АКТУАЛЬНОСТЬ
Вирус кори характеризуется чрезвычайно высокой контагиозностью, поэтому во всем мире предпринимаются огромные усилия по снижению его распространения. Важную роль в снижении распространения кори помимо вакцинации играет ранняя диагностика.
ЦЕЛЬ РАБОТЫ
Разработка набора реагентов для быстрой диагностики кори, основанной на методе петлевой изотермической амплификации (LAMP).
МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ
Множественное выравнивание 696 нуклеотидных последовательностей вируса кори выполнено с помощью программы MAFFT. Экстракцию РНК выполняли с помощью трех наборов реагентов производства ФГБУ «ЦСП» ФМБА России: «АмплиТест РИБО-преп», «АмплиТест Магно-Сорб-Турбо» и «АмплиТест Магно-Сорб-Комбо». Клинические образцы носоглоточного секрета были получены из лаборатории «ЛабКвест» (Москва) в 2024 г.
РЕЗУЛЬТАТЫ
Аналитическая чувствительность набора составила 1000 копий/мл образца, что сопоставимо с чувствительностью метода на основе ОТ-ПЦР. Продемонстрирована возможность проведения анализа с использованием разных наборов для экстракции РНК. Разработанный набор на основе LAMP был протестирован на клиническом материале в сравнении с набором реагентов «АмплиТест Корь». В результате тестирования 50 мазков ротоглотки была показана высокая сходимость результатов (96% конкордатных образцов).
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
Разработанный нами набор реагентов на основе метода ОТ-LAMP для выявления РНК вируса кори обладает аналитическими характеристиками, не уступающими зарегистрированному набору реагентов на основе ОТ-ПЦР, а по скорости проведения реакции намного превосходит его.