенного на смешанной популяции европеоидов [22]. Показано [10], что носительство аллелей риска генов TNFRSF1A и IL7RA ведет к увеличению количества растворимых изоформ рецепторов, которые, связываясь с соответствующими цитокинами, способны конкурентно ингибировать активацию сигнальных путей рецепторов цитокинов ФНО и ИЛ-7.

Аллели и генотипы генов TNFRSF1A, СTLA4 иIL7RA, носительство которых ассоциированос клиническими характеристиками Р.С. Жирным шрифтом даны аллели или генотипы, связанные с благоприятными клиническими характеристиками РС, светлым — с неблагоприятными.

Возможность прогнозировать индивидуальное клиническое течение РС в самом начале заболевания является важным фактором для стратегии ведения пациента. Полиморфные варианты генов TNFRSF1A, CTLA4 иIL7RA, ассоциированные с тяжестью течения РС и/или его ранними клиническими характеристиками, могут стать полезными клинико-лабораторными маркерами.

В целом результаты проведенного исследования свидетельствуют о том, что гены, для которых показана ассоциация с предрасположенностью к РС, в частности гены, кодирующие рецепторы цитокинов, вовлечены в формирование определенного фенотипа, характеризующего особенности течения заболевания у конкретных больных РС.

Работа поддержана грантом РФФИ 15−04−04866.

Конфликт интересов отсутствует.

Подтверждение e-mail

На test@yandex.ru отправлено письмо со ссылкой для подтверждения e-mail. Перейдите по ссылке из письма, чтобы завершить регистрацию на сайте.

Подтверждение e-mail

Мы используем файлы cооkies для улучшения работы сайта. Оставаясь на нашем сайте, вы соглашаетесь с условиями использования файлов cооkies. Чтобы ознакомиться с нашими Положениями о конфиденциальности и об использовании файлов cookie, нажмите здесь.