Хантавирусы в природных популяциях полевок в Сибири

Яшина Л.Н.

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора

ORCID: 0000-0003-2844-7835

Абрамов С.А.

ФГБУН «Институт систематики и экологии животных Сибирского отделения Российской академии наук»

ORCID: 0000-0001-7921-6696

Сметанникова Н.А.

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора

ORCID: 0000-0002-5082-8071

Малышев Б.С.

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора

ORCID: 0000-0003-3004-3020

Дупал Т.А.

ФГБУН «Институт систематики и экологии животных Сибирского отделения Российской академии наук»

ORCID: 0000-0002-4487-1815

Кривопалов А.В.

ФГБУН «Институт систематики и экологии животных Сибирского отделения Российской академии наук»

ORCID: 0000-0003-4824-6061

Хантавирусы в природных популяциях полевок в Сибири

Авторы:

Яшина Л.Н., Абрамов С.А., Сметанникова Н.А., Малышев Б.С., Дупал Т.А., Кривопалов А.В.

Подробнее об авторах

Журнал: Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2023;41(2): 42‑47

DOI: 10.17116/molgen20234102142

Загрузок: 4

Связаться с автором

Оглавление

Как цитировать:

Яшина Л.Н., Абрамов С.А., Сметанникова Н.А., Малышев Б.С., Дупал Т.А., Кривопалов А.В. Хантавирусы в природных популяциях полевок в Сибири. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2023;41(2):42‑47.
Yashina LN, Abramov SA, Smetannikova NA, Malyshev BS, Dupal TA, Krivopalov AV. Hantaviruses in populations of voles in Siberia. Molecular Genetics, Microbiology and Virology. 2023;41(2):42‑47. (In Russ.)
https://doi.org/10.17116/molgen20234102142

Доказательная гастроэнтерология: pro et contra

Актуальные вопросы педиатрической практики

Использование инфографики авторами научных работ

Закрыть метаданные

Рекомендуем статьи по данной теме:

Генетическая вариабельность риккетсий в клещах Dermacentor spp. на территории Западной Сибири и Северного Казахстана. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2023;(3):25-34

Молекулярно-генетический анализ штаммов Vibrio cholerae O1 Эль-Тор, выявленных на территории России в 2023 г.. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2024;(1):34-42

Хантавирусы (род Orthohantavirus, семейство Hantaviridae) широко распространены во многих регионах мира и являются возбудителями двух клинических форм заболевания человека. В последние годы установлена патогенность для человека ортохантавируса Тула, циркулирующего на территории Европы среди обыкновенных полевок (Microtus arvalis).

ЦЕЛЬ РАБОТЫ

Выявление природных очагов циркуляции хантавирусов среди полевок на территории Сибири и их идентификация.

МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ

254 грызуна подсемейства Arvicolinae были отловлены на территории Западной и Восточной Сибири. Образцы были проанализированы методом непрямого иммунофлюоресцентного анализа и обратной транскрипции — полимеразной цепной реакции.

РЕЗУЛЬТАТЫ

Специфические антитела к хантавирусам выявлены у полевок-экономок (Alexandromys oeconomus), темных полевок (Microtus agrestis), узкочерепных полевок (Lasiopodomys gregalis), степных пеструшек (Lagurus lagurus) в Алтайском и Красноярском краях, Томской, Новосибирской областях и Республике Алтай. У сероположительных животных двух видов была обнаружена РНК хантавируса, идентифицированного как вирус Тула. Филогенетический анализ показал, что сибирские РНК изоляты вируса Тула относятся к разным генетическим вариантам, Russia II и Russia III, ассоциированным с узкочерепными полевками и степными пеструшками соответственно.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Наши данные показывают, что ареал вируса Тула на азиатской территории РФ включает Алтайский край, Новосибирскую и Томскую области в Западной Сибири и достигает территории Восточной Сибири (Красноярского края).

Ключевые слова:

хантавирус Тула

полевки

филогенетический анализ

Сибирь

Авторы:

Яшина Л.Н.

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора

ORCID: 0000-0003-2844-7835

Абрамов С.А.

ФГБУН «Институт систематики и экологии животных Сибирского отделения Российской академии наук»

ORCID: 0000-0001-7921-6696

Сметанникова Н.А.

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора

ORCID: 0000-0002-5082-8071

Малышев Б.С.

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора

ORCID: 0000-0003-3004-3020

Дупал Т.А.

ФГБУН «Институт систематики и экологии животных Сибирского отделения Российской академии наук»

ORCID: 0000-0002-4487-1815

Кривопалов А.В.

ФГБУН «Институт систематики и экологии животных Сибирского отделения Российской академии наук»

ORCID: 0000-0003-4824-6061

Дата поступления:

06.04.2023

Дата принятия в печать:

12.04.2023

Список литературы:

Jonsson CB, Figueiredo LT, Vapalahti O. A global perspective on hantavirus ecology, epidemiology, and disease. Clin Microbiol. Rev. 2010;23(2):412-441. https://doi.org/10.1128/CMR.00062-09
Avšič-Županc T, Saksida A, Korva M. Hantavirus infections. Clin Microbiol Infect. 2019;21:6-16. https://doi.org/10.1111/1469-0691.12291
Clement J, Maes P, Lagrou K, Van Ranst M, Lameire N. A unifying hypothesis and a single name for a complex globally emerging infection: hantavirus disease. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2012;31(1):1-5. https://doi.org/10.1007/s10096-011-1456-y
Ткаченко Е.А., Дзагурова Т.К., Ткаченко П.Е. Хантавирусы: экология, молекулярная биология, морфология, патогенез и диагностика хантавирусных инфекций. Молекулярная медицина. 2009;5:36-41.
Hofmann MM, Petraityte-Burneikiene R, Ziller M, Sanauskas K, Friedrich R, Neiderstrasser O et al. Seroprevalence study in forestry workers of a non-endemic region in eastern Germany reveals infection by Tula and Dobrava-Belgrade hantaviruses. Med Microbiol Immunol. 2011;200(4):263-268. https://doi.org/10.1007/s00430-011-0203-4
Zelena H, Mrazek J, Kuhn T. Tula hantavirus in immunocompromised host, Czech Republic. Emerg Infect Dis. 2013;19:1873-1876. https://doi.org/10.3201/eid1911.130421
Reynes JM, Carli D, Boukezia N, Debruyne M, Herti S. Tula hantavirus infection in a hospitalised patient, France, June 2015. Euro Surveill. 2015;20(50):30095. https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2015.20.50.30095
Hofmann J, Kramer S, Herrlinger KR, Jeske K, Kuhns M, Weiss S et al. Tula Virus as Causative Agent of Hantavirus Disease in Immunocompetent Person, Germany. Emerg Infect Dis. 2021;27(4):1234-1237. https://doi.org/10.3201/eid2704.203996
Kruger DH, Figueiredo LT, Song JW, Klempa B. Hantaviruses — globally emerging pathogens. J Clin Virol. 2015;64:128-136. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2014.08.033
Plyusnin A, Vapalahti O, Lankinen H, Lehvaslaiho H, Apekina N, Myasnikov Y, et al. Tula virus: a newly detected hantavirus carried by European common voles. J Virol. 1994;68:7833-7839.
Schmidt-Chanasit J, Essbauer S, Petraityte R, Yoshimatsu K, Tackmann K, Conraths FJ, et al. Extensive host sharing of central European Tula virus. J Virol. 2010;84:459-474. https://doi.org/10.1128/JVI.01226-09
Chen JT, Qin J, Li K, Xu QY, Wang XP, Plyusnin A, et al. Identification and characterization of a novel subtype of Tula virus in Microtus arvalis obscurus voles sampled from Xinjiang, China. Infect Genet Evol. 2019;75:104012. https://doi.org/10.1016/j.meegid.2019.104012
Polat C, Ergünay K, Irmak S, Erdin M, Brinkmann A, Çetintaş O, et al. A novel genetic lineage of Tula orthohantavirus in Altai voles (Microtus obscurus) from Turkey. Infect Genet Evol. 2019;67:150-158. https://doi.org/10.1016/j.meegid.2018.11.015
Plyusnina A, Laakkonen J, Niemimaa J, Henttonen H, Plyusnin A. New Genetic Lineage of Tula Hantavirus in Microtus arvalis obscurus in Eastern Kazakhstan. Open Virol J. 2008;2:32-36. https://doi.org/10.2174/1874357900802010032
Tkachenko EA, Witkowski PT, Radosa L, Dzagurova TK, Okulova NM, Yunicheva YV, et al. Adler hantavirus, a new genetic variant of Tula virus identified in Major’s pine voles (Microtus majori) sampled in southern European Russia. Infect Genet Evol. 2015;29:156-163. https://doi.org/10.1016/j.meegid.2014.11.018
Якименко В.В., Гаранина С.Б., Малькова М.Г., Валицкая А.В., Константинова Г.А., Танцев А.К. и др. Итоги изучения хантавирусов в Западной Сибири. Тихоокеанский медицинский журнал. 2008;2:20-26.
Яшина Л.Н., Зайковская А.В., Протопопова Е.В., Бабкин И.В., Малышев Б.С., Товпинец Н.Н., Евстафьев И.Л. Хантавирус Тула на территории Крыма. Молекулярная генетика микробиол. вирусол. 2015;4:38-41.
Громов И.М., Ербаева М.А. Млекопитающие фауны России и сопредельных территорий. Зайцеобразные и грызуны. СПб.: ЗИН РАН; 1995.
Млекопитающие России: систематико-географический справочник. Под ред. Павлинова И.Я., Лисовского А.А. М.: Товарищество научных изданий КМК; 2012.
Klempa B, Fichet-Calvet E, Lecompte E, Auste B, Aniskin V, Meisel H, et al. Hantavirus in African wood mouse, Guinea. Emerg Infect Dis. 2006;12:838-840. https://doi.org/10.3201/eid1205.051487
Kumar S, Stecher G, Li M, Knyaz C, Tamura K. MEGA X: Molecular Evolutionary Genetics Analysis across Computing Platforms. Mol Biol Evol. 2018;35(6):1547-1549. https://doi.org/10.1093/molbev/msy096
Yashina LN, Abramov SA, Dupal TA, Danchinova GA, Malyshev BS, Hay J, et al. Hokkaido genotype of Puumala virus in the grey red-backed vole (Myodes rufocanus) and northern red-backed vole (Myodes rutilus) in Siberia. Infect Genet Evol. 2015;33:304-313. https://doi.org/10.1016/j.meegid.2015.05.021
Klingström J, Heyman P, Escutenaire S, Sjölander KB, De Jaegere F, Henttonen H, et al. Rodent host specificity of European hantaviruses: evidence of Puumala virus interspecific spillover. J Med Virol. 2002;68(4):581-588. https://doi.org/10.1002/jmv.10232
Jeske K, Hiltbrunner M, Drewes S, Ryll R, Wenk M, Špakova A, et al. Field vole-associated Traemmersee hantavirus from Germany represents a novel hantavirus species. Virus Genes. 2019;55(6):848-853. https://doi.org/10.1007/s11262-019-01706-7
Drewes S, Jeske K, Straková P, Balčiauskas L, Ryll R, Balčiauskienė L, et al. Identification of a novel hantavirus strain in the root vole (Microtus oeconomus) in Lithuania, Eastern Europe. Infect Genet Evol. 2021;90:104520. https://doi.org/10.1016/j.meegid.2020.104520
Thomason AG, Begon M, Bradley JE, Paterson S, Jackson JA. Endemic Hantavirus in Field Voles, Northern England. Emerg Infect Dis. 2017;23(6):1033-1035. https://doi.org/10.3201/eid2306.161607

Закрыть метаданные