Изменение экспрессии генов пробелокконвертаз при злокачественной трансформации клеток легких имеет ограниченный набор сценариев

ЦЕЛЬ ИССЛЕДОВАНИЯ

Исследование направлено на изучение изменений в экспрессии генов пробелокконвертаз (ПБК) при формировании злокачественных новообразований легких. ПБК — это семейство высокоспецифичных субтилизинподобных сериновых эндопептидаз млекопитающих, осуществляющих процессинг предшественников широкого спектра белков и пептидов. В геноме человека обнаружено девять генов ПБК, которые выполняют жизненно важные функции. Известно, что ПБК способны активировать ряд белков, вовлеченных в канцерогенез, а уровни экспрессии генов ПБК коррелируют с агрессивностью опухолей и выживаемостью пациентов. Ранее мы оценили экспрессию всех генов ПБК с помощью метода количественной ПЦР в парных образцах опухолей легких и окружающей нормальной ткани. Мы впервые выявили четыре паттерна изменения экспрессии генов ПБК в опухолевой ткани, которые обозначили как «сценарии». Для трех из них, охватывающих более двух третей образцов, было характерно доминирующее изменение экспрессии в опухолевой ткани одного из генов ПБК. Эти результаты могут указывать на существование ограниченного количества вариантов изменения экспрессии генов ПБК при злокачественной трансформации клеток легкого, однако нуждаются в подтверждении на расширенной выборке.

МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ

Чтобы подтвердить полученные ранее результаты, в настоящей работе мы проанализировали с помощью современных методов математической статистики экспрессию генов ПБК, основываясь на трех опубликованных наборах данных, полученных методом высокопроизводительного секвенирования РНК для оценки экспрессии генов в парных образцах опухолевой и окружающей нормальной ткани от 194 пациентов с диагнозом немелкоклеточный рак легкого.

РЕЗУЛЬТАТЫ

Проведенный метаанализ подтвердил, что изменение экспрессии генов ПБК в опухолевой ткани легких по сравнению с окружающей нормальной тканью происходит по ограниченному набору сценариев, характеризующихся особыми профилями экспрессии генов ПБК.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Причины, обусловливающие реализацию каждого обнаруженного сценария, могут быть связаны с происхождением опухолей, их мутационным статусом, характеристиками опухолевого микроокружения и др. Соответственно данные сценарии могут коррелировать, например, с агрессивностью опухоли и/или устойчивостью к терапии, и потенциально могут влиять на выбор тактики лечения и/или помогать прогнозировать течение заболевания. Однако этот вопрос требует дополнительных исследований.