Hantaviruses (Hantaviridae) in Republic of Crimea

Yashina L.N.; Zinich L.S.; Smetannikova N.A.; Kartashov M.Yu.; Kovalenko I.S.; Yusupova Z.S.; Konashenko E.V.; Tikhonov S.N.

doi:https://doi.org/10.17116/molgen20244204137

Яшина Л.Н.

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора

ORCID: 0000-0003-2844-7835

Зинич Л.С.

ФГКУЗ «Противочумная станция Республики Крым» Федеральной службы по надзору с сфере защиты прав потребителей и благополучия населения

ORCID: 0000-0002-3447-2335

Сметанникова Н.А.

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора

ORCID: 0000-0002-5082-8071

Карташов М.Ю.

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора

ORCID: 0000-0002-7857-6822

Коваленко И.С.

ORCID: 0000-0003-0057-9836

Юсупова З.С.

ORCID: 0000-0003-1999-4650

Коношенко Е.В.

ORCID: 0009-0005-4074-0753

Тихонов С.Н.

ORCID: 0000-0003-3924-5817

Хантавирусы (Hantaviridae) в Республике Крым

Авторы:

Яшина Л.Н., Зинич Л.С., Сметанникова Н.А., Карташов М.Ю., Коваленко И.С., Юсупова З.С., Коношенко Е.В., Тихонов С.Н.

Подробнее об авторах

Журнал: Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2024;42(4): 37‑42

DOI: 10.17116/molgen20244204137

Прочитано: 601 раз

Связаться с автором

Оглавление

Как цитировать:

Яшина Л.Н., Зинич Л.С., Сметанникова Н.А., и др. Хантавирусы (Hantaviridae) в Республике Крым. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2024;42(4):37‑42.
Yashina LN, Zinich LS, Smetannikova NA, et al. Hantaviruses (Hantaviridae) in Republic of Crimea. Molecular Genetics, Microbiology and Virology. 2024;42(4):37‑42. (In Russ.)
https://doi.org/10.17116/molgen20244204137

Подписка 2026 Молекулярная генетика, микробиология и вирусология (Molecular Genetics, Microbiology and Virology)

Использование инфографики авторами научных работ

Резюме / Abstract:

Хантавирусы (семейство Hantaviridae), широко распространенные в различных регионах мира, являются важными зоонозными патогенами человека. Исследования географического распространения, видового разнообразия хантавирусов и их природных носителей выявили многочисленные виды хантавирусов среди грызунов, насекомоядных и рукокрылых.

ЦЕЛЬ РАБОТЫ

Генетическая идентификация хантавирусов, циркулирующих на территории Республики Крым.

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

Образцы тканей легких от 119 полевок рода Microtus, 66 мышей рода Sylvaemus и 10 насекомоядных рода Crocidura, отловленных на территории Республики Крым в 2021—2023 гг., были исследованы методом иммуноферментного анализа и/или обратной транскрипции — полимеразной цепной реакции, с последующим филогенетическим анализом.

РЕЗУЛЬТАТЫ

РНК хантавирусов выявлена у трех видов животных: обыкновенной полевки (Microtus arvalis формы obscurus), общественной полевки (Microtus socialis) и малой белозубки (Crocidura suaveolens). Филогенетический анализ последовательностей L- и S-сегментов генома показал, что у обыкновенной полевки и общественной полевки обнаружены два разных генетических варианта вируса Тула. Хантавирус, ассоциированный с Crocidura suaveolens и названый вирусом Artesian (ATSV), является предполагаемым новым видом, филогенетически родственным хантавирусам, циркулирующим среди насекомоядных рода Crocidura в Африке.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Патогенный потенциал выявленных хантавирусов не исследован, однако ранее установлено, что филогенетически родственные вирусы могут инфицировать человека.

Ключевые слова / Keywords:

хантавирус

полевки

насекомоядные

филогенетический анализ

Республика Крым

Авторы / Authors:

Яшина Л.Н.

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора

ORCID: 0000-0003-2844-7835

Зинич Л.С.

ORCID: 0000-0002-3447-2335

Сметанникова Н.А.

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора

ORCID: 0000-0002-5082-8071

Карташов М.Ю.

ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора

ORCID: 0000-0002-7857-6822

Коваленко И.С.

ORCID: 0000-0003-0057-9836

Юсупова З.С.

ORCID: 0000-0003-1999-4650

Коношенко Е.В.

ORCID: 0009-0005-4074-0753

Тихонов С.Н.

ORCID: 0000-0003-3924-5817

Дата поступления:

02.09.2024

Дата принятия в печать:

24.09.2024

Закрыть метаданные

Литература / References:

Wolfe N, Dunavan C & Diamond J. Origins of major human infectious diseases. Nature. 2007; 447: 279-283. https://doi.org/10.1038/nature05775
Tkachenko EA, Ishmukhametov AA, Dzagurova TK, Bernshtein AD, Morozov VG, Siniugina AA, et al. Hemorrhagic fever with renal syndrome, Russia. Emerg. Infect. Dis. 2019; 25: 2325-7. https://doi.org/10.3201/eid2512.181649
Иванова А.В., Попов Н.В., Карнаухов И.Г., Чумачкова Е.А. Хантавирусные болезни: обзор эпидемиологической ситуации и эпидемиологических рисков в регионах мира. Проблемы особо опасных инфекций. 2021; (1):23-31. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2021-1-23-31 https://doi.org/10.21055/0370-1069-2021-1-23-31
Hofmann J, Kramer S, Herrlinger KR, Jeske K, Kuhns M, Weiss S et al. Tula Virus as Causative Agent of Hantavirus Disease in Immunocompetent Person, Germany. Emerg. Infect. Dis. 2021; 27(4): 1234-1237. https://doi.org/10.3201/eid2704.203996
Garanina SB, Platonov AE, Zhuravlev VI, Murashkina AN, Yakimenko VV, Korneev AG, Shipulin GA. Genetic diversity and geographic distribution of hantaviruses in Russia. Zoonoses Public Health 2009; 56:297-309. https://doi.org/10.1111/j.1863-2378.2008.01210.x
Klempa B, Tkachenko EA, Dzagurova TK, Yunicheva YV, Morozov VG, Okulova NM et al. Hemorrhagic fever with renal syndrome caused by 2 lineages of Dobrava hantavirus, Russia. Emerg. Infect. Dis. 2008; 14(4):617-25. https://doi.org/10.3201/eid1404.071310
Коваленко И.С., Зинич Л.С., Якунин С.Н., Полуэктова О.А., Раменская О.Ю., Афонина А.Н., Тихонов С.Н. Результаты эпизоотологического мониторинга мелких млекопитающих в Крыму за период 2015—2017 гг. Проблемы особо опасных инфекций. 2018; 2:57-61. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2018-2-57-61
Яшина Л.Н., Зайковская А.В., Протопопова Е.В., Бабкин И.В., Малышев Б.С., Товпинец Н.Н., Евстафьев И.Л. Хантавирус Тула на территории Крыма. Молекулярная генетика микробиол. вирусол. 2015; 4: 38-41
Зинич Л.С., Коваленко И.С., Пидченко Н.Н., Тихонов С.Н. Эпидемиологическая значимость хантавирусной инфекции в Крыму. Проблемы особо опасных инфекций. 2019; 2:69-73. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2019-2-69-73
Yanagihara R, Gu SH, Arai S, Kang HJ, Song JW. Hantaviruses: rediscovery and new beginnings. Virus Res. 2014; 187:6-14. https://doi.org/10.1016/j.virusres.2013.12.038
Klempa B, Fichet-Calvet E, Lecompte E, Auste B, Aniskin V, Meisel H et al. Hantavirus in African wood mouse, Guinea. Emerg. Infect. Dis. 2006; 12: 838-840. https://doi.org/10.3201/eid1205.051487
Tamura K, Peterson D, Peterson N, Stecher G, Nei M, Kumar S. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol. Biol. Evol. 2011; 28(10):2731-9. https://doi.org/10.1093/molbev/msr121
Яшина Л.Н., Абрамов С.А., Сметанникова Н.А., Малышев Б.С., Дупал Т.А., Кривопалов А.В. Хантавирусы в природных популяциях полевок в Сибири. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2023;41(2):42-47. https://doi.org/10.17116/molgen20234102142
Tkachenko EA, Witkowski PT, Radosa L, Dzagurova TK, Okulova NM, Yunicheva YV et al. Adler hantavirus, a new genetic variant of Tula virus identified in Major’s pine voles (Microtus majori) sampled i n southern European Russia. Infect. Gene.t Evol. 2015; 29: 156-163. https://doi.org/10.1016/j.meegid.2014.11.018
Klempa B, Fichet-Calvet E, Lecompte E, Auste B, Aniskin V, Meisel H et al. Novel hantavirus sequences in Shrew, Guinea. Emerg Infect Dis. 2007; 13(3):520-2. https://doi.org/10.3201/eid1303.061198
Gu SH, Nicolas V, Lalis A, Sathirapongsasuti N, Yanagihara R. Complete genome sequence and molecular phylogeny of a newfound hantavirus harbored by the Doucet’s musk shrew (Crocidura douceti) in Guinea. Infect. Gene.t Evol. 2013; 20:118-23. https://doi.org/10.1016/j.meegid.2013.08.016
Kang HJ, Kadjo B, Dubey S, Jacquet F, Yanagihara R. Molecular evolution of Azagny virus, a newfound hantavirus harbored by the West African pygmy shrew (Crocidura obscurior) in Côte d’Ivoire. Virol. J. 2011; 8:373. https://doi.org/10.1186/1743-422X-8-373
Arai S, Gu SH, Baek LJ, Tabara K, Bennett SN, Oh HS, et al. Divergent ancestral lineages of newfound hantaviruses harbored by phylogenetically related crocidurine shrew species in Korea. Virology 2012; 424(2):99-105. https://doi.org/10.1016/j.virol.2011.11.013
Schmidt-Chanasit J, Essbauer S, Petraityte R, Yoshimatsu K, Tackmann K, Conraths FJ, et al. Extensive host sharing of central European Tula virus. J. Virol. 2010; 84: 459-474. https://doi.org/10.1128/JV1.01226-09
Polat C, Ergünay K, Irmak S, Erdin M, Brinkmann A, Çetintaş O, et al. A novel genetic lineage of Tula orthohantavirus in Altai voles (Microtus obscurus) from Turkey. Infect. Genet. Evol. 2019; 67:150-158. https://doi.org/10.1016/j.meegid.2018.11.015
Plyusnina A, Laakkonen J, Niemimaa J, Henttonen H, Plyusnin A. New Genetic Lineage of Tula Hantavirus in Microtus arvalis obscurus in Eastern Kazakhstan. Open Virol. J. 2008; 2: 32-36. https://doi.org/10.2174/1874357900802010032
Chen JT, Qin J, Li K, Xu QY, Wang XP, Plyusnin A, et al. Identification and characterization of a novel subtype of Tula virus in Microtus arvalis obscurus voles sampled from Xinjiang, China. Infect. Genet. Evol. 2019; 75:104012. https://doi.org/10.1016/j.meegid.2019.104012
Heinemann P, Tia M, Alabi A, Anon JC, Auste B, Essbauer S, et al. Human Infections by Non-Rodent-Associated Hantaviruses in Africa. J. Infect. Dis. 2016; 214(10):1507-1511. https://doi.org/10.1093/infdis/jiw401