Дерегуляция эпигенетических механизмов играет роль в развитии рака кожи. Выявление ее причин в предраке и карциномах позволит расширить представления о взаимозависимости состояний и мишенях для терапии.

ЦЕЛЬ ИССЛЕДОВАНИЯ

Определить спектр соматических мутаций генов эпигенетических регуляторов в эпителиальных опухолях кожи — базально-клеточной карциномы (БКР), плоскоклеточного рака (ПКР) и актинического кератоза (АК).

МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ

В исследование включено 769 образцов. Высокопроизводительное параллельное секвенирование ДНК выполняли с использованием 3 панелей, включающих 5 генов — PIK3CA, CDKN2A, CDH1, TP53, PTEN и 25 генов ремоделирования хроматина.

РЕЗУЛЬТАТЫ

Во внутренней когорте в БКР встречали альтерации в генах KMT2D (47,0%), EZH2 (42,0%), TP53 (37,0%) и HDAC2 (32,0%), в ПКР — мутации в гене CDKN2A в 61,0% случаев, в гене TP53 — в 56,0%, в генах EZH2 и PBRM1 — в 44,0 и 28,0%. В АК в 40,0% случаев наблюдали мутации в генах PIK3CA и TP53. Мутации обнаружены в генах гистоновых модификаторов типа «писатели» и кофакторов гистоновых модификаторов типа «писатели». Во внутренней выборке обнаружены различия частот мутаций в генах между АК и БКР (p-value 0,0001), АК и ПКР (p-value 0,04). Во внешней когорте более высокая частота мутаций в БКР по сравнению с ПКР наблюдалась в генах ремоделирования хроматина, кофакторов модификации гистонов и гистоновых модификаторов типа «стиратели» (p-value 0,01, 0,007 и 0,003 соответственно). В АК зарегистрировано больше мутаций в группе гистоновых модификаторов типа «стиратели» по сравнению с ПКР (p-value 0,01).

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Выявлены высокая частота соматических мутаций разных типов генов эпигенетической регуляции и различия в вовлеченности групп генов эпигенетических регуляторов между АК и ПКР, АК и БКР.