Сайт издательства «Медиа Сфера»
содержит материалы, предназначенные исключительно для работников здравоохранения. Закрывая это сообщение, Вы подтверждаете, что являетесь дипломированным медицинским работником или студентом медицинского образовательного учреждения.

Вход
RU
+7 (495) 482-4118
+7 (495) 482-0604
+8 800 101-59-87
  • (бесплатный номер по вопросам подписки)
    пн-пт с 10 до 18
  • Издательство «Медиа Сфера»
    а/я 54, Москва, Россия, 127238
  • info@mediasphera.ru

  • © 1998-2024
+7 (495) 482-43-29
RU
0 ₽
0 товара
Все журналы
Журнал
Год
Год
Результаты поиска: 0

Микрюкова Т.П.

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора

Протопопова Е.В.

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора

Межевалова А.С.

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора

Баяндин Р.Б.

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора

Хорошавин Ю.А.

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора

Швалов А.Н.

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора

Таранов О.С.

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора

Трегубчак Т.В.

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора

Терновой В.А.

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора

Локтев В.Б.

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора;
ФГАОУ ВО «Новосибирский национальный исследовательский государственный университет»;
ФГБУН «ФИЦ "Институт цитологии и генетики СО РАН"»

Исторические изоляты вирусов леса Семлики и чикунгунья, их вирусологическая характеризация, полногеномные последовательности и филогения

Авторы:

Микрюкова Т.П., Протопопова Е.В., Межевалова А.С., Баяндин Р.Б., Хорошавин Ю.А., Швалов А.Н., Таранов О.С., Трегубчак Т.В., Терновой В.А., Локтев В.Б.

Подробнее об авторах

Журнал: Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2023;41(4): 38‑44

DOI: 10.17116/molgen20234104138

Просмотров: 383

Загрузок: 1

Купить за 200₽
Связаться с автором
Оглавление

Как цитировать:

Микрюкова Т.П., Протопопова Е.В., Межевалова А.С., Баяндин Р.Б., Хорошавин Ю.А., Швалов А.Н., Таранов О.С., Трегубчак Т.В., Терновой В.А., Локтев В.Б. Исторические изоляты вирусов леса Семлики и чикунгунья, их вирусологическая характеризация, полногеномные последовательности и филогения. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2023;41(4):38‑44.
Mikryukova TP, Protopopova EV, Mezhevalova AS, Bayandin RB, Khoroshavin YuA, Shvalov AN, Taranov OS, Tregubchak TV, Ternovoi VA, Loktev VB. Historical isolates of Semliki forest and chikungunya viruses, their virological characterization, genome sequences and phylogeny. Molecular Genetics, Microbiology and Virology. 2023;41(4):38‑44. (In Russ.)
https://doi.org/10.17116/molgen20234104138

Здоровье щитовидной железы – 2024
Перекрестки терапевтических проблем
Доказательная гастроэнтерология: pro et contra
Актуальные вопросы педиатрической практики
Подписка 2024, 2 полугодие
NN - давайте знакомится (08.04.2024)
Использование инфографики авторами научных работ
МСФ на ЯМ
Mediasphera_Net
1med.tv
Закрыть метаданные
Рекомендуем статьи по данной теме:
Но­вые ге­не­ти­чес­кие ва­ри­ан­ты воз­бу­ди­те­ля хо­ле­ры и их рас­простра­не­ние в эн­де­мич­ных стра­нах и Рос­сии. Мо­ле­ку­ляр­ная ге­не­ти­ка, мик­ро­би­оло­гия и ви­ру­со­ло­гия. 2023;(1):10-17

ВВЕДЕНИЕ

Цель исследования состояла в исследовании изолятов альфавирусов, изолированных в Уганде и Танзании в период, предшествующий их глобальному распространению и относящихся к середине прошлого века. Мы предполагали, что анализ их геномов позволит уточнить особенности и направленность молекулярной эволюции альфавирусов в современных условиях.

МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ

Архивные образцы вирусов чикунгунья (CHIKV) и леса Семлики (SFV) были восстановлены культивированием на клетках Vero E6. Изоляты идентифицировались методом ОТ-ПЦР с последующим секвенированием. Полногеномные последовательности определяли NGS-секвенированием и использовали для филогенетического анализа.

РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

Идентифицировано наличие в исследуемом архивном образце CHIKV двух представителей рода Alphavirus, а именно CHIKV и SFV. В архивном образце 1942 г. был обнаружен только SFV. Все изоляты оказались способны высокоэффективно реплицироваться на клеточных культурах C6/36, Vero E6, 293 и СПЭВ с развитием цитопатогенного действия и вызывать патоморфологические изменения у мышей, характерные для этих альфавирусов. Определены их полногеномные последовательности и проведен их анализ. Выделенные изоляты кластеризуются с типичными африканскими штаммами CHIKV и SFV. Эти изоляты могут быть отнесены к старейшим известным штаммам SFV и CHIKV, датируемыми 1942 и 1953 годами, сохранившимися в лабораторных коллекциях. Архивный изолят CHIKV генотипируется как ECSA-вариант, с современными представителями которого ассоциируется глобальное распространение CHIKV и возникновение крупных вспышек лихорадки чикунгунья в последние десятилетия.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Изоляты вирусов леса Семлики и чикунгунья восстановлены из архивных лабораторных образцов, предположительно датируемых 1942 и 1953 годами, проведена их вирусологическая характеризация, генотипирование и анализ их полногеномных последовательностей.

Ключевые слова:

альфавирусы
вирус чикунгунья
вирус леса Семлики
геномные последовательности
филогения

Авторы:

Микрюкова Т.П.

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора

Протопопова Е.В.

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора

Межевалова А.С.

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора

Баяндин Р.Б.

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора

Хорошавин Ю.А.

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора

Швалов А.Н.

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора

Таранов О.С.

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора

Трегубчак Т.В.

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора

Терновой В.А.

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора

Локтев В.Б.

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора;
ФГАОУ ВО «Новосибирский национальный исследовательский государственный университет»;
ФГБУН «ФИЦ "Институт цитологии и генетики СО РАН"»

Дата поступления:

19.06.2023

Дата принятия в печать:

24.10.2023

Список литературы:

  1. Chen R, Mukhopadhyay S, Merits A, Bolling B, Nasar F, Coffey L.L. Powers A, Weaver S.C. ICTV Report Consortium ICTV Virus Taxonomy Profile: Togaviridae. J Gen Virol. 2018;99(6):761-762.  https://doi.org/10.1099/jgv.0.001072
  2. Cui J, Gao M, Ren X. Phylogeny and homologous recombination in Chikungunya viruses. Infect Genet Evol. 2011;11(8):1957-1963. https://doi.org/10.1016/j.meegid.2011.08.026
  3. Khongwichit S, Chansaenroj J, Chirathaworn C, Poovorawan Y.J. Chikungunya virus infection: molecular biology, clinical characteristics, and epidemiology in Asian countries. Biomed Sci. 2021;28(1):84.  https://doi.org/10.1186/s12929-021-00778-8
  4. Robinson MC. An epidemic of virus disease in Southern Province, Tanganyika territory, in 1952—1953. Trans R Soc Trop Med Hyg. 1955;49(1):28-32.  https://doi.org/10.1016/0035-9203(55)90080-8
  5. Mason PJ, Haddow AJ. An epidemic of virus disease in Southern Province, Tanganyika Territory, in 1952—1953. Trans R Soc Trop Med Hyg. 1957;51(3):238-240.  https://doi.org/10.1016/0035-9203(57)90022-6
  6. Ross RW. The Newala epidemic. III. The virus: isolation, pathogenic properties and relationship to the epidemic. J Hyg (Lond) 1956;54(2):177-191.  https://doi.org/10.1017/s0022172400044442
  7. Schlesinger RW. New opportunities in biological research offered by arthropod cell cultures. I. Some speculations on the possible role of arthropods in the evolution of arboviruses. Curr Top Microbiol Immunol. 1971;55:241-245.  https://doi.org/10.1007/978-3-642-65224-0_40
  8. Vancini R, Hernandez R, Brown D. Alphavirus entry into host cells. Prog Mol Biol Transl Sci. 2015;129:33-62.  https://doi.org/10.1016/bs.pmbts.2014.10.002
  9. Calisher CH, Karabatsos N. Arbovirus serogroups: definition and geographic distribution. Boca Raton, Florida: CRC Press; 1988;19-57. 
  10. Ferguson MC, Saul S, Fragkoudis R, Weisheit S, Cox J, Patabendige A, et al. Ability of the Encephalitic Arbovirus Semliki Forest Virus To Cross the Blood-Brain Barrier Is Determined by the Charge of the E2 Glycoprotein. J Virol. 2015;89:7536-7549. https://doi.org/10.1128/JVI.03645-14
  11. Das T, Hoarau JJ, Bandjee MCJ, Maquart M, Gasque P. Multifaceted innate immune responses engaged by astrocytes, microglia and resident dendritic cells against chikungunya neuroinfection. J Gen Virol. 2015;96:294-310.  https://doi.org/10.1099/vir.0.071175-0
  12. Meshram CD, Lukash T, Philips AT, Akhrymuk I, Frolova EI, Frolov I. Lack of nsP2-specific nuclear functions attenuates chikungunya virus replication both in vitro and in vivo. Virology. 2019;534:14-24.  https://doi.org/10.1016/j.virol.2019.05.016
  13. Burt FJ, Rolph MS, Rulli NE, Mahalingam S, Heise MT. Chikungunya: a re-emerging virus. Lancet. 2012;379(9816):662-671.  https://doi.org/10.1016/S0140-6736(11)60281-X
  14. Weaver SC, Lecuit M. Chikungunya virus and the global spread of a mosquito-borne disease. N Engl J Med. 2015;372:1231-1239. https://doi.org/10.1016/S0140-6736(11)60281-X
  15. Khongwichit S, Chansaenroj J, Thongmee T, Benjamanukul S, Wanlapakorn N, Chirathaworn C, Poovorawan Y. Large-scale outbreak of Chikungunya virus infection in Thailand, 2018—2019. PLoS One. 2021;16(3):e0247314. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0247314.
  16. Arankalle VA, Shrivastava S, Cherian S, Gunjikar RS, Walimbe AM, Jadhav SM, et al. Genetic divergence of Chikungunya viruses in India (1963—2006) with special reference to the 2005—2006 explosive epidemic. J Gen Virol. 2007;88(Pt7):1967-1976. https://doi.org/10.1099/vir.0.82714-0
  17. Patterson J, Sammon M, Garg M. Dengue, Zika and Chikungunya: Emerging Arboviruses in the New World. West J Emerg Med. 2016;17(6):671-679.  https://doi.org/10.5811/westjem.2016.9.30904
  18. Smithburn KC. Semliki Forest virus; propagation of the virus in developing chick embryos. J Immunol. 1946;52:309-314. 
  19. Smithburn KC, Haddow AJ, Mahaffy AF. A Neurotropic Virus Isolated from Aedes Mosquitoes Caught in the Semliki Forest. Am J Trop Med Hyg. 1946;26:189-208.  https://doi.org/10.4269/ajtmh.1946.s1-26.189
  20. Dick GW. Epidemiological notes on some viruses isolated in Uganda; Yellow fever, Rift Valley fever, Bwamba fever, West Nile, Mengo, Semliki forest, Bunyamwera, Ntaya, Uganda S and Zika viruses. Trans R Soc Trop Med Hyg. 1953;47(1):13-48.  https://doi.org/10.1016/0035-9203(53)90021-2
  21. Willems WR, Kaluza G, Boschek GB, Bauer H. Semliki Forest virus: cause of a fatal case of human encephalitis. Science. 1979;203(4385):1127-1129. https://doi.org/10.1126/science.424742
  22. Svyatchenko VA, Nikonov SD, Mayorov AP, Gelfond ML, Loktev VB. Antiviral photodynamic therapy: Inactivation and inhibition of SARS-CoV-2 in vitro using methylene blue and Radachlorin. Photodiagnosis Photodyn Ther. 2021;33:102112. https://doi.org/10.1016/j.pdpdt.2020.102112
  23. Tamura K, Dudley J, Nei M, Kumar S. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) software version 7.0. Mol Biol Evol. 2016;33(7):1870-1874. https://doi.org/10.1093/molbev/msw054
  24. Svyatchenko VA, Ternovoi VA, Lutkovskiy RY, Protopopova EV, Gudymo AS, Danilchenko NV, et al. Human Adenovirus and Influenza A Virus Exacerbate SARS-CoV-2 Infection in Animal Models. Microorganisms. 2023;11:180.  https://doi.org/10.3390/microorganisms11010180
  25. Volk SM, Chen R, Tsetsarkin KA, Adams AP, Garcia TI, Sall AA, et al. Genome-scale phylogenetic analyses of chikungunya virus reveal independent emergences of recent epidemics and various evolutionary rates. J Virol. 2010;84(13):6497-6504. https://doi.org/10.1128/JVI.01603-09
  26. Khan AH, Morita K, Parquet MDC, Hasebe F, Mathenge EGM, Igarashi A. Complete nucleotide sequence of chikungunya virus and evidence for an internal polyadenylation site. J Gen Virol. 2002;83(Pt 12):3075-3084. https://doi.org/10.1099/0022-1317-83-12-3075
  27. Hakim MS, Annisa L, Gazali FM, Aman AT. The origin and continuing adaptive evolution of chikungunya virus. Arch Virol. 2022;167:2443-2455. https://doi.org/10.1007/s00705-022-05570-z
  28. Charrel RN, Leparc-Goffart I, Gallian P, de Lamballerie X. Globalization of Chikungunya: 10 years to invade the world. Clin Microbiol Infect. 2014;20(7):662-663.  https://doi.org/10.1111/1469-0691.12694
  29. Rahman M, Yamagishi J, Rahim R, Hasan A, Sobhan A. East/Central/South African genotype in a Chikungunya outbreak, Dhaka, Bangladesh, 2017. Emerg Infect Dis. 2019;25(2):370.  https://doi.org/10.3201/eid2502.180188

Закрыть метаданные

Связаться с автором
Email
Сообщение

Подтверждение e-mail

На test@yandex.ru отправлено письмо со ссылкой для подтверждения e-mail. Перейдите по ссылке из письма, чтобы завершить регистрацию на сайте.

Подтверждение e-mail

Обратная связь
Если у вас возникли вопросы, жалобы или предложения, — воспользуйтесь формой обратной связи.
Email
Сообщение
Подать заявку

Вы можете стать автором одного из наших журналов, отправьте заявку и мы рассмотрим ее в течении дня.

Имя
Телефон
E-mail
Сообщение
Вход
Регистрация
E-mail
Пароль
Забыли пароль?

Войдите на сайт, используя вашу учетную запись в одном из сервисов

Восстановление пароля
E-mail
Войти
Зарегистрироваться


Мы используем файлы cооkies для улучшения работы сайта. Оставаясь на нашем сайте, вы соглашаетесь с условиями использования файлов cооkies. Чтобы ознакомиться с нашими Положениями о конфиденциальности и об использовании файлов cookie, нажмите здесь.