Исследование сообществ микроорганизмов является первостепенной задачей при оценке экологического состояния атмосферы, гидросферы и биосферы в целом. Наибольший интерес вызывают сообщества, расположенные вблизи от мест человеческой деятельности: городов, фабрик и морских портов. Исследование микробных сообществ бухт Приморского края в данный момент не является всеобъемлющим, поскольку его объектами становились в основном ближайшие к Владивостоку бухты и заливы, в то время как акватории, расположенные севернее по побережью, исследовались недостаточно или не исследовались вовсе. В настоящей работе представлены новые результаты исследования состава микробиоты десяти бухт и заливов Приморского края. Были выявлены основные доминанты, факторы среды, воздействующие на микробные популяции, а также их функциональные особенности, которые не только влияют на процессы формирования бактериальных сообществ, но и участвуют в обеспечении функционирования экосистем в целом. Экспедиционные исследования на судне «Пилигрим» являются первым реализованным мероприятием «Дорожной карты» (2024—2028 гг.) между НИЦ «Курчатовский институт» и ТОИ ДВО РАН. Полученные результаты перспективны для исследований в соответствии с Указом Президента Российской Федерации от 02.11.2023 №818 «О развитии природоподобных технологий в Российской Федерации».