Сайт издательства «Медиа Сфера»
содержит материалы, предназначенные исключительно для работников здравоохранения. Закрывая это сообщение, Вы подтверждаете, что являетесь дипломированным медицинским работником или студентом медицинского образовательного учреждения.
Исследование состава микробиоты носоглотки детей с хроническим аденоидитом с использованием метода масс-спектрометрии по микробным маркерам
Журнал: Российская ринология. 2014;22(1): 16‑19
Прочитано: 1354 раза
Как цитировать:
Последнее десятилетие ознаменовалось формированием новых представлений о развитии хронического процесса воспаления, в том числе и на слизистой оболочке носоглотки. Основные открытия в этой области связаны с изучением бактериальных биопленок. Накопившиеся данные свидетельствуют о новых свойствах бактерий, находящихся в составе сообществ, наиболее актуальным из которых для практической медицины является повышенная выживаемость микроорганизмов в биопленках [8, 11, 12, 13, 14, 16].
Целью работы явилось изучение видового и количественного состава микрофлоры слизистой оболочки носоглотки методом детектирования микроорганизмов по химическим маркерам в сравнении с бактериологическим исследованием у детей с диагнозом «хронический аденоидит».
Пациенты и методы. Работа основана на результатах обследования 68 пациентов, проходивших плановое хирургическое лечение в ЛОР-отделении ККБ г. Красноярска в 2010-2013 гг. Возраст пациентов колебался от 3 до 12 лет, средний возраст составил 5,3 ± 2,8 года. Среди детей мальчиков было 34 (50%), девочек - 34 (50%). Основным критерием включения в исследование явилось наличие у пациентов клинических проявлений хронического аденоидита с показаниями для хирургического лечения.
Аденотомию выполняли под эндотрахиальным наркозом. Перед удалением под контролем эндоскопа стерильным тампоном проводили сбор материала с поверхности глоточной миндалины, используя коммерческие транспортные среды со средой Эймса (производство БиоМерье, Франция). Посев проводили методом секторов на дифференциально-диагностические среды (кровяной агар, желточно-солевой агар, среда Эндо, энтерококкагар), учитывали количество колоний и выделяли чистые культуры микроорганизмов с их идентификацией. Одновременно отобранный на стерильные зонды биологический материал подвергали серии химических модификаций, в результате которых анализировали лишь метиловые эфиры жирных кислот, спирты и альдегиды, проводя идентификацию микроорганизмов по специфическим жирным кислотам методом газовой хроматографии и масс-спектрометрии [4-7, 15].
Для клинической диагностики микроорганизмов в составе биопленки используются различные молекулярные методы, в том числе газовая хроматография и ее сочетание с масс-спектрометрией. Детектирование микроорганизмов в составе биопленки проводится по составу специфичных жирных кислот, альдегидов, спиртов и стеринов, определяемых в мазке, взятом с поверхности удаленной глоточной миндалины. В основе метода лежит высокоточное определение специфических маркерных молекул, входящих в состав клеточных липидов [3].
Этот метод микробиологического исследования быстр и универсален, поскольку не требует выращивания отдельных микроорганизмов на специальных средах и проведения для каждого из них специальных биохимических тестов для определения вида возбудителя [2]. Точное количественное определение микроорганизмов способствует назначению целенаправленной антибактериальной терапии и оперативному контролю ее эффективности. Метод зарегистрирован Росздравнадзором в качестве новой медицинской технологии (Разрешение ФС №2010/038 от 24 февраля 2010 г.). Метод масс-спектрометрии позволяет получить информацию о «замаскированной» части микст-инфекции, состоящей из некультивируемых в условиях лабораторий клинической микробиологии микроорганизмов. По сравнению с традиционными методами бактериологического исследования использование хемодифференциации с помощью хромато-масс-спектрометрии позволяет значительно сократить время исследования до 2,5 ч и снизить его стоимость, минуя стадии повторных пересевов первичных колоний и тестовых ферментаций, которые особенно сложны и трудоемки для анаэробов.
Известно, что в процессе метаболизма микробные клетки производят низшие карбоновые кислоты, набор которых является видоспецифическим [2, 3, 10]. Метод детектирования микроорганизмов по жирным кислотам-маркерам сходен с генетическим анализом (ПЦР, определение последовательности нуклеотидов 16sРНК). Однако высокочувствительный и селективный метод газовой хроматографии - масс спектрометрии позволяет одновременно измерять концентрации более сотни микробных маркеров непосредственно в анализируемом материале: крови, моче, биоптатах и других биологических жидкостях и тканях без использования тестовых биохимических материалов.
Отделяемое с поверхности глоточной миндалины в количестве 0,04 г подвергали кислому гидролизу в 0,4 мл 1 М HCl на метаноле в течение 1 ч при температуре 80 °С. В результате реакции метанолиза жирные кислоты, входящие в состав сложных липидов пробы, освобождались в виде метиловых эфиров, которых двукратно экстрагировали 200 мкл гексана, высушивали и обрабатывали 20 мкл N, О-бис(триметилсилил)-трифторацетамида в течение 15 мин при температуре 80 °С, для получения триметилсилильных эфиров гидроксикислот. Смесь эфиров в количестве 1 мкл вводили в инжектор хромато-масс-спектрометрической системы HP-5973 Hewlett-Packard (США). Для управления и обработки данных использовали штатные программы прибора. Хроматографическое разделение пробы осуществляли на капиллярной колонке 0,25 нм × 25 м с метилсиликоновой привитой фазой HP-5ms Hewlett-Packard. Площади пиков маркеров на масс-фрагментограммах интегрировали автоматически по заданной программе. Полученные данные были введены в программу расчета, подготовленную в электронных таблицах Excel.
Метод характеризуется следующими показателями: определение более 50 микроорганизмов одновременно в одном анализе при универсальности в отношении разных групп микроорганизмов - бактерий, грибов, вирусов. Время анализа составляет 2,5 ч, чувствительность - 103 – 104 клеток в пробе, селективность - до вида.
Измеренные концентрации микробных жирных кислот подставляют блоком в шаблон электронной таблицы EXCEL, в которой автоматически происходит реконструкция количественного состава микст-инфекции в виде стандартной таблицы результатов, где полученные данные сопоставлены с нормой в табличной и графической формах. На основании выработанного ранее статистического критерия [1,10], отклонения от нормы приобретают клиническую значимость, когда численность микроорганизмов изменяется вдвое по сравнению с нормой.
Результаты исследования. По результатам микробиологического исследования на поверхности глоточной миндалины были идентифицированы: S. Aureus (20% от общего отчета микробиоты), S. haemoliticus (18%), S. Epidermidis (15%). Также присутствовали в меньших количествах E. coli, E. faecium, P. aeruginosa, E. faecalis, P. morganii, P. mirabilis, S. saprophyticus, N. Subflava (рис. 1).
В то же время, данные хромато-масс-спектрометрического исследования выявили присутствие в очаге воспаления и других микроорганизмов (рис. 2), в том числе Clostridium ramosum, Fusobacterium/Haemophylus, Sp. Enterobacteriaceae (E. coli и др), Eubacterium moniliforme, Nocardia asteroides, Butyrivibrio/Cl. Fimetarum, Propionibacterium jensenii, Afipia sp., Helicobacter mustelae, Actinomycetes 10Me14, микроскопические грибов и вирусов (Herpes sp.).
Из полученных результатов следует, что наряду с культивируемой флорой метод масс-спектрометрии микробных маркеров позволяет выявить дополнительные изменения микроэкологического статуса слизистой оболочки носоглотки. Наши исследования показали, что у детей с хроническим аденоидитом определяется избыточная концентрация маркеров Enterobacteriaceae и Clostridium ramosum c периодическим подключением многочисленных представителей рода Eubacterium. Более чем втрое по сравнению с нормой растет концентрация маркеров Clostridium ramosum и Clostridium propionicum, почти у всех больных возрастает количество E. lentum.
Из данных результатов газовой хроматографии в сочетании с масс-спектрометрией следует, что измерение микробных маркеров in situ выявляет новую группу микроорганизмов из числа трудно культивируемых и поэтому мало известных в клинической практике. Эти участники инфекционного процесса - Clostridium, Eubacterium, Enterobacteriaceae, Lactobacillus, Helicobacter - обладают высокой патогенетической активностью, и вызванные ей заболевания трудно поддаются лечению [9,15].
Выводы.
Данные микробиологического исследования в сравнении с хромато-масс-спектрометрией показали, что определение 60-80% микробиоценоза слизистой оболочки носоглотки недоступно для культуральных методов исследования.
Данные хромато-масс-спектрометрии c поверхности удаленной глоточной миндалины показывают, что наряду со стрептококками и стафилоккоками определяются маркеры энтеробактерий, эубактерий, клостридий и различных видов грибов.
Несомненным достоинством метода хромато-масс-спектрометрии являются информативность, чувствительность, определение труднокультивируемых микроорганизмов, возможность расширять перечень определяемых химических маркеров.
Таким образом, использование в клинической практике результатов хромато-масс-спектрометрии может способствовать строго индивидуальному подбору оптимального метода лечения у больных хроническим аденоидитом.
Подтверждение e-mail
На test@yandex.ru отправлено письмо со ссылкой для подтверждения e-mail. Перейдите по ссылке из письма, чтобы завершить регистрацию на сайте.
Подтверждение e-mail
Мы используем файлы cооkies для улучшения работы сайта. Оставаясь на нашем сайте, вы соглашаетесь с условиями использования файлов cооkies. Чтобы ознакомиться с нашими Положениями о конфиденциальности и об использовании файлов cookie, нажмите здесь.