
Состав популяций и сроки персистенции бактерий Bordetella pertussis у больных коклюшем и контактных лиц в семейных очагах
Журнал: Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2023;41(2):3-12.
DOI: 10.17116/molgen2023410213
Прочитано: 3657 раз
Резюме
Коклюш продолжает лидировать в группе управляемых инфекционных заболеваний, несмотря на массовую вакцинацию. В последние десятилетия отмечается значительный рост заболеваемости коклюшем, распространение атипичных форм среди подростков и взрослых. Предполагается, что формирование антропонозного источника инфекции происходит за счет бактерий Bordetella pertussis со сниженной или полностью утраченной вирулентностью, способных к длительной персистенции в организме человека и восстановлению инфекционности при определенных условиях. Механизмы персистенции возбудителя коклюша до сих пор не изучены. Мы полагаем, что одним из механизмов может быть нарушение оперона bvgAS, регулирующего экспрессию всех генов вирулентности бактерий B. pertussis, в результате интеграции IS-элементов. Мигрирующие IS-элементы, как известно, обладают способностью как встраиваться в сайты генома хозяина, так и вырезаться из них с восстановлением нарушенных функций.
ЦЕЛЬ РАБОТЫ
Оценка сроков персистенции и анализ состава популяций бактерий B. pertussis у больных коклюшем детей и контактных лиц в семейных очагах.
МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ
Обследованы 80 детей с подтвержденным диагнозом «коклюш» и 116 контактных с ними лиц в 59 семейных очагах. Пациентов включали в исследование после подписания информированного согласия. Для выявления ДНК B. pertussis в назофарингеальных мазках и регистрации интеграций IS-элементов использовали разработанную в НИЦЭМ им. Н.Ф. Гамалеи тест-систему ПЦР-РВ-IS, а также гнездовую ПЦР и секвенирование.
РЕЗУЛЬТАТЫ
Показана возможность длительного выявления возбудителя коклюша у больных на разных стадиях заболевания и у членов семей, контактировавших с больными. Установлено, что в периоде реконвалесценции коклюша у 25% заболевших наблюдается формирование инсерционных авирулентных bvg-мутантов B. pertussis в верхних дыхательных путях, способных к длительной персистенции в организме человека. С меньшей частотой (15%) формирование авирулентных мутантов регистрировали у контактных с больными лиц.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
Длительное выявление возбудителя коклюша и регистрация у бактерионосителей bvg-мутантов B. pertussis, содержащих интеграцию IS-элементов, подтверждают гипотезу о возможности перехода бактерий к персистенции в результате инсерционной инактивации оперона bvgAS. Выявление персистирующих бактерий и изучение механизмов их формирования важно для создания новой стратегии лечения и профилактики коклюша.
Ключевые слова
- коклюш
- дети
- взрослые
- популяции бактерий Bordetella pertussis
- семейные очаги
- контактные лица
- метод ПЦР в режиме реального времени (ПЦР-РВ)
- инсерционные мутанты Bordetella pertussis
Дата поступления: 14.11.2022
Дата принятия в печать: 12.12.2022
Дата публикации: 29.06.2023
Введение
Коклюш продолжает лидировать в группе управляемых инфекционных заболеваний, несмотря на проводимую в мире массовую вакцинацию с начала 1950-х годов XX столетия [1]. В экономически развитых странах, где охват детского населения прививками достигает 95%, с начала 2000-х годов отмечается рост заболеваемости коклюшем, приближающийся к уровню довакцинного периода [2—5]. В России в 2018—2019 гг. на фоне гиподиагностики отмечен двукратный рост количества регистрируемых случаев коклюша в сравнении с 2017 г. [6, 7]. Отмечается распространение атипичных форм коклюша среди подростков и взрослых, в том числе бессимптомного носительства [2, 8—10]. Так как коклюш является исключительно антропонозным инфекционным заболеванием, по-видимому, эти группы людей обеспечивают поддержание циркуляции возбудителя, прежде всего, в межэпидемический период. Поддержание циркуляции антропонозного возбудителя возможно за счет большого числа больных людей с разным течением заболевания либо/и за счет длительного бактерионосительства практически здоровыми людьми. Наличие и сроки бактерионосительства до последнего времени не изучались. Одно из первых обследований практически «здоровых» подростков и взрослых, выполненное нами в 2010 г., с использованием разработанной нами высокочувствительной тест-системы ПЦР в режиме реального времени (ПЦР-РВ-IS) показало наличие длительного носительства бактерий Bordetella pertussis [10, 11]. Дальнейшие исследования в этом направлении позволили выявить длительную (более 3 мес) персистенцию вирулентных и аттенуированных бактерий B. pertussis в носоглотке низших обезьян, иммунизированных противококлюшной вакциной ГамЖВК [12, 13]. Более поздние исследования, проведенные в семейных очагах коклюша, показали, что у 86% обследованных контактных лиц регистрируется ДНК бактерий B. pertussis, из них у 35% возбудитель обнаруживали при отсутствии кашля. В ряде случаев ДНК возбудителя обнаруживается в носоглотке контактных и реконвалесцентных лиц в течение всего срока наблюдения (6 мес) [14, 15], что значительно превышает сроки, установленные карантином при коклюше. Таким образом, использование высокочувствительной тест-системы ПЦР-РВ-IS позволило установить возможность длительной персистенции возбудителя коклюша у переболевших и бессимптомных бактерионосителей. Длительная персистенция бактерий в организме переболевших и вакцинированных людей может приводить к формированию мутантов B. pertussis, приспособившихся к выживанию в иммунизированном организме. Такие мутанты, прежде всего, по генам протективных антигенов, входящих в состав бесклеточных коклюшных вакцин, в большом количестве регистрируются при анализе популяции штаммов B. pertussis, циркулирующих в настоящее время [16].
Экспрессия более 550 генов бактерий B. pertussis, из которых 245 являются vir-активируемыми генами (virulence activated genes, vag) и 326 — vir-репрессируемыми (virulence repressed genes, vrg), регулируется двухкомпонентной системой BvgA/BvgS в результате фосфорилирования регулятора транскрипции BvgA (BvgA~P) сенсорной фосфокиназой BvgS. Все известные гены вирулентности бактерий, включая bvgAS, относятся к vag-генам, экспрессирующимся в вирулентной фазе I, при этом vrg-гены экспрессируются в IV фазе, в авирулентном состоянии бактерии. Промежуточные фазы вирулентности II и III характеризуются частичной экспрессией vag- и vrg-генов. Описаны два типа мутаций, индуцирующих переход от фазы I к фазе IV in vitro: мутация со сдвигом рамки считывания («frameshift») в гене bvgS [17] и мутации, возникающие в результате внедрений мобильных генетических элементов IS481 или IS1002 в специфический сайт оперона bvgAS [18, 19]. Изменение условий культивирования бактерий также может привести к обратимому изменению фазового состояния бактерий [20]. В последние десятилетия активно обсуждаются роль и значение фазовых состояний в обеспечении выживания бактерий в организме хозяина и в передаче другому хозяину. Если роль фазы I в патогенезе коклюша не подвергается сомнению, то фаза IV считалась некоторыми исследователями «тупиком эволюции», не имеющим значения для выживания и распространения возбудителя. Однако исследования последних лет указывают, что, по крайней мере, переживание бактерий в организме хозяина, скорее всего, происходит в авирулентном фазовом состоянии [2, 21, 22].
Инсерционные мутанты обнаружены нами в экспериментах с лабораторными мышами, обезьянами [12, 23] и в результате изучения популяций бактерий B. pertussis, присутствующих в носоглотке больных, реконвалесцентов и контактировавших с ними практически здоровых бактерионосителей [10, 14].
Эти данные, наряду с существованием большого количества псевдогенов в составе хромосомы B. pertussis, а также наличием фактов участия МГЭ в регуляции экспрессии генов других микроорганизмов, позволили нам сформулировать гипотезу, предполагающую участие IS-элементов B. pertussis в регуляции вирулентности возбудителя в результате их перемещения в оперон вирулентности bvgAS B. pertussis.
Цель настоящего исследования — оценка сроков персистенции и анализ состава популяций бактерий B. pertussis у больных коклюшем детей и контактных лиц в семейных очагах.
Материал и методы
Исследование проводили на базе Детского научно-клинического центра инфекционных болезней ФМБА России. В период с 2015 по 2017 г. проведено проспективное, открытое, сплошное, одноцентровое исследование. Обследованы 80 детей с лабораторно подтвержденным диагнозом «коклюш», госпитализированных в детскую городскую клиническую больницу №5 им. Н.Ф. Филатова (ДГКБ №5 им. Н.Ф. Филатова) Санкт-Петербурга, а также 116 контактировавших с ними родственников из 59 семейных очагов. Пациентов и контактных лиц включали в протокол исследования после подписания информированного согласия.
Материал для выявления геномэквивалентов (ГЭ) ДНК B. pertussis отбирали с задней стенки носоглотки через нижний носовой ход с помощью гибких назофарингеальных велюр-тампонов («COPAN», Италия). Смывы с тампонов центрифугировали в течение 10 мин при 12 000 об/мин (центрифуга Eppendorf, Германия). Осадок ресуспендировали в 200 мкл деионизированной воды, ДНК выделяли с использованием магнитного сорбента в соответствии с инструкцией к набору Wizard Genomic DNA Purification System («Promega», США) [12].
Выявление ГЭ ДНК B. pertussis и инсерционных bvg-мутантов проводили методом ПЦР в режиме реального времени с использованием разработанной нами тест-системы ПЦР-РВ-IS. Регистрацию интеграций IS481 в специфический сайт оперона bvgAS осуществляли с помощью гнездовой ПЦР. Специфичность продуктов второй реакции гнездовой ПЦР определяли путем секвенирования генома [12].
Бактериальную нагрузку возбудителя коклюша в верхних дыхательных путях и количество инсерционых мутантов B. pertussis у детей с диагнозом «коклюш» проводили при поступлении в стационар, при выписке и в динамике при катамнестическом наблюдении (1—6 мес). У контактных лиц в семейных очагах мазки брали у детей и взрослых в течение 1—6 мес после первичного обследования. Бактериальную нагрузку учитывали по количеству ГЭ ДНК B. pertussis в 5 мкл образца, полученного после выделения ДНК B. pertussis из носоглоточных мазков и растворения в 200 мкл воды.
Для статистической обработки результатов исследований использованы методы описательной статистики. В таблицах представлены количественные значения ГЭ, определенные по результатам двух измерений. Средняя относительная ошибка количества ГЭ составила 20%.
1. Распределение больных коклюшем детей и контактных лиц в семейных очагах по количеству ГЭ ДНК B. pertussis в образцах
Обследованы 80 детей с лабораторно подтвержденным коклюшем и 116 лиц, контактировавших с заболевшими коклюшем детьми в 59 семейных очагах. Детей с диагнозом «коклюш» разделили на три группы: младенцы до 1 года (n=49), дети раннего возраста от 1 до 3 лет (n=14) и школьники и подростки в возрасте 7—14 лет (n=17). Госпитализированные дети не были вакцинированы против коклюша или имели незаконченный курс вакцинации. Распределение по количеству ГЭ ДНК B. pertussis, выявленных при госпитализации в этих группах детей, представлено в табл. 1.
Таблица 1. Количество ГЭ ДНК B.pertussis при первичном обследовании детей с диагнозом «коклюш»
Количество ГЭ ДНК B.pertussis в 5 мкл образца | Возраст | ||
≤1 года (n=49) (%) | 1—3 года (n=14) (%) | 7—14 лет (n=17) (%) | |
≤1—3 (2—6·102)* | 6,1 | 28,6 | 64,7 |
3—30 (6·102—6·103)* | 18,4 | 21,4 | 23,5 |
≥30 (≥6·103)* | 75,5 | 50,1 | 11,8 |
Примечание. * — количество ГЭ ДНК B. pertussis в 1 мл препарата.
У 64,7% детей старшего возраста при госпитализации обнаружено <1—3 ГЭ ДНК B. pertussis в 5 мкл образца. Такое же количество ГЭ ДНК B. pertussis зарегистрировали у 28,6% больных коклюшем в возрасте 1—3 года и только у 6,1% — в возрасте менее 1 года. В каждой из возрастных групп в 18—24% случаев зарегистрировано 3—30 ГЭ ДНК B. pertussis.В старшей группе зарегистрировано 30—100 ГЭ ДНК B. pertussis только у 11,8% больных, в возрасте 1—3 лет — у 50%, а в возрасте до 1 года — у 75,5% (см. табл. 1).
Среди контактных лиц взрослые старше 18 лет составили 59,5%, дети школьного возраста и подростки — 22,4%, дети раннего и дошкольного возраста — 18,1%. Привитыми от коклюша были 102 человека, не привитыми — 13 детей в возрасте 2—10 лет и 1 ребенок — не закончивший полный курс вакцинации. При сборе анамнеза и осмотре было установлено, что у 35,4% контактных лиц кашель отсутствовал, у 19,8% — отмечался типичный приступообразный кашель, у 44,8% — были жалобы на сухой кашель. Никому из контактных членов семьи диагноз «коклюш» не был установлен, хотя клинические признаки заболевания регистрировали у 64,6% обследуемых лиц, в том числе у 19,8% — в типичной форме [14].
Контактных лиц также разделили на три группы: взрослые от 18 лет и старше (n=64), дети от 4 до 17 лет (n=44), дети младше 3 лет (n=8). Для оценки распределения использовали те же значения количества ГЭ ДНК B. pertussis в 5 мкл образца: >30 ГЭ; 3—30 ГЭ; и <1—3 ГЭ. Результаты анализа представлены в табл. 2.
Таблица 2. Количество ГЭ ДНК B.pertussis при первичном обследовании контактных лиц в семейных очагах
Количество ГЭ ДНК B.pertussis в 5 мкл образца | Возраст | ||
≤3 лет (n=8) (%) | 4—17 лет (n=44) (%) | взрослые (n=64) (%) | |
≤1—3 (2—6·102)* | 37,5 | 56,8 | 37,5 |
3—30 (6·102—6·103)* | 25 | 25,0 | 42,2 |
≥30 (≥6·103)* | 37,5 | 18,2 | 20,3 |
Примечание. * — количество ГЭ ДНК B. pertussis в 1 мл препарата.
Максимальную бактериальную нагрузку B. pertussis наблюдали в 37,5% случаев у детей в возрасте до 3 лет, у детей 7—14 лет и взрослых — в 18—20% случаев. У 42,2% взрослых, 25% детей 7—14 лет и 25% детей младше 3 лет зарегистрировали 3—30 ГЭ ДНК B. pertussis. Минимальное количество ГЭ ДНК B. pertussis зарегистрировано у 37,5% взрослых, 56,8% детей 7—14 лет и 37,5% детей в возрасте до 3 лет (см. табл. 2). Сухой навязчивый или приступообразный кашель отмечался у 40% взрослых, 80% детей 4—17 лет и 92% детей в возрасте младше 3 лет.
2. Состав популяций бактерий B. pertussis у больных коклюшем детей и контактных лиц в семейных очагах
Состав популяции бактерий B. pertussis оценивали по наличию мутантов B. pertussis, содержащих интеграцию IS481 в оперон bvgAS. В качестве показателя гетерогенности состава популяции использовали величину n =NINS/NGE), где NINS — количество ГЭ ДНК B. pertussis, содержащих интеграцию, а NGE — общее количество ГЭ ДНК B. pertussis в 5 мкл образца. Значения NINS и NGE определяли с помощью разработанной нами тест-системы ПЦР-РВ-IS [10—12]. Определение аналитической чувствительности, выполненное в результате титрования клонированной последовательности, содержащей фрагмент инсерции IS481 в опероне bvgAS, показало, что проведение ПЦР-РВ и однократной ПЦР позволяет зарегистрировать порядка 3 копий таких фрагментов в 5 мкл образца. Таким образом, событие интеграции может быть зарегистрировано в образцах, содержащих 3 копии ДНК B. pertussis в 5 мкл, если все они содержат искомую интеграцию. Например, доля ГЭ ДНК B. pertussis, содержащих инсерцию, составляет 10% от общего количества ГЭ. Это означает, что при заданной чувствительности в образце должно быть не менее 30 ГЭ ДНК B. pertussis. Титрование ДНК B. pertussis показывает, что ПЦР-РВ, основанная на амплификации повторяющейся последовательности IS481, способна выявлять ГЭ ДНК B. pertussis с концентрацией в 100 раз меньше — 0,05 ГЭ в 5 мкл. Задача выявления интеграций <1—3 ГЭ ДНК B. pertussis может быть решена либо за счет повышения чувствительности тест-системы, либо вследствие увеличения объема анализируемого образца. Использование метода гнездовой ПЦР (нестед-ПЦР) позволило нам реализовать оба подхода. Аналитическая чувствительность нестед-ПЦР повышается до 1 копии целевой мишени, а использование 3—5 реакций, поставленных одновременно, снижает минимально регистрируемое количество ДНК B. pertussis до заданного среднего значения в 0,5—1,0 ГЭ ДНК B. pertussis, содержащих только инсерционные мутанты и порядка 5 молекул при содержании интеграции не менее, чем в 10% геномов B. pertussis. Таким образом, поиск событий интеграций с помощью нестед-ПЦР целесообразно проводить в образцах, содержащих не менее 0,5—1,0 ГЭ ДНК B. pertussis в 5 мкл раствора, в 3—5 пробирках. Положительным результатом считается выявление искомого продукта ПЦР даже в одной пробе. Решающим условием достоверного определения положительного сигнала является его отсутствие в пробирках контроля (К-), содержащих реакционную смесь и воду.
Только часть образцов, выделенных нами от больных коклюшем и контактных лиц, удовлетворяла сформулированному критерию, поэтому для анализа с помощью нестед-ПЦР использовали все образцы ДНК B. pertussis, выделенные на разных этапах исследования и содержащие не менее 0,5—1 копии ГЭ ДНК B. pertussis в 5 мкл. В табл. 3 представлены результаты анализа образцов, полученных от больных в динамике, содержащих не менее 1 копии ГЭ в 5 мкл. Номер образца, возраст обследованных, наличие и длительность кашлевого синдрома, количество ГЭ ДНК B. pertussis и наличие интеграций в исследуемой точке представлены в соответствующих графах табл. 3. В последней графе таблицы представлены значения количества ГЭ ДНК B. pertussis, наличие интеграций и номер образца, взятого у больного при госпитализации. Количество образцов от реконвалесцентов с содержанием ДНК, близким к выбранному параметру, составило 22. Образцы №№103, 223 и 26 взяты у одного больного в разные сроки, как и №№301 и 372. Число обследованных больных, удовлетворяющих сформулированным выше критериям, составило 20.
Таблица 3. Анализ интеграций IS481 в оперон bvgASB.pertussis у больных коклюшем детей в период реконвалесценции
№ п.п. | № образца | Количество ГЭ B. pertussis в 5 мкл в точке i | Возраст ребенка | Длительность и течение заболевания в точке i | Интеграции | Количество ГЭ ДНК B.pertussis в 5 мкл образца при госпитализации |
1 | 103 | 0,9 | 1 год | 3 мес, к | Нет | 4,7·104, №26, ИП |
2 | 223 | 0,8 | 1 год | 5 мес, к | Нет | 4,7·104, №26, ИП |
3 | 213 | 1,7 | 4 мес | 2 мес, к | Нет | 12, №168, ИО |
4 | 117 | 2,3·102 | 1 мес | 2 мес, к | Нет | 1,8·103, №45, ИО |
5 | 226 | 1,1 | 1 год 8 мес | 5 мес, к | Нет | 19, №32, ИО |
6 | 349 | 1,0 | 1 мес | 6 мес, к | Нет | 29, №116, ИО |
7 | 375 | 3,2 | 2 мес | 3 мес, к | Нет | 2,1·103, №285, ИО |
8 | 340 | 1,9 | 1 мес | 4 мес, к | Нет | 43, №192, ИО |
9 | 234 | 0,9 | 7 мес | 2,5 мес, КК | Нет | 15, №150, ИО |
10 | 100 | 0,8 | 9 мес | 2 мес, к | Нет | 2,3·102, №61, ИО |
11 | 339 | 10 | 4 мес | 6 мес, к | Есть | 5·103, №69, ИО |
12 | 372 | 1,0 | 10 мес | 2,5 мес, к | Есть | 18, №301, ИО |
13 | 253 | 1,1 | 3 года | 3 мес, к | Нет | 15, №127, ИО |
14 | 252 | 1,1 | 7 лет | 3 мес, к | Нет | 8,5, №134, ИО |
15 | 343 | 2,5 | 5 мес | 2 мес, к | Нет | 2,7·103, №247, ИО |
16 | 224 | 2,2 | 3 мес | 2,5 мес, к | Есть | 4,4·103, №139, ИО |
17 | 187 | 0,9 | 1 год 9 мес | 2,5 мес, к | Есть | 2,4·104, №109, ИО |
18 | 231 | 10 | 1 мес | 1,5 мес, КК | Нет | 6,1·103, №181, ИО |
19 | 166 | 1,0 | 1 мес | 3 мес, к | Нет | 1,9·103, №78, ИО |
20 | 373 | 1,0 | 1 год 9 мес | 3 мес, к | Нет | 10, №210, ИО |
21 | 148 | 3,3 | 2 мес | 2 мес, КК | Есть | 7·104, №91, ИП |
22 | 176 | 15 | 1 мес | 1 мес, КК | Нет | 6,1·103 №138, ИО |
Примечание. мес — месяцы наблюдения; к — сухой периодический кашель; КК — характерный коклюшный кашель; нет/есть — наличие интеграций IS481 в оперон bvgAS; ИО — интеграции IS481 в оперон bvgAS в образце при госпитализации отсутствуют; ИП — интеграции IS481 в оперон bvgAS в образце присутствуют. В последней графе таблицы последовательно указаны цифры: количество ГЭ ДНК B. pertussis в 5 мкл, № образца, время отбора образца.
Для определения бактериальной нагрузки и состава популяции возбудителя коклюша при госпитализации с помощью ПЦР-РВ проанализированы образцы, содержащие не менее 104 ГЭ B. pertussis. В 2 образцах (№№26 и 91), полученных при госпитализации, количество ГЭ ДНК B. pertussis соответствовало минимуму для достоверного определения интеграции с помощью ПЦР-РВ. Оба образца содержали около 5—7·104 ГЭ ДНК B. pertussis в 5 мкл, а ДНК B. pertussis имела вставки IS481 в оперон bvgAS с частотой около 5·10–5. Методом нестед-ПЦР проанализировали 9 образцов, содержащих 103—2·104 ГЭ ДНК B. pertussis, и 11 образцов, содержащих от 8,5 до 200 ГЭ ДНК B. pertussis в 5 мкл. Ни в одном из этих образцов ни с одним из примененных методов ПЦР не были обнаружены bvg-мутанты, содержащие внедрение IS481 в оперон bvgAS.
На следующем этапе исследования в 22 образцах, взятых в период реконвалесценции через 2,5—6 мес, выявляли инсерционные мутанты B. pertussis. С помощью гнездовой ПЦР содержание мутантной хромосомы B. pertussis зарегистрировали в 5 образцах (см. табл. 3). Два образца из 5, полученных от больных при госпитализации, содержали в среднем 4,8·103 ГЭ B. pertussis в 5 мкл, остальные — 4,7·104. У 1 ребенка с диагнозом «коклюш» при госпитализации было обнаружено 18 ГЭ ДНК B. pertussis (№301) при отсутствии интеграций, а через 2,5 мес сухого кашля — 1 ГЭ ДНК B. pertussis (№372), содержащий IS481 в опероне bvgAS. Из 17 образцов, взятых при госпитализации, 2 содержали 4,7·104 ГЭ ДНК; 6 — (2—6)·103 ГЭ и 1 (№61) — порядка 2,3·102 ГЭ ДНК B. pertussis. Восемь образцов содержали <100 ГЭ ДНК B. pertussis. У 3 обследованных в течение 1—1,5 мес отмечали типичный «коклюшный» кашель. Четыре из 5 положительных образцов были взяты через 2—2,5 мес после госпитализации и 1 — через 6 мес. Возраст детей, в мазках которых обнаружены инсерционные мутанты B. pertussis, составлял от 3 мес до 1 года 9 мес. И только у 1 ребенка в возрасте 2 мес на момент обследования наблюдали характерный спастический кашель, тогда как у остальных детей кашель был сухой и редкий.
Таким образом, из 20 обследованных больных коклюшем детей, у которых в периоде реконвалесценции был обнаружен 1 ГЭ ДНК B. pertussis в 5 мкл и более, у 5 (25%) выявлены инсерционные мутанты с внедрениями IS481 в оперон bvgAS.
Согласно сформулированному нами критерию, для анализа отобрали 50 образцов от членов семей, контактировавших с больными коклюшем. В 7 образцах от контактных лиц в разные сроки наблюдения регистрировали инсерционные мутанты B. pertussis. В 19 случаях мазки были взяты в динамике дважды. В табл. 4 представлена характеристика кашля у контактных членов семьи на момент обследования, количество ГЭ ДНК B. pertussis и наличие инсерций в хромосоме B. pertussis.
Таблица 4. Интеграции IS481 в оперон bvgAS бактерийB.pertussis у членов семей, контактировавших с больными коклюшем
№ п.п. | № образца | Количество ГЭ ДНК B. pertussis в 5 мкл образца | Возраст контактных лиц (годы) | Время наблюдения и клиническая картина заболевания | Интеграции | Количество ГЭ ДНК B. pertussis в 5 мкл образца при первом/повторном обследовании* |
1 | 356 е | 1,8 | 30 | ко | Нет | — |
2 | 289 е | 17 | 33 | ко | Нет | — |
3 | 191 е | 1,0 | 34 | ко | Нет | — |
4 | 155 е | 8 | 52 | 2 нед, к | Нет | — |
5 | 177 е | 80 | 33 | ко | Нет | — |
6 | 319 | 30 | 22 | 1 нед, к | Нет | 10, №299, ко, ИО |
7 | 367 е | 0,7 | 28 | 2 мес, к | Нет | — |
8 | 314 е | 1,0х·103 | 27 | ко | Нет | — |
9 | 310 е | 6 | 25 | ко | Есть | — |
10 | 316 е | 29 | 23 | ко | Нет | — |
11 | 324 е | 10 | 31 | ко | Нет | — |
12 | 296 е | 4,0·104 | 35 | ко | Есть | — |
13 | 298 е | 9 | 36 | ко | Нет | — |
14 | 293 е | 9 | 9 | ко | Нет | — |
15 | 378 | 0,6 | 30 | 3,5 мес, ко | Есть | 5; №287; ко, ИО |
16 | 180 | 5 | 27 | ко | Нет | 3,5·103; №203; 1 нед, КК; ИО |
17 | 27 е | 0,6 | 12 | ко | Нет | — |
18 | 175 | 12 | 32 | 2 мес, к | Нет | 10; №137; 1 мес, КК, ИО |
19 | 318 | 1,9·103 | 31 | 1 нед, к | Нет | 50; №290; ко, ИО |
20 | 335 | 1,0 | 4 | 3,5 мес, кн | Есть | 4,8; №199; 3 нед, к, ИО |
21 | 344 | 13,5 | 52 | 2 нед, к | Нет | 2,8; №331; 1 нед, к, ИО |
22 | 214 | 1,0 | 32 | 2,5 мес, к | Нет | 1,4; №162; 3 нед, КК, ИО |
23 | 136 | 0,9 | 30 | 2 нед, к | Нет | 0,4; №227; 3 мес, к, ИО |
24 | 229 е | 3,1 | 7 | 5 мес, к | Нет | — |
25 | 233 | 2,3·103 | 14 | 5,5 мес, к | Нет | 4·104; №33; 2 нед, к, ИО |
26 | 225 | 0,9 | 13 | 5,5 мес, к | Нет | 2,3·102; №37; 2 нед, к, ИО |
27 | 355 е | 4,3 | 6 | 4,5 мес, к | Нет | — |
28 | 230 е | 1,3 | 4 | 2,5 мес, к | Нет | — |
29 | 164 е | 18,5 | 10 | 1 мес, к | Есть | — |
30 | 97 е | 6,1 | 10 | 1 мес, к | Нет | — |
31 | 304 е | 2,1·102 | 55 | ко | Нет | — |
32 | 246 е | 7,5 | 32 | 1 нед, к | Нет | — |
33 | 70 е | 1,2 | 6 | 1нед, к | Нет | — |
34 | 239 | 0,5 | 26 | 1,5 мес, к | Нет | 3,8·105; №196; 2 нед, КК, ИО |
35 | 211 е | 1,1 | 33 | 2 мес, к | Нет | — |
36 | 282 е | 39,5 | 8 | 1 нед, к | Нет | — |
37 | 277 | 1,5 | 34 | 3 нед, к | Есть | 3,85·102, №266, 1 нед, к, ИО |
38 | 295 е | 1,2 | 14 | ко | Есть | — |
39 | 125 | 1,7 | 2 г | ко | Нет | 7·102; №71; 1 мес, КК, ИО |
40 | 217 е | 5,5 | 56 | 2 нед, к | Нет | — |
41 | 291 е | 1,0 | 64 | ко | Нет | — |
42 | 297 е | 1,6 | 58 | ко | Нет | — |
43 | 53 е | 1,0 | 8 | 1 мес, к | Нет | — |
44 | 201 е | 3,3 | 30 | 3 нед, КК | Нет | — |
45 | 240 е | 1,0 | 29 | 1,5 мес, к | Нет | — |
Примечание. * — первым взят образец с меньшим порядковым номером; мес — месяцы наблюдения, нед — недели наблюдения; к — сухой периодический кашель; КК — характерный коклюшный кашель; ко — кашель отсутствует; нет/есть — наличие интеграций IS481 в оперон bvgAS; е — однократное измерение интеграций IS481 в одной временной точке; ИО — интеграции IS481 на момент госпитализации отсутствуют; ИП — интеграции IS481 присутствуют на момент госпитализации. В последней графе таблицы последовательно указаны цифры: количество ГЭ ДНК B. pertussis в 5 мкл, № образца, время отбора образца.
В 4 из 7 ПЦР-положительных образцов содержалось около 1 ГЭ ДНК B. pertussis, в 1 образце — 6 ГЭ, в 1 — 18 ГЭ и еще в 1 — 4·104 ГЭ. Положительные образцы были у 3 детей в возрасте 14, 10 и 4 лет. Остальные образцы получены от взрослых контактных членов семей. Среди них образец от «практически здорового» на момент исследования контактного взрослого (№296), взятый одновременно с госпитализированным ребенком. Образец содержал 5·104 ГЭ B. pertussis в 5 мкл. Образцы, не содержащие инсерционных мутантов B. pertussis, имели примерно то же количество ДНК B. pertussis. Основная масса «отрицательных» образцов, не выявивших инсерционных мутантов у детей в том же возрастном диапазоне, также содержала 1—10 ГЭ ДНК B. pertussis. Однако среди них обнаружено 7 образцов со значительно большим количеством ГЭ B. pertussis в 5 мкл — 50·104.
Образцы в парах 33 и 233, 299 и 319, 287 и 378, 299 и 319, 199 и 335 принадлежали одному обследованному лицу. Итого 50 исследованных образцов принадлежали 47 контактировавшим членам семей. Следовательно, доля контактных лиц, в аспиратах которых были выявлены инсерционные мутанты B. pertussis, составила 14,9%.
В рамках настоящей работы проведено исследование с целью выявления корреляции между количеством обнаруженных бактерий B. pertussis и составом их популяции с тяжестью заболевания и формированием бактерионосительства у членов семей, контактных с больными коклюшем детьми. Из общего числа больных коклюшем выбрали детей, участвовавших более чем в одном обследовании. Для анализа состава популяции бактерий B. pertussis выбирали образцы, полученные в разные сроки наблюдения, в 5 мкл которых содержалось не менее 0,5—1 ГЭ ДНК B. pertussis.
Обращает на себя внимание большой разброс в значениях ГЭ ДНК B. pertussis — от 5·104 до <1 ГЭ в 5 мкл образца у больных коклюшем детей разного возраста. У 64,7% детей 7—14 лет при первичном обследовании обнаружено <1—3 ГЭ ДНК B.pertussis в 5 мкл образца. То же количество ГЭ ДНК B. pertussis зарегистрировано у 28,6% больных коклюшем в возрасте 1—3 лет и только у 6,1% — в возрасте менее 1 года. В каждой из возрастных групп в 18—24% случаев зарегистрировано от 3—30 ГЭ ДНК B. pertussis. Более 30—100 ГЭ зарегистрировано у 11,8% больных детей 7—14 лет, у 50% — 1—3 лет, у 75,5% — младше 1 года (см. табл. 1).
Данные анамнеза больных коклюшем детей и контактных лиц не позволили сделать однозначное заключение об источнике инфекции в каждом из семейных очагов. Однако сопоставление данных табл. 1 и 2 показывает, что при первичном ПЦР-исследовании у контактных лиц регистрируется больше ГЭ ДНК B. pertussis (>30), чем у больных коклюшем. Вероятно, именно они являются источником инфекции. Наличие характерного для коклюша кашля у большинства детей и подавляющей части контактных лиц, в образцах которых выявлено значительно отличающееся друг от друга количество ГЭ ДНК B. pertussis, указывает на то, что на этапе реконвалесценции выраженность кашлевого синдрома не коррелирует с количеством персистирующих в носоглотке бактерий B. pertussis. Для понимания взаимосвязи между бактериальной нагрузкой и клинической картиной коклюша необходимы дальнейшие исследования, в том числе направленные на анализ соответствия иммунного ответа и состава популяций бактерий B. pertussis.
Отдельные ГЭ ДНК B. pertussis регистрировали в образцах реконвалесцентов через 6 мес после первичного ПЦР-анализа и госпитализации больного. При схожей клинической картине у детей младшего возраста (1—3 лет) регистрируется значительно большее количество бактерий B. pertussis, чем у детей старше 3 лет и взрослых. Снижение бактериальной нагрузки у детей старших возрастных групп и взрослых, вероятно, связано с увеличением по мере взросления количества контактов с возбудителем коклюша и формированием специфического иммунитета. Подтверждением этого могут служить результаты серологического анализа сывороток крови детей старших возрастных групп и взрослых, где до 70% обследованных содержат специфические антитела против возбудителя коклюша [24].
Обсуждение
Полученные нами результаты показывают, что у больных детей младше 3 лет в периоде спазматического кашля бактериальная нагрузка в большинстве случаев составляет >2·103 ГЭ ДНК B. pertussis в 1 мл (>30 ГЭ ДНК B. pertussis в 5 мкл). В этом случае для лабораторной диагностики коклюша может быть использована коммерческая тест-система, обеспечивающая чувствительность 3—5 копий в 5 мкл образца [25]. Однако ПЦР-диагностика коклюша с помощью коммерческой тест-системы в группе заболевших старше 7 лет и контактных лиц всех возрастов, скорее всего, будет неэффективна ввиду малого количества ДНК возбудителя коклюша в образцах, на что указывают результаты сравнения коммерческой тест-системы и ПЦР-РВ-IS, приведенные в предыдущем исследовании [14].
Анализ образцов, содержащих не менее 1 ГЭ ДНК B. pertussis в 5 мкл, методом нестед-ПЦР показал, что у 25% обследованных через 2,5—6 мес после первичного обследования регистрировали инсерционные bvg-мутанты B. pertussis. Учитывая, что большинство образцов отобрано в период реконвалесценции при малом количестве (1—2 копии) ДНК возбудителя коклюша, можно утверждать, что популяции бактерий B. pertussis в исследуемых образцах представлены инсерционными авирулентными мутантами и являются гомогенными. Однако нельзя исключить, что в образцах, содержащих >10 копий, популяции бактерий содержат интактные и мутантные бактерии B. pertussis.
Накопление инсерционных авирулентных мутантов B. pertussis происходит в процессе развития инфекции на поздних стадиях заболевания — от 2 до 6 мес. Кашель при этом не коррелирует с переходом бактерий B. pertussis в авирулентное состояние, и может быть обусловлен как последствиями действия коклюшного токсина, так и отмеченной нами гиперреактивностью бронхов при коклюше [26].
Инсерционные мутанты B. pertussis выявили у 14,9% контактных членов семей. Так же, как и у больных, более чем в 1/2 случаев в образцах, содержащих бактерии, несущие вставки IS-элементов, регистрировали порядка 1 ГЭ ДНК B. pertussis, в 2 образцах — 18,8 ГЭ и в 1 (№296) от взрослого члена семьи — 4·104 ГЭ при отсутствии кашля. Предположительно, он заразился от своего ребенка и был в начальной стадии заболевания или переносил его в бессимптомной форме. Инсерционные мутанты B. pertussis удалось зарегистрировать в парных исследованиях образцов, полученных от контактных лиц: №№287 и 378, №№199 и 335 (см. табл. 4). В каждой из пар один из образцов, взятый в более поздние сроки, содержал инсерционные мутанты B. pertussis. Однако в парных исследованиях образцов от одних и тех же контактных лиц (№№233 и 33, №290 и 318, №299 и 319) инсерционные мутанты B. pertussis не были выявлены. Интервал между исследованиями в парах образцов №290 и 318, №299 и 319 составил 1 нед, а в паре №233 и 33, полученных от ребенка с длительным кашлем в течение 5 мес, зарегистрировано большое количество ГЭ ДНК B. pertussis (2,3·103 и 1,4·104 соответственно). Вероятно, первые 2 пары образцов получены от контактных лиц в начальной стадии заболевания, а пара образцов №233 и 33 — от пациента с длительным негладким течением коклюша. Нельзя исключить, что отсутствие инсерционных мутантов B. pertussis в некоторых образцах, взятых в поздние сроки реконвалесценции, может быть связано с выявленной нами зависимостью частоты транспозиции IS481 от циркулирующего штамма возбудителя коклюша [12].
Заключение
Таким образом, нами показано, что при коклюше в период реконвалесценции в верхних дыхательных путях у 25% заболевших наблюдается формирование популяции персистирующих бактерий B. pertussis, частично представленной инсерционными авирулентными bvg-мутантами, способными длительно (в течение 2—6 мес) находиться в организме человека и участвовать в поддержании антропонозного резервуара коклюша. С меньшей частотой формирование инсерционных мутантов B. pertussis наблюдается у контактных с больными лиц. Больные коклюшем в типичных формах содержат большое количество вирулентных бактерий B. pertussis, популяция которых содержит не более 10–5—10–4 инсерционных мутантов. При атипичных формах коклюша, у реконвалесцентов и контактных лиц количество бактерий B. pertussis составляет (1—5)·102 в 1 мл и формируются малые популяции, состоящие преимущественно из инсерционных bvg-мутантов, способных к длительной персистенции в организме человека.
Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.
Настоящая статья не содержит каких-либо исследований с использованием животных в качестве объектов.
Все процедуры, выполненные в исследовании с участием людей, соответствуют этическим стандартам институционального и/или национального комитета по исследовательской этике и Хельсинкской декларации и ее последующим изменениям или сопоставимым нормам этики.
От каждого из включенных в исследование участников было получено информированное добровольное согласие.
- Чупринина Р.П., Озерецковский Н.А., Алексеева И.А. Иммунопрофилактика и заболеваемость коклюшем. Настоящее и будущее. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2014;6(79):89-99.
- Locht C, Carbonetti NH, Cherry JD, Damron HF, Edwards MK, Fernandez R, et al. Highlights of the 12th International Bordetella Symposium. Clinical Infectious Diseases. 2020;71(1):2521-2526. https://doi.org/10.1093/cid/ciaa651
- Centers for Disease Control and Prevention (CDC). Pertussis epidemic. Washington, 2012. MMWR. 2012;61(28):517-22.
- Gonfiantini MV, Carloni E, Gesualdo F, Pandolfi E, Agricola E, Rizzuto E, et al. Epidemiology of pertussis in Italy: disease trends over the last century. Euro Surveill. 2014;19(40):20921. https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES2014.19.40.20921
- Laboratory-confirmed pertussis in England and Wales: data to end — October 2014. Health Protection Report. 2014;8(47):2-5. https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/387812/hpr4714.pdf
- Харит С.М., Иозефович О.В., Фридман И.В, Начарова Е.П., Тихомирова К.К. Вакцинопрофилактика коклюша: проблемы, возможные решения. Журнал инфектологии. 2020;12(2):50-57. https://doi.org/10.22625/2072-6732-2020-12-2-50-57
- Государственный доклад «О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Российской Федерации в 2019 году». М.: Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека; 2020. https://www.rospotrebnadzor.ru/upload/iblock/8e4/gosdoklad-za-2019_seb_29_05.pdf
- Decker MD, Edwards KM. Pertussis (Whooping Cough). The Journal of Infectious Diseases. 2021;224(S4):310-320. https://doi.org/10.1093/infdis/jiaa469
- Macina D, Evans KE. Bordetella pertussis in School-Age Children, Adolescents, and Adults: A Systematic Review of Epidemiology, Burden, and Mortality in the Middle Easthttps. Infectious Diseases and Therapy. 2021;10:719-738. https://doi.org/10.1007/s40121-021-00440-8
- Медкова А.Ю., Аляпкина Ю.С., Синяшина Л.Н., Амелина И.П., Алексеев Я.И., Каратаев Г.И. и др. Распространенность стертых форм коклюша и анализ фазовых состояний бактерий Bordetella pertussis. Детские инфекции. 2010;4:19-22.
- Медкова А.Ю., Аляпкина Ю.С., Синяшина Л.Н., Амелина И.П., Алексеев Я.И., Боковой А.Г. и др. Выявление инсерционных авирулентных BVG- мутантов Bordetella pertussis у больных коклюшем, острой респираторной вирусной инфекцией и практически здоровых людей. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2010;25(4):27-31. https://doi.org/10.3103/S0891416810040051
- Каратаев Г.И., Синяшина Л.Н., Медкова А.Ю., Семин Е.Г., Шевцова З.В., Матуа А.З. и др. Инсерционная инактивация оперона вирулентности в популяции персистирующих бактерий Bordetella pertussis. Генетика. 2016;52(4):422-430. https://doi.org/10.7868/S0016675816030085
- Медкова А.Ю., Синяшина Л.Н., Амичба А.А., Семин Е.Г., Шевцова З.В., Матуа А.З. и др. Доклинические исследования безопасности, иммуногенности и защитной активности аттенуированных бактерий Bordetella pertussis на экспериментальной модели Macaca mulatta. ЖМЭИ. 2020;97(4):312-323. https://doi.org/10.36233/0372-9311-2020-97-4-3
- Нестерова Ю.В., Медкова А.Ю., Бабаченко И.В., Семин Е.Г., Калисникова Е.Л., Синяшина Л.Г. и др. Клинико-диагностическое значение генетических маркеров Bordetella pertussis у контактных лиц в семейных очагах. Журнал инфектологии. 2019;11(1):17-24. https://doi.org/10.22625/2072-6732-2019-11-1-17-24
- Бабаченко И.В., Нестерова Ю.В., Чернышова Ю.Ю., Карасев В.В., Починяева Л.М., Калисникова Е.Л. Клинико-эпидемиологические аспекты коклюша у детей в условиях массовой вакцинопрофилактики. Журнал инфектологии. 2019;11(2):88-96. https://doi.org/10.22625/2072-6732-2019-11-2-88-96
- Jackson DW, Rohani P. Perplexities of pertussis: recent global epidemiological trends and their potential causes. Epidemiol Infect. 2014;142:672-684. https://doi.org/10.1017/S0950268812003093
- Stibitz S, Aaronson W, Monack D, Falkow S. Phase variation in Bordetella pertussis by frameshift mutation in a gene for a novel two-component system. Nature. 1989;338:266-269.
- Stibitz S. IS481 and IS1002 of Bordetella pertussis create a 6-base-pair duplication upon insertion at a consensus target site. J Bacteriol. 1998;180(18):4963-4966. https://doi.org/10.1128/JB.180.18.4963-4966.1998
- Sinyashina LN, Medkova AYu, Semin EG, Chestkov AV, Tsygankov YD, Karataev GI. IS481-Induced Variability of Bordetella pertussis. In National Institute of Allergy and Infectious Diseases, NIH: Frontiers in Research. Ed. Vassil St. Georgiev, Humana Press, Totowa, NJ. 2008;227-231.
- Linz B, Ma L, Rivera I, Harvill ET. Genotypic and phenotypic adaptation of pathogens: lesson from the genus Bordetella. Curr Opin Infect Dis. 2019;32:223-230. https://doi.org/10.1097/QCO.0000000000000549
- Belcher T, Dubois V, Rivera-Millot A, Locht C, Jacob-Dubuisson F. Pathogenicity and virulence of Bordetella pertussis and its adaptation to its strictly human host. Virulence. 2021;12:1:2608-2632. https://doi.org/10.1080/21505594.2021.1980987
- Rivera I, Linz B, Harvill ET. Evolution and Conservation of Bordetella Intracellular Survival in Eukaryotic Host Cells. Front Microbiol. 2020;11:557819. https://doi.org/10.3389/fmicb.2020.557819
- Медкова А.Ю., Синяшина Л.Н., Румянцева Ю.П., Воронина О.Л., Кунда М.С., Каратаев Г.И. Накопление авирулентных инсерционных Bvg мутантов Bordetella pertussis при экспериментальной инфекции лабораторных мышей. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2013;(4):22-26.
- Басов А.А., Цвиркун О.В., Герасимова А.Г., Россошанская Н.В., Бабенко В.Н. Состояние специфического иммунитета к коклюшу в разных возрастных группах детей. Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2015;14(3):84-88. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2015-14-3-84-88
- Van der Zee A, Schellekens JFP, Mooi FR. Laboratory Diagnosis of Pertussis. Clinical Microbiology Reviews. 2015;28(4):1005-1026. https://doi.org/10.1128/CMR.00031-15
- Нестерова Ю.В., Орлов А.В., Бабаченко И.В. Гиперреактивность бронхов у детей, реконвалесцентов коклюша. Журнал инфектологии. 2020;12(4):51-57. https://doi.org/10.22625/2072-6732-2020-12-4-51-57
Рекомендуем статьи по данной теме:
Хирургические аспекты лечения менингококковой инфекции у детей.Хирургия. Журнал им. Н.И. Пирогова. 2026;(8):111-120
Особенности зубочелюстной системы у детей с синдромами преждевременного старения.Стоматология. 2026;105(4):63-70
Химические ожоги у детей.Хирургия. Журнал им. Н.И. Пирогова. 2026;(7):104-110
Холестеатома лобной пазухи у ребенка.Вестник оториноларингологии. 2026;91(3):107-110
Оценка уровня боли и качества жизни у детей после отохирургических вмешательств.Вестник оториноларингологии. 2026;91(3):29-33
Заболеваемость дерматомикозами в Российской Федерации за 2020—2024 годы.Клиническая дерматология и венерология. 2026;25(3):376-382
Влияние различных стратегий контроля симптомов аллергического ринита на течение сопутствующей бронхиальной астмы у детей.Российская ринология. 2026;34(2):40-51
Клинико-психопатологические аспекты аутоиммунных энцефалитов с антителами к NMDA-рецепторам и глутаматдекарбоксилазе в детском возрасте.Журнал неврологии и психиатрии им. С.С. Корсакова. 2026;126(6):7-16
Циркадный ритм активности и световая гигиена как предикторы качества сна у детей и взрослых: актиграфическое исследование в семейной среде.Журнал неврологии и психиатрии им. С.С. Корсакова. Спецвыпуски. 2026;126(5-2):17-22
Недостаточность и дефицит витамина D у населения Российской Федерации.Профилактическая медицина. 2025;28(8):14-19

