Создание системы для оценки эффективности действия редакторов оснований ДНК и их эволюции
Журнал: Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2025;43(4):34-38.
DOI: 10.17116/molgen20254304134
Прочитано: 595 раз
Резюме
ЦЕЛЬ
В последние годы применение в области геномного редактирования находят редакторы оснований ДНК. Подобный инструмент позволяет точечно вносить изменения в геном без двуцепочечных разрывов ДНК, что снижает мутагенность. Как следствие редакторы оснований ДНК становятся популярным инструментом для генной терапии и трансгенеза клеточных линий и лабораторных животных. Разумеется, возникает необходимость не только в оценке эффективности редактирования, но и в создании новых форм редакторов оснований ДНК путем эволюции. Целью нашей работы стало создание системы для оценки эффективности действия редакторов оснований ДНК и их эволюции для получения новых форм.
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
В работе были применены классические методы генной инженерии. Оценку доли клеток с целевым эффектом проводили методом проточной цитометрии.
РЕЗУЛЬТАТЫ
Показано, что созданная система моделирует экспрессию трансгена в зависимости от состояния его старт-кодонов. Выявлено, что ключевую роль в инициации трансляции или ее ингибировании играет редактирование именно первого старт-кодона.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
На основе разработанных систем возможна оценка эффективности редактирования первого старт-кодона гена gag ВИЧ-1 и эволюция редакторов оснований ДНК для получения новых форм.
Ключевые слова
- редакторы оснований ДНК
- ВИЧ-1
- проточная цитометрия
Дата поступления: 08.04.2025
Дата принятия в печать: 17.06.2025
Дата публикации: 30.12.2025
- Wu WY, Mohanraju P, Liao C, et al. The miniature CRISPR-Cas12m effector binds DNA to block transcription. Mol Cell. 2022;82(23):4487-4502.e7. https://doi.org/10.1016/j.molcel.2022.11.003
- Brezgin S, Kostyusheva A, Kostyushev D, Chulanov V. Dead Cas Systems: Types, Principles, and Applications. Int J Mol Sci. 2019;20(23):6041. https://doi.org/10.3390/ijms20236041
- Knipping F, Newby GA, Eide CR, et al. Disruption of HIV-1 co-receptors CCR5 and CXCR4 in primary human T cells and hematopoietic stem and progenitor cells using base editing. Mol Ther. 2022;30(1):130-144. https://doi.org/10.1016/j.ymthe.2021.10.026
- Smekalova EM, Martinez MG, Combe E, et al. Cytosine base editing inhibits hepatitis B virus replication and reduces HBsAg expression in vitro and in vivo. Mol Ther Nucleic Acids. 2023;35(1):102112. https://doi.org/10.1016/j.omtn.2023.102112
- Mariani C, Desdouits M, Favard C, Benaroch P, Muriaux DM. Role of Gag and lipids during HIV-1 assembly in CD4(+) T cells and macrophages. Front Microbiol. 2014;5:312. https://doi.org/10.3389/fmicb.2014.00312
- Floderer C, Masson JB, Boilley E, et al. Single molecule localisation microscopy reveals how HIV-1 Gag proteins sense membrane virus assembly sites in living host CD4 T cells. Sci Rep. 2018;8(1):17426. https://doi.org/10.1038/s41598-018-34536-y
- Kozak M. An analysis of 5’-noncoding sequences from 699 vertebrate messenger RNAs. Nucleic Acids Res. 1987;15(20):8125-8148. https://doi.org/10.1093/nar/15.20.8125
Рекомендуем статьи по данной теме:
Влияние методов обработки различных типов поверхности дентальных имплантатов на количество и остеогенную дифференцировку мезенхимальных стволовых клеток при лечении периимплантита.Российская стоматология. 2025;18(4):32-38
Возможности применения метода проточной цитометрии для оценки дисфункции эндотелия в кардиохирургии.Хирургия. Журнал им. Н.И. Пирогова. 2025;(10-2):42-47
Особенности субпопуляционного состава лимфоцитов периферической крови у детей с первично выявленной нелеченой ретинобластомой.Вестник офтальмологии. 2025;141(4):5-11