Преимущество капиллярного электрофореза при диагностике болезни Гентингтона

Хорея Гентингтона (HD) — генетическое заболевание нервной системы, характеризующееся постепенным началом обычно в возрасте 30—50 лет и сочетанием прогрессирующего хореического гиперкинеза и психических расстройств. Нарушение, приводящее к развитию хореи Гентингтона, заключается в увеличении числа (экспансии) тринуклеотидных CAG-повторов в гене IT-15. Открытие гена HD и обнаружение ассоциации длины CAG-повторов с риском развития заболевания сделали возможным молекулярно-генетическое тестирование данного заболевания. Подтверждение присутствия нормального аллеля или обнаружение увеличенного числа CAG-повторов, связанных с HD, имеет большое значение для тактики ведения больного и прогноза потомства в семье. Это обусловлено тем, что разница между нормальной аллелью и, которая вызывает заболевание, может составлять один повтор. Точное определение число CAG-повторов в гене HD является технически сложным и трудным для интерпретации, особенно если они находятся в так называемой «серой зоне» (между 27 и 39 повторами). Так же при обнаружение гомозиготного аллеля нормальной длины необходимо исключить вероятность того, что увеличенный аллель не был идентифицирован с помощью ПЦР. Решением этой проблемы является использование праймеров один, из которых флюоресцентно-мечен, и содержит пять CAG-повторов. При использовании такого праймера в результате ПЦР получаются разного размера ампликоны из-за множественных сайтов отжига. Такой подход позволяет легко определить истинную гомозиготу по отсутствию повторяющихся пиков и дает возможность использовать повторяющиеся пики в качестве аллельной лестницы для точного определения количества CAG-повторов. Исследуемую группу составили 20 пациентов с ранее проведенной молекулярно-генетической диагностикой методом ПЦР и визуализацией результатов в акриламидном геле в лаборатории медицинской генетики ФГБУ «Ростовский НИИ акушерства и педиатрии» с 2002 по 2016 гг. В качестве биологического материала для исследования использовалась геномная ДНК, выделенная из лейкоцитов периферической крови. Во всех образцах ДНК проводили прямое определение количества CAG-повторов в гене IT15 с использованием полимеразной цепной реакции (ПЦР) и капиллярного электрофореза на ДНК анализаторе ABI PRISM 3130 («Applied Biosystems»). В качестве размерного стандарта использовали S-450 («ГОРДИС», Россия). Было уточнено количество CAG-повторов (разница составила до трех повторов). В одном случае была подтверждена нормальная гомозигота. И в одном случае было установлено 15 и 19 повторов, когда с помощью акриламидного геля была определена гомозигота. Таким образом, использование капиллярного электрофореза повышает точность диагностики хореи Гентингтона.