Tag SNP rs3135388 гена HLA-DRB1*1501 как генетический фактор риска рассеянного склероза в Республике Башкортостан

Роль полиморфизма гена HLA-DRB1*1501 в формировании наследственной предрасположенности к РС в популяциях жителей Западной Европы была обоснована результатами полногеномных скринингов, проведенных участниками Международного консорциума генетики рассеянного склероза (Multiple Sclerosis Genetics Consortium — IMSGC). Полагают, что полиморфизм гена HLA-DRB1*1501 может вносить вклад в развитие рассеянного склероза (РС), но необходима репликация результатов анализа этого гена в популяциях разных народов. Материал и методы. Для выявления генетических вариантов подверженности заболеванию РС мы исследовали tagSNP rs3135388 HLA-DRB1*1501 (tagging single nucleotide polymorphisms; полиморфизм, аллельные варианты которых маркируют гаплотипические блоки). Обследованы группа больных РС (n=233) и контрольная группа, аналогичная по полу и возрасту (n=341), в популяции русских, проживающих в Республике Башкортостан. Генотипирование проводилось методом полимеразной цепной реакции с гибридизационно-флуоресцентной детекцией в режиме реального времени. Проведен анализ ассоциаций полиморфного локуса гена HLA-DRВ1 rs3135388 с риском развития РС. Результаты и заключение. Выявлено, что шансы развития заболевания повышены у носителей генотипа HLA-DRВ1*С/Т (OR=1,71, р=0,015) и понижены у носителей генотипа HLA-DRВ1*С/С (OR=0,57, p=0,008). Таким образом, впервые в Республике Башкортостан проведено исследование полиморфного локуса tag SNP rs3135388 гена HLA-DRB1*1501, установлена статистически значимая ассоциация данного локуса, локализованного на 6-й хромосоме в области 6p.21.3 (MS, MIM 126200) с развитием Р.С. Для лицс генотипомrs3135388С/*Т риск развития РС повышен 2,5 раза. Значимость полиморфного локуса rs3135388С гена HLA-DRВ1 была проанализирована в системемежгенных взаимодействий с использованием ранее полученных данных о распределении частот генотипов полиморфных локусов генов цитокиновой сети IL2 (4463A>G, rs 2069772), IL2RA (39504 (73) I/D, rs 12722580), IL7R (598 (5) I/D, rs 10624573) в группе больных РС и в контрольной группе. В результате было установлено, что предрасполагают к развитию РС и у мужчин и у женщин сочетания аллелей и генотипов IL2R*D+IL7R*I+HLA-DRB1*C/T (р=0,042, OR=2,37), IL2R*D+IL2*A+HLA-DRB1*T/T(р=0,045, OR=1,97).