Микрюкова Т.П.
ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора
Протопопова Е.В.
ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора
Межевалова А.С.
ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора
Баяндин Р.Б.
ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора
Хорошавин Ю.А.
ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора
Швалов А.Н.
ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора
Таранов О.С.
ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора
Трегубчак Т.В.
ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора
Терновой В.А.
ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора
Локтев В.Б.
ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора;
ФГАОУ ВО «Новосибирский национальный исследовательский государственный университет»;
ФГБУН «ФИЦ "Институт цитологии и генетики СО РАН"»
Исторические изоляты вирусов леса Семлики и чикунгунья, их вирусологическая характеризация, полногеномные последовательности и филогения
Журнал: Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2023;41(4): 38‑44
Просмотров: 405
Загрузок: 1
Как цитировать:
Микрюкова Т.П., Протопопова Е.В., Межевалова А.С., Баяндин Р.Б., Хорошавин Ю.А., Швалов А.Н., Таранов О.С., Трегубчак Т.В., Терновой В.А., Локтев В.Б. Исторические изоляты вирусов леса Семлики и чикунгунья, их вирусологическая характеризация, полногеномные последовательности и филогения. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология.
2023;41(4):38‑44.
Mikryukova TP, Protopopova EV, Mezhevalova AS, Bayandin RB, Khoroshavin YuA, Shvalov AN, Taranov OS, Tregubchak TV, Ternovoi VA, Loktev VB. Historical isolates of Semliki forest and chikungunya viruses, their virological characterization, genome sequences and phylogeny. Molecular Genetics, Microbiology and Virology. 2023;41(4):38‑44. (In Russ.)
https://doi.org/10.17116/molgen20234104138
Цель исследования состояла в исследовании изолятов альфавирусов, изолированных в Уганде и Танзании в период, предшествующий их глобальному распространению и относящихся к середине прошлого века. Мы предполагали, что анализ их геномов позволит уточнить особенности и направленность молекулярной эволюции альфавирусов в современных условиях.
Архивные образцы вирусов чикунгунья (CHIKV) и леса Семлики (SFV) были восстановлены культивированием на клетках Vero E6. Изоляты идентифицировались методом ОТ-ПЦР с последующим секвенированием. Полногеномные последовательности определяли NGS-секвенированием и использовали для филогенетического анализа.
Идентифицировано наличие в исследуемом архивном образце CHIKV двух представителей рода Alphavirus, а именно CHIKV и SFV. В архивном образце 1942 г. был обнаружен только SFV. Все изоляты оказались способны высокоэффективно реплицироваться на клеточных культурах C6/36, Vero E6, 293 и СПЭВ с развитием цитопатогенного действия и вызывать патоморфологические изменения у мышей, характерные для этих альфавирусов. Определены их полногеномные последовательности и проведен их анализ. Выделенные изоляты кластеризуются с типичными африканскими штаммами CHIKV и SFV. Эти изоляты могут быть отнесены к старейшим известным штаммам SFV и CHIKV, датируемыми 1942 и 1953 годами, сохранившимися в лабораторных коллекциях. Архивный изолят CHIKV генотипируется как ECSA-вариант, с современными представителями которого ассоциируется глобальное распространение CHIKV и возникновение крупных вспышек лихорадки чикунгунья в последние десятилетия.
Изоляты вирусов леса Семлики и чикунгунья восстановлены из архивных лабораторных образцов, предположительно датируемых 1942 и 1953 годами, проведена их вирусологическая характеризация, генотипирование и анализ их полногеномных последовательностей.
Ключевые слова:
Авторы:
Микрюкова Т.П.
ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора
Протопопова Е.В.
ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора
Межевалова А.С.
ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора
Баяндин Р.Б.
ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора
Хорошавин Ю.А.
ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора
Швалов А.Н.
ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора
Таранов О.С.
ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора
Трегубчак Т.В.
ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора
Терновой В.А.
ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора
Локтев В.Б.
ФБУН «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"» Роспотребнадзора;
ФГАОУ ВО «Новосибирский национальный исследовательский государственный университет»;
ФГБУН «ФИЦ "Институт цитологии и генетики СО РАН"»
Дата поступления:
19.06.2023
Дата принятия в печать:
24.10.2023
Список литературы:
Закрыть метаданные
Подтверждение e-mail
На test@yandex.ru отправлено письмо со ссылкой для подтверждения e-mail. Перейдите по ссылке из письма, чтобы завершить регистрацию на сайте.
Подтверждение e-mail
Войдите на сайт, используя вашу учетную запись в одном из сервисов
Мы используем файлы cооkies для улучшения работы сайта. Оставаясь на нашем сайте, вы соглашаетесь с условиями использования файлов cооkies. Чтобы ознакомиться с нашими Положениями о конфиденциальности и об использовании файлов cookie, нажмите здесь.