Соколова Е.А.

ФГБУН «Институт химической биологии и фундаментальной медицины» СО РАН, Новосибирск, Россия;
ФГБОУ ВО Новосибирский национальный исследовательский государственный университет, Новосибирск, Россия

Малкова Н.А.

Новосибирский окружной центр рассеянного склероза

Коробко Д.С.

Областной центр рассеянного склероза, Государственная новосибирская областная клиническая больница

Рождественский А.С.

Кафедра неврологии и нейрохирургии с курсом медицинской генетики Омской государственной медицинской академии

Какуля А.В.

Кафедра неврологии и нейрохирургии с курсом медицинской генетики Омской государственной медицинской академии

Ханох Е.В.

Кафедра неврологии и нейрохирургии с курсом медицинской генетики Омской государственной медицинской академии

Делов Р.А.

Кафедра неврологии и нейрохирургии с курсом медицинской генетики Омской государственной медицинской академии

Платонов Ф.А.

Республиканская больница №2, Якутск;
Медицинский институт Северо-Восточного федерального университета им. М.К. Аммосова, Якутск

Попова Т.Е.

Медицинский институт Северо-Восточного федерального университета им. М.К. Аммосова, Якутск

Арефьева Е.Г.

Кемеровская областная клиническая больница

Загорская Н.Н.

Кемеровская областная клиническая больница

Алифирова В.М.

Сибирский государственный медицинский университет, Томск, Россия

Титова М.А.

Сибирский государственный медицинский университет, Томск

Смагина И.В.

Отделение неврологии краевой клинической больницы, Барнаул;
кафедра нервных болезней с курсом неврологии и рефлексотерапии факультета повышения квалификации и ППС, Барнаул;
кафедра биохимии и клинической лабораторной диагностики Алтайского государственного медицинского университета, Барнаул;
Новосибирский государственный университет, Новосибирск

Ельчанинова С.А.

Поповцева А.В.

Алтайский государственный медицинский университет, Барнаул

Личенко Ю.Н.

Краевая клиническая больница, Барнаул

Дымова М.А.

Институт химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения РАН, Новосибирск

Вайнер А.С.

Институт химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения РАН, Новосибирск;
Новосибирский государственный университет

Пьянкова О.В.

Институт химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения РАН, Новосибирск;
Новосибирский государственный университет

Оскорбин И.П.

Институт химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения РАН, Новосибирск;
Новосибирский государственный университет

Кечин А.А.

Институт химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения РАН, Новосибирск;
Новосибирский государственный университет

Пузырев В.П.

Научно-исследовательский институт медицинской генетики Сибирского отделения РАМН, Томск

Кулакова О.Г.

Кафедра неврологии и нейрохирургии и кафедра молекулярной биологии и биотехнологии Российского национального исследовательского медицинского университета им. Н.И. Пирогова, Москва

Царева Е.Ю.

Кафедра неврологии и нейрохирургии и кафедра молекулярной биологии и биотехнологии Российского национального исследовательского медицинского университета им. Н.И. Пирогова, Москва

Фаворова О.О.

Кафедра неврологии и нейрохирургии и кафедра молекулярной биологии и биотехнологии Российского национального исследовательского медицинского университета им. Н.И. Пирогова, Москва

Щур С.Г.

Кафедра неврологии и нейрохирургии Российского национального исследовательского медицинского университета

Лащ Н.Ю.

Кафедра неврологии и нейрохирургии Российского национального исследовательского медицинского университета

Попова Н.Ф.

кафедра неврологии и нейрохирургии Российского государственного медицинского университета;
городская клиническая больница #11

Попова Е.В.

Кафедра нервных болезней факультета послевузовского профессионального образования врачей Московской медицинской академии им. И.М. Сеченова

Гусев Е.И.

Кафедра неврологии и нейрохирургии Российского государственного медицинского университета, Москва

Бойко А.Н.

КГБУЗ "Красноярский краевой Центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями"

Аульченко Ю.С.

Институт химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения РАН, Новосибирск;
Институт цитологии и генетики Сибирского отделения РАН, Новосибирск

Филипенко М.Л.

ФГБУН «Институт химической биологии и фундаментальной медицины» СО РАН, Новосибирск, Россия;
ФГБОУ ВО Новосибирский национальный исследовательский государственный университет, Новосибирск, Россия

Первые результаты объединенного общероссийского исследования по клинической генетике рассеянного склероза

Авторы:

Соколова Е.А., Малкова Н.А., Коробко Д.С., Рождественский А.С., Какуля А.В., Ханох Е.В., Делов Р.А., Платонов Ф.А., Попова Т.Е., Арефьева Е.Г., Загорская Н.Н., Алифирова В.М., Титова М.А., Смагина И.В., Ельчанинова С.А., Поповцева А.В., Личенко Ю.Н., Дымова М.А., Вайнер А.С., Пьянкова О.В., Оскорбин И.П., Кечин А.А., Пузырев В.П., Кулакова О.Г., Царева Е.Ю., Фаворова О.О., Щур С.Г., Лащ Н.Ю., Попова Н.Ф., Попова Е.В., Гусев Е.И., Бойко А.Н., Аульченко Ю.С., Филипенко М.Л.

Подробнее об авторах

Прочитано: 766 раз

Как цитировать:

Соколова Е.А., Малкова Н.А., Коробко Д.С., и др. Первые результаты объединенного общероссийского исследования по клинической генетике рассеянного склероза. Журнал неврологии и психиатрии им. С.С. Корсакова. Спецвыпуски. 2013;113(2‑2):6‑9.
Sokolova EA, Malkova NA, Korobko DS, et al. The first results of a combined all-Russian study on clinical genetics of multiple sclerosis. S.S. Korsakov Journal of Neurology and Psychiatry. 2013;113(2‑2):6‑9. (In Russ.)

Рекомендуем статьи по данной теме:
Биобан­ки­ро­ва­ние в кли­ни­чес­ких ис­сле­до­ва­ни­ях с учас­ти­ем па­ци­ен­тов с рас­се­ян­ным скле­ро­зом. Жур­нал нев­ро­ло­гии и пси­хи­ат­рии им. С.С. Кор­са­ко­ва. Спец­вы­пус­ки. 2024;(7-2):7-15
Диаг­нос­ти­чес­кая эф­фек­тив­ность кри­те­ри­ев за­бо­ле­ва­ний спек­тра оп­ти­ко­ней­ро­ми­ели­та в рос­сий­ской кли­ни­чес­кой прак­ти­ке. Жур­нал нев­ро­ло­гии и пси­хи­ат­рии им. С.С. Кор­са­ко­ва. Спец­вы­пус­ки. 2024;(7-2):16-25
При­вер­жен­ность ле­че­нию в ве­де­нии па­ци­ен­тов с рас­се­ян­ным скле­ро­зом. Жур­нал нев­ро­ло­гии и пси­хи­ат­рии им. С.С. Кор­са­ко­ва. Спец­вы­пус­ки. 2024;(7-2):26-32
Оп­ти­маль­ный про­филь па­ци­ен­та для ле­че­ния офа­ту­му­ма­бом: ана­лиз рос­сий­ских дан­ных из ис­сле­до­ва­ния 3-й фа­зы. Жур­нал нев­ро­ло­гии и пси­хи­ат­рии им. С.С. Кор­са­ко­ва. Спец­вы­пус­ки. 2024;(7-2):37-42
Вли­яние бе­ре­мен­нос­ти на рас­се­ян­ный скле­роз. Жур­нал нев­ро­ло­гии и пси­хи­ат­рии им. С.С. Кор­са­ко­ва. Спец­вы­пус­ки. 2024;(7-2):43-49
Сим­птом цен­траль­ной ве­ны в диф­фе­рен­ци­аль­ной ди­аг­нос­ти­ке рас­се­ян­но­го скле­ро­за. Жур­нал нев­ро­ло­гии и пси­хи­ат­рии им. С.С. Кор­са­ко­ва. Спец­вы­пус­ки. 2024;(7-2):58-65
Воз­мож­нос­ти маг­нит­но-ре­зо­нан­сной мор­фо­мет­рии и ла­бо­ра­тор­ных би­омар­ке­ров в изу­че­нии прог­рес­си­ро­ва­ния рас­се­ян­но­го скле­ро­за. Жур­нал нев­ро­ло­гии и пси­хи­ат­рии им. С.С. Кор­са­ко­ва. Спец­вы­пус­ки. 2024;(7-2):66-71
Оп­рос­ни­ки для оцен­ки фун­кции ру­ки у па­ци­ен­тов с рас­се­ян­ным скле­ро­зом. Жур­нал нев­ро­ло­гии и пси­хи­ат­рии им. С.С. Кор­са­ко­ва. 2024;(6):36-42
Осо­бен­нос­ти пер­вич­ных форм го­лов­ной бо­ли при рас­се­ян­ном скле­ро­зе. Жур­нал нев­ро­ло­гии и пси­хи­ат­рии им. С.С. Кор­са­ко­ва. 2024;(6):70-73
Ней­ро­фи­ла­мент лег­ких це­пей: ди­аг­нос­ти­чес­кие воз­мож­нос­ти при рас­се­ян­ном скле­ро­зе. Жур­нал нев­ро­ло­гии и пси­хи­ат­рии им. С.С. Кор­са­ко­ва. 2024;(6):115-119

Рассеянный склероз (РС) - тяжелое заболевание нервной системы, характеризующееся разрушением миелиновой оболочки, хроническим воспалением, патологическими изменениями аксонов и олигодендроцитов и прогрессирующей неврологической дисфункцией. РС считается заболеванием мультифакториальной природы. В его этиологии большую роль играет взаимодействие внешних факторов и особенностей структуры большого количества генов, каждый из которых вносит незначительный вклад в реализацию заболевания. Выявление факторов риска развития РС, к числу которых относятся и генетические факторы, может осуществляться в рамках эпидемиологических исследований.

Для изучения заболеваний, встречающихся в популяции с низкой частотой, таких как РС, наиболее часто используются эпидемиологические исследования по дизайну «случай-контроль». Одним из ключевых звеньев поиска факторов риска при проведении эпидемиологических исследований является корректная интерпретация результатов. После статистической обработки данных получают два параметра - «отношение шансов» (OR) и его уровень статистической значимости (p-value или просто p).

В терминах клинической практики OR характеризует шанс попасть в группу больных («случаев»), при условии носительства индивидуумом аллеля риска. Точность этой оценки зависит от многих парамет­ров, например размера выборки. По этой причине кроме расчета OR обычно вычисляют доверительный интервал (95%CI, confidence interval) и уровень значимости (p). Принято считать результаты с p<0,05 статистически значимыми; чем меньше значение p, тем выше уровень доверия к полученным результатам. Только в случае статистически значимого p допустима интерпретация величины OR.

Важным этапом оценки качества результатов проведенного исследования является также оценка его мощности. Мощность исследования, а точнее мощность статистического анализа результатов исследования, характеризует вероятность того, что мы увидим реально существующую ассоциацию в спланированном исследовании. Мощность исследования выражается в процентах. Приемлемым уровнем принято считать 80% и более. Мощность исследования зависит от многих параметров: распространенность заболевания в популяции, частота исследуемого полиморфного локуса, степень связи полиморфного локуса с заболеванием, размер исследуемых групп. Чем слабее связь полиморфного локуса с заболеванием, тем большего размера группы требуются для достижения приемлемой мощности. Например, если распространенность заболевания 0,001 (1 случай на 1000 человек), частота аллеля риска полиморфного локуса 0,3, то для того чтобы с мощностью 80% и уровнем статистической значимости 0,05 выявить ассоциацию с OR>1,25, необходимо сформировать группу больных и контрольную группу численностью не менее 900 человек каждая. Более слабые ассоциации (OR<1,25) по результатам такого исследования, скорее всего, будут не выявлены.

Таким образом, учитывая многофакторную природу РС, для успешного проведения эпидемиологического исследования необходимы группы пациентов с РС и контрольная не менее 900 человек каждая. Вследствие низкой частоты заболевания в популяции выборки такого размера можно сформировать только в рамках объединенного общероссийского исследования. В настоящее время получены первые результаты подобного исследования, подтверждающие необходимость объединения данных разных исследователей-клиницистов для повышения мощности исследования.

Материал и методы

В группу пациентов с РС вошли 1684 человека, 1124 женщины и 560 мужчин (средний возраст - 36,7±11,2 года).

У 1176 человек был ремиттирующий тип (РРС), у 73 - первично-прогрессирующий тип (ППРС), у 403 - вторично-прогрессирующий тип течения заболевания (ВПРС), у 22 пациентов - дебют, у 10 - клинически изолированный синдром (КИС).

Пациентов обследовали на базе следующих учреждений: Московский городской центр рассеянного склероза (на базе Городской клинической больницы №11) - 508 человек; Омская областная клиническая больница - 305; Кемеровская областная клиническая больница - 224; кафедра неврологии и нейрохирургии Сибирского государственного медицинского университета, Томск - 152; Краевая клиническая больница, Барнаул - 146; Государственная новосибирская областная клиническая больница - 248; Республиканская больница №2, Якутск - 101.

Диагноз РС ставился согласно критериям МакДональда [3] в версии 2001 г.

В контрольной группе были 879 человек (346 мужчин и 533 женщины, средний возраст 33,0±12,0 лет) без воспалительных заболеваний центральной нервной системы. Они проживали в Новосибирске - 576 человек, Барнауле - 118, Москве - 112, Якутске - 60 и Омске - 22.

Исследование было одобрено этическими комитетами перечисленных учреждений. Все пациенты и лица, вошедшие в контрольную группу, подписывали информированное согласие на участие в эксперименте.

Для молекулярно-генетического исследования ДНК выделяли из венозной крови с использованием стандартной процедуры, включающей выделение и лизис клеток крови, гидролиз белков протеиназой К, очистку ДНК смесью фенола с хлороформом и осаждение ДНК этанолом. Генотипирование полиморфных локусов rs6074022, rs1883832, rs1535045 и rs11086996 проводили с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) в режиме реального времени с использованием конкурирующих TaqMan-зондов. Это исследование было выполнено в Институте химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения РАН (Новосибирск).

Тесты на соблюдение равновесия Харди-Вайнберга проводили с помощью программы DeFinetti на сайте Института генетики человека (Мюнхен, Германия; http://ihg2.helmholtz-muenchen.de/cgi-bin/hw/hwa1.pl). Ассоциацию генотипа с РС исследовали с помощью логистического регрессионного анализа (функция «glm» статистического пакета R, www.r-project.org). Статистическую мощность исследования вычисляли с помощью программы Genetic Power Calculator (http://pngu.mgh.harvard.edu/~purcell/gpc/cc2.html).

Результаты и обсуждение

В 2009 г. по результатам полногеномного исследования была выявлена ассоциация РС и полиморфного локуса rs6074022 хромосомы 20q13 расположенного выше гена CD40 [5]. Ранее ассоциация полиморфных локусов гена CD40 была установлена с рядом таких аутоиммунных заболеваний, как системная красная волчанка [6], ревматоидный артрит [4], болезнь Крона [1], болезнь Грейвса [2]. Важная роль гена CD40 в развитии аутоиммунного процесса показана на модельной линии мышей K/BxN, у которых спонтанно развивается ревматоидный артрит. Нокаутные по гену CD40 мыши (K/BxN-CD40-/-) не страдают от ревматоидного артрита. Ассоциация РС и полиморфного локуса rs6074022 гена CD40 согласуется с аутоиммунной природой заболевания. Однако приводимые здесь данные были получены на жителях Австралии, Великобритании и Новой Зеландии, и они требуют верификации в других странах.

Для исследования ассоциации с РС были выбраны 4 полиморфных локуса: rs6074022, rs1883832, rs1535045, rs11086996. Два полиморфных локуса, rs6074022 и rs1883832, лежат выше старта транскрипции гена, rs1535045 - в интроне гена и rs11086996 - в экзоне. Генотипы всех полиморфных локусов были определены у пациентов с РС и в контрольной группе. Эффективность генотипирования составила ≥99,9% для каждого полиморфного локуса. Пять пациентов были исключены из дальнейшего анализа из-за отсутствия результатов генотипирования. Распределение генотипов статистически значимо не отличалось от равновесия Харди-Вайнберга для всех исследованных полиморфных локусов. Наличие ассоциации полиморфных локусов с РС исследовалось с помощью логистического регрессионного анализа (табл. 1).

Два полиморфных локуса статистически значимо ассоциированы с РС: rs6074022 (C аллель OR=1,27, 95%CI=[1,12-1,45], p=3·10–4) и rs1883832 (T аллель OR=1,20, 95%CI=[1,05-1,38], p=7·10–3). Согласно критерию Акаике, для обоих полиморфных локусов аддитивная модель наследования лучше описывала ассоциацию. Достигнутая мощность исследования превышает 80% для обоих полиморфных локусов и свидетельствует о том, что выявленные ассоциации не являются ложноположительными.

Предположим, что исследование проводилось одновременно в двух разных местах на выборках из жителей РФ, но меньшего объема, например в Москве, Сибирском федеральном округе и Республике Саха (СФО и РС). Данное обстоятельство потенциально могло бы повлиять на результаты (табл. 2).

В группе жителей СФО и РС будет выявлена ассоциация трех полиморфных локусов: rs6074022 (C аллель OR=1,25, 95%CI=[1,08-1,45], p=3·10–3, мощность 84%), rs1883832 (T аллель OR=1,18, 95%CI=[1,03-1,39], p=0,02, мощность 58%) и rs1535045 (T аллель OR=0,85, 95%CI=[0,73-0,98], p=0,03, мощность 8%). Однако пороговая мощность в 80% будет преодолена только для rs6074022, следовательно, только эту ассоциацию следует считать истинно положительной. В группе участников из Москвы при этом выявлена всего одна ассоциация с РС - rs6074022 с уровнем мощности, не превыша­ющим порогового значения (C аллель OR=1,45, 95%CI=[1,03-2,05], p=0,03, мощность 56%). Таким образом, истинная ассоциация полиморфных локусов c РС при недостаточной мощности исследования может быть как обнаружена по результатам исследования, например ассоциация с rs6074022 выявлена в обеих группах меньшего размера, так и не обнаружена, например, ассоциация rs1883832 в группе жителей Москвы. Об ассоциации rs1535045 c РС никаких выводов сделать нельзя, так как даже в объединенной группе мощность исследования не превышает пороговую.

Важным является тот факт, что частоты встречаемости аллелей как в контрольной группе, так и в группе пациентов с РС между жителями Москвы и СФО и РС статистически значимо не отличаются. Причина различий в получаемых данных обусловлена не генетической гетерогенностью групп, а исключительно случайным набором данных и низкой мощностью исследования.

По результатам всего исследования можно сделать вывод, что полиморфные локусы rs6074022 и rs1883832 ассоциированы с РС. Однако для того чтобы понять, как именно реализуется связь полиморфных локусов гена CD40 с развитием патологии, необходимо выявить причинный полиморфный локус и механизм его реализации. Выявление причинного полиморфного (-ых) локуса (-ов) в гене CD40 позволит лучше понять механизм участия в развитии аутоиммунных патологий.

Работа поддержана Российской федеральной программой «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» (2012-1.5-12-000-1002). Государственный контракт №8490.

Подтверждение e-mail

На test@yandex.ru отправлено письмо со ссылкой для подтверждения e-mail. Перейдите по ссылке из письма, чтобы завершить регистрацию на сайте.

Подтверждение e-mail

Мы используем файлы cооkies для улучшения работы сайта. Оставаясь на нашем сайте, вы соглашаетесь с условиями использования файлов cооkies. Чтобы ознакомиться с нашими Положениями о конфиденциальности и об использовании файлов cookie, нажмите здесь.