Сайт издательства «Медиа Сфера»
содержит материалы, предназначенные исключительно для работников здравоохранения. Закрывая это сообщение, Вы подтверждаете, что являетесь дипломированным медицинским работником или студентом медицинского образовательного учреждения.

Лаврукова О.С.

ФГБОУ ВО «Петрозаводский государственный университет»

Сидорова Н.А.

ФГБОУ ВО «Петрозаводский государственный университет»

Использование микробиологических данных для целей судебно-медицинской экспертизы

Авторы:

Лаврукова О.С., Сидорова Н.А.

Подробнее об авторах

Прочитано: 952 раза


Как цитировать:

Лаврукова О.С., Сидорова Н.А. Использование микробиологических данных для целей судебно-медицинской экспертизы. Судебно-медицинская экспертиза. 2024;67(5):55‑61.
Lavrukova OS, Sidorova NA. Use of microbiological data for the purposes of forensic medical examination. Forensic Medical Expertise. 2024;67(5):55‑61. (In Russ.)
https://doi.org/10.17116/sudmed20246705155

Рекомендуем статьи по данной теме:

Введение

Установление времени, прошедшего с момента смерти, имеет решающее значение при расследовании преступлений, однако существующие методы подвержены целому ряду ошибок. Например, комплексные судебно-медицинские и энтомологические экспертизы используются для оценки продолжительности постмортального интервала, но погрешность определения давности наступления смерти данным способом может варьировать в широких пределах [1]. Проведенный эксперимент с задействованием трупов модельных животных показал, что количественная и качественная динамика постмортального микробиома является измеряемой и повторяемой (воспроизводимой), а значит, может обеспечить дополнительный (к традиционным судебно-медицинским) инструмент оценки продолжительности постмортального интервала.

Целью работы — описание становления судебно-микробиологической экспертизы как анализа нового типа, который можно определить следующим образом: выявление и фиксация достоверно измеримых изменений эколого-физиологического характера, происходящих в некробиоме, чтобы привести доказательства возможности ориентации на микробиологические параметры в ходе определения давности наступления смерти.

Материал и методы

Для решения поставленной цели были обобщены результаты разноплановых исследований посмертного микробиома применительно к прикладным задачам судебно-медицинской экспертизы, связанным с определением давности наступления смерти, особенно при поздних трупных изменениях. Особое внимание было уделено экологической роли микроорганизмов в составе некробиома/танатомикробиома как активных участников деструкции органического вещества, сопровождаемой последовательным изменением состава сообществ микроорганизмов. Означенные микробные сообщества ассоциируются с конкретной территорией, где располагается популяция, в зависимости от трофического статуса вида.

Результаты

Природные сообщества микроорганизмов исследуются на протяжении многих лет; это доказывает факт несомненной значимости микробиологических аспектов в очень многих научных сферах [2—8], даже в тех областях, которые не так давно не имели никакого отношения к микроорганизмам [9]. Одноклеточные имеют ряд физиологических, биохимических и генетических особенностей, информация о них сегодня широко применяется в рамках анализа циркадного ритма [10], она имеет высокую важность в нейрофизиологии [11], велика ее роль и при изучении онкологических [12, 13] и метаболических заболеваний [14]. Кроме того, ряд исследований рассматривает возможности использования тех или иных эколого-физиологических свойств некробиома в судебно-медицинской экспертизе [15—22].

Публикация работ C. Achard и E. Phulpin [23], в которых рассматривается многообразие разновидностей микроорганизмов, выявленных в постмортальных микробиомах, началась с 1985 г. Именно с того времени и начали активно обсуждать ценность некробиома для выполнения задач, поставленных перед судебной медициной. В ходе исследования структурного состава некробиома кожи были обнаружены данные, позволившие говорить о специфике видового разнообразия микрофлоры кожи. Качественные и количественные динамические характеристики некоторое время остаются стабильным. Если труп находится в помещении, где температура воздуха приближена к комнатной, эти показатели могут оставаться неизменные в течение порядка 14 сут [24].

Далее были получены абсолютно объективные доказательства того, что после смерти человека можно идентифицировать его личность на основании информации, полученной по индивидуальному профилю микробиома [25—30]. Сегодня микробиология базируется на таком методе, как пиросеквенирование [31—34]. Это позволяет в значительной мере расширить представления об использовании микроорганизмов. Соответственно, появляется возможность провести независимую оценку результатов, которые были получены посредством традиционных методов судебной экспертизы. Таким образом, сопоставление индивидуальных характеристик посмертного микробиома со сроком наступления смерти человека является максимально достоверным.

Когда меняется количество микроорганизмов, а вместе с тем происходят изменения в скорости разложения биологических тканей, можно говорить о том, сколько времени прошло с момента наступления смерти [35—40]. В ходе путрификационного процесса разновидности микроорганизмов выстраиваются в систему, обладающую сложной иерархией. Все эти разновидности принадлежат либо к природным микробным сообществам, либо к биотопам организма, имеющим место еще до наступления смерти.

Особое значение имеет тот факт, что по мере разложения трупа происходят постоянные изменения его химического состава. Летучие соединения, которые образуются при разложении белков, жиров и полисахаридов, накапливаются. Высвобождающиеся минеральные составляющие (медь, кальций, магний, железо), а также фосфаты, азот и сера задействуются в процессах конструктивного и энергетического метаболизма гнилостной микрофлоры [41, 42]. Биомасса микробного сообщества растет за счет роста скорости репликации микробных клеток в единицу времени.

Колонизация тканей некрофильной микрофлорой происходит последовательно и затрагивает все ткани без исключения [43]. На активной стадии путрификации нарушается целостность мертвого тела; обогащенные аммиаком выделяемые жидкости поступают в почву. Соответственно, растет концентрация азота в почве, изменяя кислотную среду ложа трупа. Микроорганизмы, испытывающие высокую потребность в азоте и способные приспособиться к переменам в химическом составе среды, усиленно начинают контаминировать труп и ложе трупа.

Существенную важность представляет то обстоятельство, что в естественных условиях у каждого вида микробов имеется собственная субстратная специализация, выраженная довольно отчетливо. Она ориентирована на то, чтобы контролировать разложение мертвой органики. В связи с этим микроорганизмы некробиома могут рассматриваться как потенциальный инструмент судебно-медицинской экспертизы. Они позволяют провести диагностику, определить, в какое время наступила смерть, а также установить продолжительность постмортального интервала. Важную роль микроорганизмов признают такие научные деятели, как В.Л. Наговской [44], Н.П. Движков [45], М.Г. Береза [46, 47], А.В. Вальтер [48], С.И. Попов [49], В.Г. Петровская и О.П. Марко [50]. Все эти ученые единогласно сошлись во мнении, что с точки зрения биологических процессов микроорганизмы способны доказать важные обстоятельства для юристов.

Кроме того, проведенные в рамках изучения этого вопроса эксперименты доказали, что существует возможность применять в качестве критериев уточнения продолжительности постмортального интервала ряд биохимических параметров постмортального микробиома, такие как активность каталазы [51, 52] или казеинолитическая активность [53]. В рамках экспериментов было установлено, что бактериальные сообщества, имеющие связь с телом умершего, представлены в огромном разнообразии. У них есть межиндивидуальная вариабельность, которая имеет достаточно высокую степень. Это свидетельствует о том, что ферментная активность претерпевает изменения, поэтому активность таких ферментов, как конститутивные и индуцибельные протеолитики (обладающие относительной стабильностью в каждое конкретное время в процессе путрификации), может быть использована в работе судмедэксперта.

В работе Ю.Б. Габель (2005) описан сравнительный анализ таких биологических методов исследований, как энтомологический, микробиологический, метод дендрохронологии, с точки зрения использования их в качестве новых видов экспертиз в судебной практике [54]. В исследовании приводятся доказательства использования различных биологических систем в качестве детекторов для проведения судебно-медицинского анализа. А принцип использования микробиологических параметров в судебной практике, как считает автор, связан с контролем реакции биологической системы (клеток, бактерий) на определяемый следовой компонент.

Для того чтобы идентифицировать личность человека по его следам, применяются такие методы, как ДНК-анализ и ольфакторный метод. В первом случае оцениваются клеточные структуры, во втором — следы крови и пота. В настоящее время, используя эти методы, невозможно установить срок давности наступления смерти. Вполне вероятно, что это можно связать с тем, что на сегодняшний день не существует ясной классификации и систематизации методов, задействующих биообъекты (растения, животных, птиц, насекомых, ткани человека и его биожидкости).

Стоит отметить, что сегодня предложено огромное количество вариантов биологических методов уточнения давности наступления смерти [55—62], бо́льшая часть которых имеет ряд серьезных ограничений. Именно поэтому для объективной оценки продолжительности постмортального интервала лучше всего комбинировать разные способы. В таком случае результат анализа будет наилучшим. Этим же можно объяснить тот факт, что в практике судебно-медицинской экспертизы необходимо на постоянной основе разрабатывать и проверять новые современные методы решения данного вопроса [63].

Поскольку микробиоценозы формируют тесные ассоциации с трупом на разных стадиях его разложения, можно сделать вывод о том, что микробиологический подход должен использоваться для решения вышеуказанной задачи [64—67]. При этом важно обеспечить соблюдение ряда критериев. Так, бактериальная ДНК, выделенная из биоценозов трупа, позволяет адекватно характеризовать и сравнивать специфические бактериальные сообщества трупа и бактериальные метаболиты, включая интермедиаты микробного происхождения, которые сохраняются в трупе соответственно периоду разложения; индивидуальность посмертной микрофлоры доказуема путем оценки степени сходства между бактериальными сообществами трупа человека и окружающей среды. Для этого в современных исследованиях, посвященных некробиому человека, применяются анализ филогенетического сходства [68] и высокопроизводительные методы пиросеквенирования [69, 70].

Применение микробиологической судебно-медицинской экспертизы, основанной на данных метабалома, протеома или липома посмертной микрофлоры, может на практике оказать существенную помощь в уголовных расследованиях и последующих преследованиях за биологические преступления, включая акты биотерроризма. Точность полученной информации будет зависеть от способа сбора биологического материала, скорости распада тканей трупа, набора абиотических факторов среды и других характеристик [71—73].

Высокие стандарты обеспечения качества и контроля современных методов молекулярной биологии при микробной судебной экспертизе обеспечат получение объективных данных, которые могут в дальнейшем рассматриваться в суде.

В то же время I.G. Petrisor и соавт. (2006) полагают, что технологии, на которые опираются криминалисты при проведении микробиологических исследований, необходимо тщательно проверять, методы — сертифицировать; единицы измерения и иные параметры оценок полученных результатов — стандартизировать [74].

В качестве объектов для сбора микробиологических доказательств можно использовать: жизнеспособные образцы микроорганизмов живого человека или его трупа, образцы почвы (ложа трупа), одежду или иные следовые доказательства, характерные для данного криминального процесса или явления и в конкретных условиях свершившегося преступления [75—85]. При этом биологическими агентами могут быть бактерии, вирусы или микроскопические грибы. Данные по последним группам в составе некробиома в настоящее время отсутствуют.

Были проведены исследования на тему того, как изменяется посмертная микрофлора. В рамках изучения вопроса были выполнены модельные эксперименты на трупах животных. Полученные в результате данные можно считать серьезной доказательной базой [86—88]. Они позволили в большой мере сократить переменные, которые оказывают воздействие на микробное разложение тела. То, что в ходе экспериментов были использованы трупы животных, можно объяснить этическими, правовыми и иными трудностями, которые не дали возможности использовать в процессе трупный материал человека, который имеет общее по физиологическим и медицинским параметрам с одинаковыми причинами смерти и посмертными условиями.

Эффективность использования трупов животных в рамках экспериментов, проведенных в схожих условиях, уже давно доказана [89]. В своих трудах J.R. Melvin и соавт. [90] и D.O. Carter и соавт. [91], R. Janaway и соавт. [92], P. Listos и соавт. [93], Z.M. Burcham и соавт. [94] приводят итоги изучения трупов грызунов. Эти работы содержат первичные данные по таксономическим признакам микробов, позволяющим осуществить их видовую классификацию. Означенные микробы в упомянутых работах рассматриваются в связи с определенными стадиями разложения. Ряд ограничений, взаимосвязанных с использованием бактериологических методов исследования в силу доказанного наличия в природных сообществах так называемых некультивируемых форм микроорганизмов, могут быть восстановлены посредством высокопроизводительного секвенирования. Это позволяет объективно оценить биоразнообразие некробиома и изменения его состава во времени [86, 89, 95, 96].

Некоторые задачи судебной медицины крайне сложно выполнить. Это объясняется недостаточностью информации, например, о сапротрофах. Эта разновидность микроорганизмов производит колонизацию мертвого тела, прибывая из внешней среды [97—99]. Крайне мало имеется также данных о так называемых сапротрофных оппортунистах — гетеротрофах, питанием которых служит органика. Эта разновидность микроорганизмов появляется в ходе путрификационного процесса, что обусловлено появлением в теле особых ферментов. Ряд условно-патогенных микробов, входящих в микробиом живого тела, после смерти этого тела «переформатируются» в иные разновидности микроорганизмов, при этом имея определенные и существенные преимущества перед микроорганизмами, проникающими извне.

В количественных и качественных параметрах сообществ сапротрофных оппортунистов происходят заметные изменения после наступления смерти живого организма. Однако надлежащим образом это обстоятельство пока не изучено [100]. При этом стоит признать, что изучение вышеуказанного вопроса очень ценно в рамках определения продолжительности постмортального интервала.

Заключение

Изучение закономерностей того, как взаимодействует человек при жизни и его тело после смерти с эндогенной и экзогенной флорой, закладывает основы для решения целого ряда как классических, так и вновь появляющихся прикладных задач судебной медицины, а также позволяет говорить о возможности выделения судебно-микробиологической экспертизы в отдельное направление судебно-медицинской экспертизы.

Объектами судебно-микробиологической экспертизы будут выступать внутренняя микробиота человека и его экзогенная флора, а также характер их воздействия на живые и мертвые ткани.

Предметом судебно-микробиологической экспертизы является весь диапазон динамических закономерностей взаимодействия внутренней микробиоты живого человека и некробиома его тела. Важно подчеркнуть, что внешняя среда характеризуется значительным разнообразием факторов воздействия, как биологических, так и небиологических, что тоже играет свою роль при определении этих закономерностей.

Судебно-микробиологическая экспертиза открывает перед специалистами обширные перспективы. Так, с ее помощью становится возможным установить длительность посмертного интервала, верифицировать ложе трупа, определить время получения телом повреждений, дать экспертное заключение о характере биологического повреждающего фактора и др.

В рамках разработки такого направления, как судебно-микробиологическая экспертиза, перед специалистами встает задача разработать методы, позволяющие достоверно решать экспертные задачи, которые могут быть бактериологическими, и даже молекулярно-генетическими. В этой связи не последнюю роль играет правильное определение объекта исследования — будут ли это слизистые, наружная поверхность кожи, отделы желудочно-кишечного тракта и т.д.

Помимо этого, перед специалистами стоит задача найти модель, на основании характеристик которой будет произведен сравнительный анализ. Здесь могут быть использованы трупы и биологические ткани живых существ, а также фрагменты среды обитания. Важно провести сертификацию методов и стандартизировать критерии, посредством которых возможно будет оценить полученные в ходе работы результаты.

Исследование выполнено за счет гранта Российского научного фонда №23-25-10061, проводимого совместно с Республикой Карелия, и финансирования из Фонда венчурных инвестиций Республики Карелия.

The study was supported by the grant of the Russian Science Foundation No. 23-25-10061, conducted jointly with the Republic of Karelia and funded by the Venture Investment Fund of the Republic of Karelia.

Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.

Литература / References:

  1. Wells JD. A forensic entomological analysis can yield an estimate of postmortem interval, and not just a minimum postmortem interval: an explanation and illustration using a case. J Forensic Sci. 2019;64(2):634-637.  https://doi.org/10.1111/1556-4029.13912
  2. Phan K, Barash M, Spindler X, Gunn P, Roux C. Retrieving forensic information about the donor through bacterial profiling. Int J Legal Med. 2020;134(1):21-29.  https://doi.org/10.1007/s00414-019-02069-2
  3. Kaszubinski SF, Pechal JL, Smiles K, Schmidt CJ, Jordan HR, Meek MH, Benbow ME. Dysbiosis in the dead: human postmortem microbiome beta-dispersion as an indicator of manner and cause of death. Front Microbiol. 2020;11:555347. https://doi.org/10.3389/fmicb.2020.555347
  4. Pechal JL, Schmidt CJ, Jordan HR, Benbow ME. A large-scale survey of the postmortem human microbiome, and its potential to provide insight into the living health condition. Sci Rep. 2018;8(1):5724. https://doi.org/10.1038/s41598-018-23989-w
  5. Roy D, Tomo S, Purohit P, Setia P. Microbiome in death and beyond: current vistas and future trends. Front Ecol Evol. 2021;9:1-24.  https://doi.org/10.3389/fevo.2021.630397
  6. Rana AK. The future of forensic biology. J Biomed. 2018;3:13-18.  https://doi.org/10.7150/jbm.22760
  7. Moitas B, Caldas IM, Sampaio-Maia B. Forensic microbiology and geographical location: a systematic review. Australian Journal of Forensic Sciences. 2023;56(4):416-431.  https://doi.org/10.1080/00450618.2023.2191993
  8. Saegeman V, Cohen MC, Burton JL, Martinez MJ, Rakislova N, Offiah AC, Fernandez-Rodriguez A. Microbiology in minimally invasive autopsy: best techniques to detect infection. ESGFOR (ESCMID study group of forensic and post-mortem microbiology) guidelines. Forensic Sci Med Pathol. 2021;17(1):87-100.  https://doi.org/10.1007/s12024-020-00337-x
  9. Стома И.О., Карпов И.А. Микробиом человека. Минск: Доктор Дизайн; 2018.
  10. Thaiss CA, Zeevi D, Levy M, Zilberman-Schapira G, Suez J, Tengeler AC, Abramson L, Katz MN, Korem T, Zmora N, Kuperman Y, Biton I, Gilad S, Harmelin A, Shapiro H, Halpern Z, Segal E, Elinav E. Transkingdom control of microbiota diurnal oscillations promotes metabolic homeostasis. Cell. 2014;159(3):514-529.  https://doi.org/10.1016/j.cell.2014.09.048
  11. Diaz Heijtz R, Wang S, Anuar F, Qian Y, Björkholm B, Samuelsson A, Hibberd ML, Forssberg H, Pettersson S. Normal gut microbiota modulates brain development and behavior. PNAS. 2011;108(7):3047-3052. https://doi.org/10.1073/pnas.1010529108
  12. Arthur JC, Perez-Chanona E, Mühlbauer M, Tomkovich S, Uronis JM, Fan TJ, Campbell BJ, Abujamel T, Dogan B, Rogers AB, Rhodes JM, Stintzi A, Simpson KW, Hansen JJ, Keku TO, Fodor AA, Jobin C. Intestinal inflammation targets cancer-inducing activity of the microbiota. Science. 2012;338(6103):120-123.  https://doi.org/10.1126/science.1224820
  13. Kostic AD, Chun E, Robertson L, Glickman JN, Gallini CA, Michaud M, Clancy TE, Chung DC, Lochhead P, Hold GL, El-Omar EM, Brenner D, Fuchs CS, Meyerson M, Garrett WS. Fusobacterium nucleatum potentiates intestinal tumorigenesis and modulates the tumor-immune microenvironment. ISO4. 2013;14(2):207-215.  https://doi.org/10.1016/j.chom.2013.07.007
  14. Roopchand DE, Carmody RN, Kuhn P, Moskal K, Rojas-Silva P, Turnbaugh PJ, Raskin I. Dietary Polyphenols Promote Growth of the Gut Bacterium Akkermansia muciniphila and Attenuate High-Fat Diet-Induced Metabolic Syndrome. Diabetes. 2015;64(8):2847-2858. https://doi.org/10.2337/db14-1916
  15. Metcalf JL, Xu ZZ, Bouslimani A, Dorrestein P, Carter DO, Knight R. Microbiome tools for forensic science. Trends Biotechnol. 2017;35:814-823.  https://doi.org/10.1016/j.tibtech.2017.03.006
  16. Tambuzzi S, Maciocco F, Gentile G, Boracchi M, Faraone C, Andreola S, Zoja R. Utility and diagnostiv value of postmortem microbiology associated with histology for forensic purposes. Forensic Sci Int. 2022;342:111534. https://doi.org/10.1016/j.forsciint.2022.111534
  17. Ventura Spagnolo E, Stassi C, Mondello C, Zerbo S, Milone L, Argo A. Forensic microbiology applications: a systematic review. Leg Med. 2019;36:73-80.  https://doi.org/10.1016/j.legalmed.2018.11.002
  18. Quaak FCA, van Duijn T, Hoogenboom J, Kloosterman AD, Kuiper I. Human-associated microbial populations as evidence in forensic casework. Forensic Sci Int Genet. 2018;36:176-185.  https://doi.org/10.1016/j.fsigen.2018.06.020
  19. Caenazzo L, Gino S. Touch microbiome» as a potential tool for forensic investigation: a pilot study. J Forensic Leg Med. 2021;82:102223. https://doi.org/10.1016/j.jflm.2021.102223
  20. Robinson JM, Pasternak Z, Mason CE, Elhaik E. Forensic applications of microbiomics: a Review. Front Microbiol. 2021;11:608101. https://doi.org/10.3389/fmicb.2020.608101
  21. Desmond AU, Nicholas O, Emmanuel OO. Microbial forensics: forensic relevance of the individual person’s microbial signature. Int J Life Sci Scient Res. 2018;2455:2037-2043.
  22. Hampton-Marcell JT, Lopez JV, Gilbert JA. The human microbiome: an emerging tool in forensics. Microb Biotechnol. 2017;10:228-230.  https://doi.org/10.1111/1751-7915.12699
  23. Achard C, Phulpin E. L’envahissement des organs par les microbespendant l’agonie et après la mort. Archivos de Medicina Experimental. 1985;7:25-47. 
  24. Fierer N, Lauber CL, Zhou N, McDonald D, Costello EK, Knight R. Forensic identification using skin bacterial communities. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2010;107(14):6477-6481. https://doi.org/10.1073/pnas.1000162107
  25. Franzosa EA, Huang K, Meadow JF, Gevers D, Lemon KP, Bohannan BJM, Huttenhower C. Identifying personal microbiomes using metagenomic codes. ISO4. 2015;112(22):2930-2938. https://doi.org/10.1073/pnas.1423854112
  26. Schmedes SE, Woerner AE, Budowle B. Forensic human identification using skin microbiomes. Appl Environ Microbiol. 2017;83:e01672. https://doi.org/10.1128/AEM.01672-17
  27. Caenazzo L, Tozzo P. Microbiome forensic biobanking: a step toward microbial profiling for forensic human identification. Health Care. 2021;9:1371. https://doi.org/10.3390/healthcare9101371
  28. Singh H, Clarke T, Brinkac L, Greco C, Nelson KE. Forensic microbiome database: a tool for forensic geolocation meta-analysis using publicly available 16S rRNA microbiome sequencing. Front Microbiol. 2021;2:644861. https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.644861
  29. Cho HW, Eom YB. Forensic analysis of human microbiome in skin and body fluids based on geographic location. Front Cell Infect Microbiol. 2021;11:695191. https://doi.org/10.3389/fcimb.2021.695191
  30. Tozzo P, D’Angiolella G, Brun P, Castagliuolo I, Gino S, Caenazzo L. Skin microbiome analysis for forensic human identification: what do we know so far? Microorganisms. 2020;8(6):873.  https://doi.org/10.3390/microorganisms8060873
  31. Fu XL, Guo JJ, Liu ZY, Shen X, Cai JF. Application of high-throughput sequencing in researches of cadaveric microorganisms and postmortem interval estimation. Fa Yi Xue Za Zhi. 2018;34(5):475-481.  https://doi.org/10.12116/j.issn.1004-5619.2018.05.004
  32. He J, Guo J, Fu X, Cai J. Potential use of high-throughput sequencing of bacterial communities for postmortem submersion interval estimation. Braz J Microbiol. 2019;50(4):999-1010. https://doi.org/10.1007/S42770-019-00119-W
  33. Jo J, Oh J, Park C. Microbial community analysis using high-throughput sequencing technology: a beginner’s guide for microbiologists. J Microbiol. 2020;58(3):176-192.  https://doi.org/10.1007/s12275-020-9525-5
  34. Malla MA, Dubey A, Kumar A, Yadav S, Hashem A, Abd Allah EF. Exploring the human microbiome: the potential future role of next-generation sequencing in disease diagnosis and treatment. Front Immunol. 2019;9:2868. https://doi.org/10.3389/FIMMU.2018.02868
  35. Lehman DC. Forensic microbiology. Clin Lab Sci. 2012;25(2):114-119.  https://doi.org/10.29074/ascls.25.2.114
  36. Elliott S, Lowe P, Symonds A. The possible influence of micro-organisms and putrefaction in the production of GHB in post-mortem biological fluid. Forensic Sci Int. 2004;139:183-190.  https://doi.org/10.1016/j.forsciint.2003.10.018
  37. Boumba VA, Kourkoumelis N, Gousia P, Economou V, Papadopoulou C, Vougiouklakis T. Modeling microbial ethanol production by E. coli under aerobic/anaerobic conditions: applicability to real postmortem cases and to postmortem blood derived microbial cultures. Forensic Sci Int. 2013;232:191-198.  https://doi.org/10.1016/j.forsciint.2013.07.021
  38. Burcham ZM, Pechal JL, Schmidt CJ, Bose JL, Rosch JW, Benbow ME, Jordan HR. Bacterial community succession, transmigration, and differential gene transcription in a controlled vertebrate decomposition model. Front Microbiol. 2019;10:745.  https://doi.org/10.3389/fmicb.2019.00745
  39. Belk A, Xu ZZ, Carter DO, Lynne A, Bucheli S, Knight R, Metcalf JL. Microbiome data accurately predicts the postmortem interval using random forest regression models. Genes (Basel). 2018;9(2):104.  https://doi.org/10.3390/genes9020104
  40. DeBruyn JM, Hauther KA. Postmortem succession of gut microbial communities in deceased human subjects. PeerJ. 2017;6:e3437. https://doi.org/10.7717/peerj.3437
  41. Felsmann MZ, Szarek J, Felsmann M, Babinska I. Factors affecting temporary cavity generation during gunshot wound formation in animals — new aspects in the light of flow mechanics: a review. Veterinarni medicina. 2012;57(11):569-574.  https://doi.org/10.17221/6463-vetmed
  42. Kasper J, Mumm R, Ruther J. The composition of carcass volatile profiles in relation to storage time and climate conditions. Forensic Sci Int. 2012;223(1-3):64-71.  https://doi.org/10.1016/j.forsciint.2012.08.001
  43. Can I, Javan GT, Pozhitkov AE, Noble PA. Distinctive thanatomicrobiome signatures found in the blood and internal organs of humans. J Microbiol Methods. 2014;106:1-7.  https://doi.org/10.1016/j.mimet.2014.07.026
  44. Наговский В.Л. Определение времени смерти по плесени на трупе. Судебно-медицинская экспертиза. 1930;14:90-92. 
  45. Движков Н.П. Микрофлора трупов: Обзор. Архив патологической анатомии и патологической физиологии. 1938;4(4):99-105. 
  46. Береза М.Г. Микробиологические исследования в судебно-танатологической практике. М.: Медицина; 1955.
  47. Береза М.Г. О бактериоскопических исследованиях в судебно-танатологической практике. Судебно-медицинская экспертиза. 1960;2:68-76. 
  48. Вальтер А.В. О микроскопической диагностике заболеваний сердца при гнилостном разложении трупа. Сборник научных работ сотрудников кафедры и судебных медиков г. Ленинграда. Ленинград; 1957.
  49. Попов С.И. О влиянии гнилостной микрофлоры на образование свертков в трупной крови. Вопросы судебной медицины и криминалистики. Горький: Горьковский мед. ин-т; 1972.
  50. Петровская В.Г., Марко О.П. Микрофлора человека в норме и патологии. М.: Медицина; 1976.
  51. Травенко Е.Н., Жук Н.П. Оценка активности каталазы бактерий как один из возможных критериев для установления давности смерти. Проблемы судебной медицины, экспертизы и права. Краснодар: Кубанский государственный медицинский университет Федерального Агентства по здравоохранению и социальному развитию; 2005.
  52. Сидорова Н.А., Попов В.Л., Лаврукова О.С., Приходько А.Н., Лябзина С.Н., Тихомирова Е.И. Специфика путрификации трупа под действием ферментных систем некробиома. Судебно-медицинская экспертиза. 2017;5:18-22.  https://doi.org/10.17116/sudmed201760518-22
  53. Adserias-Garriga J, Quijada NM, Hernandez M, Rodriguez D, Lazaro D. Dynamics of the oral microbiota as a tool to estimate time since death. Mol Oral Microbiol. 2017;32(6):511-516.  https://doi.org/10.1111/omi.12191
  54. Габель Ю.Б. Использование биологических методов в судебной экспертизе: автореф. дис…. канд. юридических наук: 12.00.09. Москва: Московский университет МВД России; 2005.
  55. Morris J, Harrison L, Partridge S. Practical and theoretical aspects of post-mortem bacteriology. Curr Diagn Pathol. 2007;13:65-74.  https://doi.org/10.1016/j.cdip.2006.07.005
  56. Kodama WA, Xu Z, Metcalf JL, Song SJ, Harrison N, Knight R, Carter DO, Happy CB. Trace evidence potential in postmortem skin microbiomes: from death scene to morgue. J Forensic Sci. 2019;64:791-798.  https://doi.org/10.1111/1556-4029.13949
  57. Oliveira M, Amorim A. Microbial forensics: new breakthroughs and future prospects. Appl Microbiol Biotechnol. 2018;102:10377-10391. https://doi.org/10.1007/s00253-018-9414-6
  58. Meena SK, Prasad AA. A review on forensic entomology. National Journal of Environmental and Scientific Research. 2021;1:56-65. 
  59. Amendt J. Forensic entomology. Forensic sciences research. 2018;3(1):1.  https://doi.org/10.1080/20961790.2017.1403081
  60. Vanin S, Huchet JB. Forensic entomology and funerary archaeoentomology: forensic analysis of the dead and the depositional environment. In: Schotsmans EMJ, Marquez-Grant N, Forbes SL. Taphonomy of human remains: forensic analysis of the dead and the depositional environment. First edition. USA: Wiley-Blackwell; 2017. https://doi.org/10.1002/9781118953358
  61. Wells J, LaMotte L. The role of a PMI-prediction model in evaluating forensic entomology experimental design, the importance of covariates, and the utility of response variables for estimating time since death. Insects. 2017;8(2):47.  https://doi.org/10.3390/insects8020047
  62. Mikuláš L, Kutišová D, Šikuta J, Kuruc R, Šidlo J. Aspects of forensic entomology in forensic medicine. Soud Lek. 2021;66(3):39-42. 
  63. Clarke TH, Gomez A, Singh H, Nelson KE, Brinkac LM. Integrating the microbiome as a resource in the forensics toolkit. Forensic Sci Int Genet. 2017;30:141-147.  https://doi.org/10.1016/j.fsigen.2017.06.008
  64. Javan GT, Finley SJ, Tuomisto S, Hall A, Benbow ME, Mills D. An interdisciplinary review of the thanatomicrobiome in human decomposition. Forensic Sci Med Pathol. 2019;15(1):75-83.  https://doi.org/10.1007/s12024-018-0061-0
  65. Kaszubinski SF, Pechal JL, Schmidt CJ, Jordan HR, Benbow ME, Meek MH. Evaluating bioinformatic pipeline performance for forensic microbiome analysis. J Forensic Sci. 2020;65(2):513-525.  https://doi.org/10.1111/1556-4029.14213
  66. Metcalf JL. Estimating the postmortem interval using microbes: Knowledge gaps and a path to technology adoption. Forensic Sci Int Genet. 2019;38:211-218.  https://doi.org/10.1016/j.fsigen.2018.11.004
  67. Pesko BK, Weidt S, McLaughlin M, Wescott DJ, Torrance H, Burgess K, Burchmore R. Postmortomics: The Potential of Untargeted Metabolomics to Highlight Markers for Time Since Death. OMICS. 2020;24(11):649-659.  https://doi.org/10.1089/OMI.2020.0084
  68. Lozupone C, Knight R. UniFrac: a New Phylogenetic Method for Comparing Microbial Communities. Appl Environ Microbiol. 2005;71(12):8228-8235. https://doi.org/10.1128/aem.71.12.8228-8235.2005
  69. Hamady M, Walker J, Harris J, Gold N, Knight R. Error-correcting barcoded primers allow hundreds of samples to be pyrosequenced in multiplex. Nat Methods. 2008;5(3):235-237.  https://doi.org/10.1038/nmeth.1184
  70. Cummings CA, Relman DA. Genomics and microbiology Microbial forensics cross-examining pathogens. Science. 2002;296(5575):1976-1979. https://doi.org/10.1126/science.1073125
  71. Zhang Y, Pechal JL, Schmidt CJ, Jordan HR, Wang WW, Benbow ME, Sze SH, Tarone AM. Machine learning performance in a microbial molecular autopsy context: A cross-sectional postmortem human population study. PLoS One. 2019;14(4):e0213829. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0213829
  72. Yuan H, Wang Z, Wang Z, Zhang F, Guan D, Zhao R. Trends in forensic microbiology: From classical methods to deep learning. Front Microbiol. 2023;14:1163741. https://doi.org/10.3389/fmicb.2023.1163741
  73. Ventura Spagnolo E, Stassi C, Mondello C, Zerbo S, Milone L, Argo A. Forensic microbiology applications: A systematic review. Leg Med (Tokyo). 2019;36:73-80.  https://doi.org/10.1016/j.legalmed.2018.11.002
  74. Petrisor IG, Parkinson RA, Horswell J, Waters JM, Burgoyne LA, Catcheside DEA, Dejonghe W, Leys N, Vanbroekhoven K, Pattnaik P, Graves D. Microbial Forensics. In: Morrison RD, Murphy BL. Environmental Forensics — Contaminants specific Approaches. Amsterdam: Elsevier; 2006. https://doi.org/10.1016/b978-012507751-4/50033-1
  75. Fernández-Rodríguez A, Burton JL, Andreoletti L, Alberola J, Fornes P, Merino I, Martínez MJ, Castillo P, Sampaio-Maia B, Caldas IM, Saegeman V, Cohen MC; ESGFOR and the ESP. Post-mortem microbiology in sudden death: sampling protocols proposed in different clinical settings. Clin Microbiol Infect. 2019;25(5):570-579.  https://doi.org/10.1016/j.cmi.2018.08.009
  76. Lutz H, Vangelatos A, Gottel N, Speed E, Osculati A, Visona S, Finley SJ, Tuomisto S, Karhunen P, Gilbert JA, Javan GT. Manner of death and demographic effects on microbial community composition in organs of the human cadaver. bioRxiv. 2019;752576. https://doi.org/10.1101/752576
  77. Burton JL, Saegeman V, Arribi A, Rello J, Andreoletti L, Cohen MC, Fernandez-Rodriguez A; ESGFOR Joint Working Group of the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ESCMID) Study Group of Forensic and Postmortem Microbiology and the European Society of Pathology. Postmortem microbiology sampling following death in hospital: an ESGFOR task force consensus statement. J Clin Pathol. 2019;72(5):329-336.  https://doi.org/10.1136/jclinpath-2018-205365
  78. Díez López C, Montiel González D, Haas C, Vidaki A, Kayser M. Microbiome-based body site of origin classification of forensically relevant blood traces. Forensic Sci Int Genet. 2020;47:102280. https://doi.org/10.1016/j.fsigen.2020.102280
  79. Pasternak Z, Luchibia A, Matan O, Dawson L, Gafny R, Shpitzen M, Avraham S, Jurkevitch E. Mitigating temporal mismatches in forensic soil microbial profiles. Aust J Forensic Sci. 2019;51:685-694.  https://doi.org/10.1080/00450618.2018.1450897
  80. Santiago-Rodriguez TM, Cano RJ. Soil microbial forensics. Microbiol Spectr. 2016;4.  https://doi.org/10.1128/microbiolspec.EMF-0007-2015
  81. Habtom H, Demanèche S, Dawson L, Azulay C, Matan O, Robe P, Gafny R, Simonet P, Jurkevitch E, Pasternak Z. Soil characterisation by bacterial community analysis for forensic applications: A quantitative comparison of environmental technologies. Forensic Sci Int Genet. 2017;26:21-29.  https://doi.org/10.1016/j.fsigen.2016.10.005
  82. Habtom H, Pasternak Z, Matan O, Azulay C, Gafny R, Jurkevitch E. Applying microbial biogeography in soil forensics. Forensic Sci Int Genet. 2019;38:195-203.  https://doi.org/10.1016/j.fsigen.2018.11.010
  83. Demanèche S, Schauser L, Dawson L, Franqueville L, Simonet P. Microbial soil community analyses for forensic science: Application to a blind test. Forensic Sci Int. 2017;270:153-158.  https://doi.org/10.1016/j.forsciint.2016.12.004
  84. Blum WEH, Zechmeister-Boltenstern S, Keiblinger KM. Does Soil Contribute to the Human Gut Microbiome? Microorganisms. 2019;7(9):287.  https://doi.org/10.3390/MICROORGANISMS7090287
  85. Speruda M, Piecuch A, Borzęcka J, Kadej M, Ogórek R. Microbial traces and their role in forensic science. J Appl Microbiol. 2022;132(4):2547-2557. https://doi.org/10.1111/jam.15426
  86. Metcalf JL, Wegener Parfrey L, Gonzalez A, Lauber CL, Knights D, Ackermann G, Humphrey GC, Gebert MJ, Van Treuren W, Berg-Lyons D, Keepers K, Guo Y, Bullard J, Fierer N, Carter DO, Knight R. A microbial clock provides an accurate estimate of the postmortem interval in a mouse model system. eLIFE. 2013;2:e01104. https://doi.org/10.7554/elife.01104
  87. Сидорова Н.А., Попов В.Л., Лаврукова О.С., Приходько А.Н., Лябзина С.Н., Тихомирова Е.И. Специфика путрификации трупа под действием ферментных систем некробиома. Судебно-медицинская экспертиза. 2017;60(5):18-22.  https://doi.org/10.17116/sudmed201760518-22
  88. Приходько А.Н., Лаврукова О.С., Лябзина С.Н., Сидорова Н.А., Попов В.Л. Использование микробно-энтомологических данных для установления давности наступления смерти. Судебно-медицинская экспертиза. 2018;61(6):52-56.  https://doi.org/10.17116/sudmed20186106152
  89. Hyde ER, Haarmann DP, Lynne AM, Bucheli SR, Petrosino JF. The Living Dead: Bacterial Community Structure of a Cadaver at the Onset and End of the Bloat Stage of Decomposition. PLoS One. 2013;8(10):e77733. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0077733
  90. Melvin JR, Cronholm LS, Simson LR, Isaacs AM. Bacterial transmigration as an indicator of time of death. J Forensic Sci. 1984;29(2):412-417.  https://doi.org/10.1520/jfs11687j
  91. Carter DO, Yellowlees D, Tibbett M. Temperature affects microbial decomposition of cadavers (Rattus rattus) in contrasting soils. Applied Soil Ecology. 2008;40(1):129-137.  https://doi.org/10.1016/j.apsoil.2008.03.010
  92. Janaway R, Percival S, Wilson A. Decomposition of Human Remains. In: Percival SL. Microbiology and Aging. New York City: Humana Press; 2009. https://doi.org/10.1007/978-1-59745-327-1_14
  93. Listos P, Gryzińska M, Batkowska J, Dylewska M, Dudzińska E, Piórkowski J. Preliminary study on the estimation of the time of death in animals based on microflora delopment in a dog’s gastrocnemius muscle. Medycyna Weterynaryjna-Veterinary Medicine-Science and Practice. 2017;73(4):229-233.  https://doi.org/10.21521/mw.5677
  94. Burcham ZM, Hood JA, Pechal JL, Krausz KL, Bose JL, Schmidt CJ, Benbow ME, Jordan HR. Fluorescently labeled bacteria provide insight on post-mortem microbial transmigration. Forensic Sci Int. 2016;264:63-69.  https://doi.org/10.1016/j.forsciint.2016.03.019
  95. Pechal JL, Crippen TL, Benbow ME, Tarone AM, Dowd S, Tomberlin JK. The potential use of bacterial community succession in forensics as described by high throughput metagenomic sequencing. Int J Legal Med. 2014;128(1):193-205.  https://doi.org/10.1007/s00414-013-0872-1
  96. Hyde ER, Haarmann DP, Petrosino JF, Lynne AM, Bucheli SR. Initial insights into bacterial succession during human decomposition. Int J Legal Med. 2015;129(3):661-671.  https://doi.org/10.1007/s00414-014-1128-4
  97. Tang K. Microbial abundance, composition and enzymatic activity during decomposition of copepod carcasses. Aquatic Microbial Ecology. 2006;45:210-219.  https://doi.org/10.3354/ame045219
  98. Dickson GC, Poulter RTM, Maas EW, Probert PK, Kieser JA. Marine bacterial succession as a potential indicator of postmortem submersion interval. Forensic Sci Int. 2011;209(1-3):1-10.  https://doi.org/10.1016/j.forsciint.2010.10.016
  99. Lauber CL, Metcalf JL, Keepers K, Ackermann G, Carter DO, Knight R. Vertebrate decomposition is accelerated by soil microbes. Appl Environ Microbiol. 2014;80(16):4920-4929. https://doi.org/10.1128/aem.00957-14
  100. Preiswerk D, Walser J-C, Ebert D. Temporal dynamics of microbiota before and after host death. ISME J. 2018;12(8):2076-2085. https://doi.org/10.1038/s41396-018-0157-2

Подтверждение e-mail

На test@yandex.ru отправлено письмо со ссылкой для подтверждения e-mail. Перейдите по ссылке из письма, чтобы завершить регистрацию на сайте.

Подтверждение e-mail

Мы используем файлы cооkies для улучшения работы сайта. Оставаясь на нашем сайте, вы соглашаетесь с условиями использования файлов cооkies. Чтобы ознакомиться с нашими Положениями о конфиденциальности и об использовании файлов cookie, нажмите здесь.