В последнее время все большее внимание уделяется поиску потенциальных биомаркеров для диагностики и прогнозирования течения демиелинизирующих заболеваний ЦНС. Одним из наиболее распространенных заболеваний в этой группе, поражающим преимущественно лиц молодого возраста, является рассеянный склероз (РС). Гетерогенная и комплексная патофизиология с различными вариантами течения делает это заболевание уникальным в каждом случае. Гетерогенность обусловлена наличием в развитии РС как воспалительного, так и нейродегенеративного компонентов, конкурирующих между собой и вызывающих изменения как в иммунной системе, так и в глиальном/невральном ответе на повреждение. Наличие биомаркеров, являющихся индикаторами отдельных звеньев патогенеза, позволило бы оценить течение заболевания, переход из ремиттирующего во вторично-прогрессирующий тип течения, выбор и ответ на проводимую терапию и осложнения в виде оппортунистических инфекций. На сегодняшний день в клинической практике широко используются определение олигоклональных антител, индекса иммуноглобулина класса G, антител к аквапорину-4, вирусам кори, краснухи, ветряной оспы и JC-вирусу в цереброспинальной жидкости, что значительно облегчает постановку диагноза Р.С. При этом по-прежнему остается дискутабельным вопрос определения биомаркеров, позволяющих оценить процессы ремиелинизации и нейродегенерации, в том числе охарактеризовать и спрогнозировать неуклонное прогрессирующее течение заболевания с нарастанием морфологических и клинических проявлений. Появляется все больше исследований, посвященных этой теме, рассматривающих от легких и тяжелых цепей нейрофиламентов, различных протеинов до малых некодирующих молекул РНК (микроРНК). В этой работе мы постарались оценить последние научные разработки в определении потенциальных молекулярных биомаркеров и привести собственный опыт.